79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7432 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  100 
 
 
516 aa  1035    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  83.28 
 
 
551 aa  554  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  34.67 
 
 
510 aa  228  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  58.94 
 
 
648 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  47.7 
 
 
680 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  33.63 
 
 
360 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  33.63 
 
 
360 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  33.03 
 
 
360 aa  147  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  33.33 
 
 
360 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  33.33 
 
 
360 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  32.43 
 
 
360 aa  144  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  32.43 
 
 
360 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  52.94 
 
 
490 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1478  extracellular exochitinase Chi36  32.13 
 
 
360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17366  hitchhiker  0.000283046 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3775  extracellular exochitinase Chi36  32.43 
 
 
360 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  34.59 
 
 
1362 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1459  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  52.26 
 
 
261 aa  139  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2490  Carbohydrate-binding CenC domain protein  57.58 
 
 
526 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  54.96 
 
 
763 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  54.96 
 
 
591 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  55.04 
 
 
460 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  30.45 
 
 
846 aa  116  7.999999999999999e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  29.36 
 
 
420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  30.6 
 
 
492 aa  111  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  30.4 
 
 
551 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4053  glycoside hydrolase family 18  29.71 
 
 
376 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 
1578 aa  110  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  30.99 
 
 
846 aa  110  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  30.24 
 
 
846 aa  110  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  30.65 
 
 
848 aa  109  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  33.33 
 
 
543 aa  103  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  28.53 
 
 
699 aa  102  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  47.93 
 
 
597 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  28.39 
 
 
565 aa  97.4  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  28.3 
 
 
729 aa  97.1  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  28.3 
 
 
729 aa  97.1  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  28.74 
 
 
341 aa  95.1  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  27.53 
 
 
727 aa  93.6  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  29.45 
 
 
471 aa  91.3  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  27.95 
 
 
613 aa  90.9  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  29.18 
 
 
471 aa  90.1  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  27.97 
 
 
484 aa  87.4  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  26.83 
 
 
483 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  27.72 
 
 
483 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3736  chitinase D  36.14 
 
 
174 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61469e-18 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  25.83 
 
 
598 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3568  glycosyl hydrolase family chitinase  26.14 
 
 
353 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  25.91 
 
 
468 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  26.77 
 
 
803 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3165  Ricin B lectin  40.56 
 
 
2031 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  27.78 
 
 
467 aa  67  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl347  chitinase  25.77 
 
 
1113 aa  66.6  0.0000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135445  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1121  hypothetical protein  26.67 
 
 
782 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1117  hypothetical protein  27.62 
 
 
782 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3735  extracellular exochitinase Chi36  30.6 
 
 
189 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.72466e-18 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2016  hypothetical protein  29.71 
 
 
313 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.630199  normal  0.0408186 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  28.62 
 
 
521 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11063  class III chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03850)  25.15 
 
 
305 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.111184 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  29.23 
 
 
373 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03860  chitinase, putative  32.12 
 
 
827 aa  52.8  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  51.02 
 
 
1281 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  29.55 
 
 
1051 aa  49.3  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1631  carbohydrate-binding protein  31.52 
 
 
606 aa  47.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277335  normal  0.43488 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50155  chitinase chitin binding glycoside hydrolase family 1  26.74 
 
 
525 aa  47.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.487357  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0528  hypothetical protein  62.16 
 
 
431 aa  47  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1281  hypothetical protein  60.53 
 
 
430 aa  47  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.197658 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4407  hypothetical protein  31.88 
 
 
245 aa  46.6  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  34.45 
 
 
1024 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3707  transglutaminase domain-containing protein  50 
 
 
876 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  24.24 
 
 
639 aa  45.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  56.25 
 
 
433 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1598  hypothetical protein  58.97 
 
 
675 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000695683  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  25.88 
 
 
634 aa  44.3  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0830  redoxin domain-containing protein  42.42 
 
 
329 aa  44.3  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  29.45 
 
 
1115 aa  44.3  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  26 
 
 
1782 aa  43.9  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01990  hypothetical protein  24.15 
 
 
582 aa  43.9  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  53.19 
 
 
628 aa  43.9  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  23.91 
 
 
372 aa  43.5  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>