149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7184 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7184  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 190 aa  378  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  91.53 
 
 		 196 aa  327  7e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  71.81 
 
 		 194 aa  234  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2124  transcriptional regulator, TetR family  69.19 
 
 		 195 aa  224  8e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  54.79 
 
 		 187 aa  186  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3208  transcriptional regulator, TetR family  61.5 
 
 		 204 aa  177  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.443054  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5798  transcriptional regulator, TetR family  46.96 
 
 		 188 aa  142  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.03173  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 188 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  38.92 
 
 		 221 aa  85.1  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  37.91 
 
 		 205 aa  84.3  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0669  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.922821  hitchhiker  0.000725922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 429 aa  57.8  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19140  hypothetical protein  54.55 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125477  normal  0.347466 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3484  TetR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0095  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0478352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0929  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0615031  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3837  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 220 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1558  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  42.86 
 
 		 237 aa  53.9  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  44.12 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0308  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1897  transcriptional regulator, TetR family  41.49 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0417503  decreased coverage  0.000000883258 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 238 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 237 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  40.68 
 
 		 241 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 237 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 234 aa  52  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 241 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 414 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  31.39 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 215 aa  48.1  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25180  transcriptional regulator, tetR family  45.1 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2528  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56508  normal  0.0962635 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 247 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  50 
 
 		 202 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  47.06 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0862  hypothetical protein  43.1 
 
 		 232 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17058  normal  0.0703318 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.47 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  32.47 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 178 aa  45.4  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2963  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  28.4 
 
 		 191 aa  45.4  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2923  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.30016e-22 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 264 aa  45.1  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 213 aa  44.7  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 201 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 207 aa  44.7  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2934  transcriptional regulator, TetR family  23.45 
 
 		 196 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  20.99 
 
 		 197 aa  44.7  0.0009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  40 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 240 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  32.31 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0389  hypothetical protein  45.76 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37010  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2076  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.954712 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2644  TetR family transcriptional regulator  23.45 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.773011  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1000  regulatory protein, TetR  30.59 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 245 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6786  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  23.72 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2970  transcriptional regulator, TetR family  24.66 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.642297  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 166 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1158  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 218 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2924  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 236 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 218 aa  42.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2060  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  28.21 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>