27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7532 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7532  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  397  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.172735  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10760  hypothetical protein  63.24 
 
 
214 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.729368  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1887  hypothetical protein  55.83 
 
 
208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16890  hypothetical protein  50.96 
 
 
208 aa  192  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144675  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1086  hypothetical protein  55.56 
 
 
206 aa  182  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4235  hypothetical protein  53.4 
 
 
216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.853215  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1411  hypothetical protein  53.4 
 
 
202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.466513  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1177  hypothetical protein  44.76 
 
 
209 aa  131  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0707692 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0839  hypothetical protein  38.5 
 
 
211 aa  109  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4128  uridine kinase  31.94 
 
 
230 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.229142  normal  0.752795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6545  uridine kinase  31.19 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0840301  normal  0.0502519 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1566  uridine kinase  28.11 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.200961  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4970  uridine kinase  31.71 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.552464 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2850  uridine kinase  26.16 
 
 
220 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00158944  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2538  phosphoribulokinase / uridine kinase family  38.16 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.551598 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2788  uridine kinase  23 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2709  uridine kinase  31.92 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal  0.385847 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3079  uridine kinase  23.47 
 
 
223 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3064  uridine kinase  22.07 
 
 
223 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2856  uridine kinase  23 
 
 
223 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0026  uridine kinase  29.5 
 
 
234 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777234  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3070  uridine kinase  23 
 
 
223 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2828  uridine kinase  23 
 
 
223 aa  60.5  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2980  uridine kinase  27.23 
 
 
250 aa  58.9  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2183  uridine kinase  21.96 
 
 
221 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.630907  normal  0.666717 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2644  putative kinase  32.56 
 
 
164 aa  48.9  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2745  hypothetical protein  41.1 
 
 
154 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.102192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>