20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7276 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7276  hypothetical protein  100 
 
 
475 aa  956    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209812  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4668  hypothetical protein  31.7 
 
 
425 aa  150  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0163  hypothetical protein  34.53 
 
 
505 aa  126  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3931  hypothetical protein  30.17 
 
 
445 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00536629  normal  0.131737 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2099  tetratricopeptide TPR_4  27.07 
 
 
470 aa  103  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9241  hypothetical protein  25.06 
 
 
428 aa  93.6  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  33.33 
 
 
565 aa  80.1  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6244  hypothetical protein  28.57 
 
 
418 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.699378  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2662  hypothetical protein  29.81 
 
 
482 aa  71.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2311  helix-turn-helix domain-containing protein  31.82 
 
 
424 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.4937 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1022  XRE family transcriptional regulator  28.92 
 
 
441 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.936661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6314  helix-turn-helix domain-containing protein  28.31 
 
 
443 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5545  XRE family transcriptional regulator  28.31 
 
 
443 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7615  hypothetical protein  26.37 
 
 
477 aa  64.3  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.706706  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2547  hypothetical protein  24.27 
 
 
545 aa  63.2  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.441995  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7352  hypothetical protein  23.97 
 
 
518 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6356  transcriptional regulator, XRE family  29.29 
 
 
406 aa  51.2  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1336  hypothetical protein  35.29 
 
 
556 aa  47.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0410246  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4245  hypothetical protein  30.85 
 
 
316 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1397  hypothetical protein  24.47 
 
 
443 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>