198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7552 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  578  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  50 
 
 		 283 aa  262  4.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  45.91 
 
 		 287 aa  237  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  47.35 
 
 		 282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  43.25 
 
 		 285 aa  231  9e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  45.71 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 282 aa  225  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  43.31 
 
 		 285 aa  223  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  43.88 
 
 		 289 aa  223  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 291 aa  222  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  42.2 
 
 		 291 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  43.31 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  43.21 
 
 		 289 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  43.71 
 
 		 410 aa  215  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0579  transcriptional regulator, XRE family  48.77 
 
 		 290 aa  215  7e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  40.81 
 
 		 293 aa  215  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  42.4 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  40.99 
 
 		 288 aa  212  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  41.99 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.44 
 
 		 284 aa  210  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  43.8 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  42.4 
 
 		 303 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  43.11 
 
 		 288 aa  208  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  40.44 
 
 		 293 aa  207  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  43.36 
 
 		 284 aa  207  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.85 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  41.16 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  40.85 
 
 		 291 aa  206  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  40.78 
 
 		 284 aa  205  6e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2232  hypothetical protein  43.53 
 
 		 295 aa  205  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0989029  normal  0.199583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  44.29 
 
 		 295 aa  205  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  43.21 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4270  helix-turn-helix domain protein  44.98 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1005  transcriptional regulator, XRE family  42.3 
 
 		 309 aa  201  9e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  42.81 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  42.44 
 
 		 292 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 292 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  42.2 
 
 		 287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  43.16 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  40.78 
 
 		 290 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  43.08 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4152  helix-turn-helix domain protein  41.7 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  42.4 
 
 		 285 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1277  helix-turn-helix domain protein  43.01 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  44.09 
 
 		 278 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  41.85 
 
 		 280 aa  189  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  41.85 
 
 		 280 aa  189  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3623  helix-turn-helix domain-containing protein  40.7 
 
 		 290 aa  186  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  38.52 
 
 		 287 aa  185  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5627  hypothetical protein  41.81 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  37.5 
 
 		 283 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 284 aa  183  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2207  transcriptional regulator, XRE family  36.18 
 
 		 328 aa  182  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal  0.596706 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  38.97 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.27 
 
 		 281 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  39.34 
 
 		 299 aa  172  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.22 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  38.2 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  35.69 
 
 		 285 aa  170  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4058  hypothetical protein  40.5 
 
 		 287 aa  169  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.174475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  35.25 
 
 		 282 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4158  hypothetical protein  49.15 
 
 		 212 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5762  helix-turn-helix domain-containing protein  34.84 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  37.1 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0512  helix-turn-helix domain-containing protein  39.77 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  36.82 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5053  helix-turn-helix domain protein  37.81 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.983736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6313  hypothetical protein  37.76 
 
 		 294 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.637076  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0090  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39 
 
 		 283 aa  159  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0030  helix-turn-helix domain protein  38.43 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4578  transcriptional regulator, XRE family  35.25 
 
 		 290 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.69 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  34.04 
 
 		 279 aa  155  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1835  helix-turn-helix domain protein  34.15 
 
 		 284 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660299  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  35.74 
 
 		 281 aa  152  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  35.25 
 
 		 286 aa  152  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0442  helix-turn-helix domain protein  36.49 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2602  helix-turn-helix domain-containing protein  34.36 
 
 		 295 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0577635  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5238  helix-turn-helix domain protein  35.66 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000759311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8469  transcriptional regulator, XRE family  36.95 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  33.11 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4681  transcriptional regulator, XRE family  33.57 
 
 		 278 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.52911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37910  hypothetical protein  35.59 
 
 		 308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.281107 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  36.43 
 
 		 286 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0178303  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 288 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.116487 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1300  helix-turn-helix domain-containing protein  36.11 
 
 		 293 aa  142  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.61958  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0089  hypothetical protein  36.65 
 
 		 276 aa  142  9e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4490  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.678881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1349  hypothetical protein  35.42 
 
 		 293 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6434  helix-turn-helix domain protein  30.43 
 
 		 279 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147514  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3648  transcriptional regulator, XRE family  33.81 
 
 		 283 aa  135  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2430  transcriptional regulator, XRE family  30.96 
 
 		 276 aa  135  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1351  putative DNA-binding protein  35.42 
 
 		 299 aa  133  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298494  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1472  hypothetical protein  34.93 
 
 		 287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14260  Helix-turn-helix protein  32.14 
 
 		 291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0644  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 297 aa  132  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>