More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7288 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7288  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
249 aa  484  1e-136  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.767574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3333  transcriptional regulator, GntR family  48.76 
 
 
253 aa  216  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7380  putative transcriptional regulator, GntR family  48.16 
 
 
251 aa  201  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
244 aa  109  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2101  transcriptional regulator, GntR family  37.97 
 
 
254 aa  104  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.608039  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0773  GntR family transcriptional regulator  33.89 
 
 
241 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 
261 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  34.55 
 
 
261 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  32.62 
 
 
243 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  28.14 
 
 
232 aa  100  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 
256 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
256 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
256 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
247 aa  99  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 
256 aa  98.6  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  33.48 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
249 aa  96.3  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 
256 aa  95.9  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
256 aa  95.5  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  28.43 
 
 
235 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  28.43 
 
 
235 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  31.76 
 
 
243 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  35.22 
 
 
241 aa  92.4  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 
233 aa  92.8  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
249 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 
248 aa  92  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
240 aa  91.3  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  26.84 
 
 
232 aa  91.3  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  31.14 
 
 
249 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
249 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2988  histidine utilization repressor  30.62 
 
 
241 aa  90.1  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  33.92 
 
 
247 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  33.48 
 
 
277 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4125  transcriptional regulator, GntR family  32.49 
 
 
240 aa  89.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4012  transcriptional regulator, GntR family  32.49 
 
 
240 aa  89.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696075  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
257 aa  89  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
247 aa  89  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
235 aa  88.6  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  28.63 
 
 
252 aa  87.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  31.91 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5417  transcriptional regulator, GntR family  35.05 
 
 
271 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
264 aa  87.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  33.19 
 
 
255 aa  87.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
256 aa  86.7  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  30.74 
 
 
247 aa  87  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1359  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 
249 aa  87  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.516922 
 
 
-
 
NC_003296  RS03035  transcription regulator protein  31.65 
 
 
240 aa  86.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.838829  normal  0.141117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5259  transcriptional regulator, GntR family  35.37 
 
 
254 aa  85.5  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1330  transcriptional regulator, GntR family  24.46 
 
 
240 aa  85.5  7e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  32.47 
 
 
249 aa  85.5  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
257 aa  85.1  9e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
257 aa  85.1  9e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1234  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.22 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.550496  normal  0.0276711 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
225 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  26.72 
 
 
234 aa  84.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  30.34 
 
 
260 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
248 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 
238 aa  83.2  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  34.22 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2751  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  27.47 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 
267 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0198  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
260 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1857  transcriptional regulator, GntR family  29.13 
 
 
242 aa  82  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0189  GntR family transcriptional regulator  29.31 
 
 
260 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08770  transcriptional regulator, GntR family  28.09 
 
 
244 aa  82  0.000000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000139729  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 
232 aa  82  0.000000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2799  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 
243 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.726282  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00770  transcriptional regulator, GntR family  30.74 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4668  transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 
250 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.623971  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1294  GntR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
243 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.014181  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  34.53 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  30.91 
 
 
239 aa  81.6  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0178  GntR family transcriptional regulator  28.88 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.516335 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  27.2 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1621  GntR family transcriptional regulator  25.69 
 
 
239 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00823964  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  33.94 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1926  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
240 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  27.83 
 
 
239 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>