More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7395 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7395  patatin  100 
 
 		 277 aa  547  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2490  Patatin  63.7 
 
 		 294 aa  301  6.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6465  patatin  62.99 
 
 		 286 aa  284  9e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0920236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  55 
 
 		 277 aa  273  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3682  patatin  53.15 
 
 		 276 aa  246  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4059  patatin  51.97 
 
 		 276 aa  246  4e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.447897  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0014  patatin  50.94 
 
 		 290 aa  226  4e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0074  Patatin  40.51 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  36.43 
 
 		 313 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  36.9 
 
 		 291 aa  139  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  37.66 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  34.44 
 
 		 294 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2789  patatin  34.07 
 
 		 308 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  35.17 
 
 		 310 aa  126  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  36.32 
 
 		 306 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  36.32 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  32.72 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2085  patatin  37.41 
 
 		 314 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  39.82 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0501  patatin  31.23 
 
 		 293 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4848  patatin  34.62 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.939066 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  37.91 
 
 		 323 aa  105  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4861  patatin  31.43 
 
 		 332 aa  105  9e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2824  Patatin  35.53 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.701199  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  34.21 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  38.74 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  39.15 
 
 		 322 aa  98.2  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  36.84 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0161  cyclic nucleotide-binding protein  37.36 
 
 		 583 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102095  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  32.98 
 
 		 327 aa  94.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  28.68 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3270  patatin  37.84 
 
 		 390 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1650  patatin  39.55 
 
 		 347 aa  92.8  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  37.43 
 
 		 315 aa  92.4  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  37.43 
 
 		 315 aa  92.4  7e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  28.93 
 
 		 343 aa  92.4  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  37.14 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2155  patatin  37.3 
 
 		 345 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0598189 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  31.94 
 
 		 250 aa  91.3  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0303  patatin  34.86 
 
 		 314 aa  90.9  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0052982  hitchhiker  0.00220393 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  37.91 
 
 		 327 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  31.49 
 
 		 386 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  31.22 
 
 		 324 aa  90.5  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1691  patatin  31.34 
 
 		 318 aa  89.7  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0353  Patatin  35 
 
 		 321 aa  89  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016762 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1324  patatin  36.16 
 
 		 348 aa  89  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  29.52 
 
 		 250 aa  89  9e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2160  patatin  34.43 
 
 		 314 aa  88.2  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18662  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  34.98 
 
 		 315 aa  88.2  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3892  Patatin  37.16 
 
 		 343 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1978  hypothetical protein  35.84 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  30.24 
 
 		 378 aa  87  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0018  patatin  31.67 
 
 		 266 aa  87  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1851  Patatin  37.36 
 
 		 320 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202121  normal  0.0299677 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  33.15 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2051  Patatin  37.71 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1553  Patatin  36.07 
 
 		 317 aa  86.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4598  cyclic nucleotide-binding protein  35.27 
 
 		 581 aa  85.9  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0649502  normal  0.461096 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3127  patatin  39.44 
 
 		 344 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  29.94 
 
 		 251 aa  85.9  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2662  patatin  34.41 
 
 		 368 aa  85.5  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.31003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0621  patatin  30.93 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5123  Patatin  34.76 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  35.16 
 
 		 298 aa  85.1  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1793  patatin  32.98 
 
 		 343 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.810977 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15960  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  36.31 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  34.67 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3110  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.58 
 
 		 748 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185086  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  29.15 
 
 		 332 aa  83.6  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  35.33 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  27.67 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  33.51 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  34.21 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2928  putative patatin-like phospholipase  34.43 
 
 		 317 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793052  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1382  Patatin  34.91 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.169979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  30 
 
 		 346 aa  82.4  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2279  hypothetical protein  34.1 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.223441  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  30 
 
 		 346 aa  82.4  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  34.46 
 
 		 343 aa  82  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  28.09 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.12 
 
 		 763 aa  82  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0830  Patatin  31.07 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00263851  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  30.65 
 
 		 746 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0681  patatin-like phospholipase family protein  31.07 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0334  patatin  30.77 
 
 		 279 aa  81.3  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.976534  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  32.22 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1383  hypothetical protein  30.73 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.117761  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01210  hypothetical protein  30.73 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.287845  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2415  Patatin  30.73 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1719  hypothetical protein  30.73 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00963629  normal  0.824632 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  34.07 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1342  hypothetical protein  30.73 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00416031  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.46 
 
 		 765 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  30.35 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01220  hypothetical protein  30.73 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.237609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2393  hypothetical protein  30.73 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000191972 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1399  hypothetical protein  30.73 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1907  hypothetical protein  30.73 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163252  normal  0.264575 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02066  Alpha-beta superfamily hydrolase  32.47 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1647  patatin  32.78 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>