More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7147 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  68.21 
 
 
518 aa  732    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7147  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
511 aa  1048    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  66.22 
 
 
515 aa  697    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  61.92 
 
 
519 aa  648    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  78.86 
 
 
508 aa  847    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  78.67 
 
 
511 aa  847    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  62.48 
 
 
521 aa  640    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  55.85 
 
 
527 aa  602  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  56.35 
 
 
522 aa  577  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  54.69 
 
 
521 aa  541  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  54.1 
 
 
512 aa  540  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.47 
 
 
513 aa  535  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  46.54 
 
 
514 aa  479  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  48.83 
 
 
510 aa  435  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  46.89 
 
 
506 aa  431  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  46.78 
 
 
506 aa  429  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  48.51 
 
 
505 aa  420  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  47.74 
 
 
501 aa  420  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  48.23 
 
 
499 aa  418  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  48.05 
 
 
500 aa  418  9.999999999999999e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  46.23 
 
 
500 aa  415  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  46.81 
 
 
506 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2335  AMP-dependent synthetase and ligase  45.72 
 
 
509 aa  403  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  44.91 
 
 
516 aa  397  1e-109  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6769  AMP-dependent synthetase and ligase  44.74 
 
 
507 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147424  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.33 
 
 
514 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.55 
 
 
510 aa  383  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  44.27 
 
 
508 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.96 
 
 
510 aa  378  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.77 
 
 
510 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.77 
 
 
510 aa  375  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.77 
 
 
510 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.77 
 
 
510 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.77 
 
 
510 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.45 
 
 
510 aa  376  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.65 
 
 
510 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.57 
 
 
510 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.47 
 
 
512 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  43.25 
 
 
539 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0411  AMP-dependent synthetase and ligase  43.44 
 
 
513 aa  362  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.26 
 
 
510 aa  361  2e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  41.67 
 
 
662 aa  355  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  39.92 
 
 
495 aa  354  2e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  39.43 
 
 
561 aa  353  4e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  40.2 
 
 
492 aa  344  2e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  39.66 
 
 
549 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  37.69 
 
 
559 aa  342  9e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  38.63 
 
 
490 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  37.57 
 
 
498 aa  338  1.9999999999999998e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.41 
 
 
561 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  37.38 
 
 
583 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.74 
 
 
563 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.64 
 
 
582 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.74 
 
 
563 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  37.59 
 
 
577 aa  335  9e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.55 
 
 
563 aa  333  4e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.55 
 
 
563 aa  333  4e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  38.94 
 
 
510 aa  333  5e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37 
 
 
561 aa  331  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.55 
 
 
582 aa  331  2e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.62 
 
 
561 aa  331  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  40.19 
 
 
569 aa  331  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.55 
 
 
561 aa  330  3e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.12 
 
 
561 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  38.23 
 
 
536 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.33 
 
 
585 aa  327  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  39.49 
 
 
525 aa  325  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1609  AMP-dependent synthetase and ligase  37.66 
 
 
527 aa  324  2e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  36.93 
 
 
573 aa  323  4e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  36.77 
 
 
564 aa  322  9.000000000000001e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  38.35 
 
 
566 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  38.78 
 
 
506 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  36.61 
 
 
551 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  35.86 
 
 
585 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  37.02 
 
 
557 aa  320  5e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2905  AMP-dependent synthetase and ligase  38.73 
 
 
502 aa  318  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.587257 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  39.2 
 
 
561 aa  318  2e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  39.65 
 
 
520 aa  317  4e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  38.28 
 
 
511 aa  315  9e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  35.08 
 
 
584 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  37.4 
 
 
554 aa  312  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  37.38 
 
 
577 aa  310  4e-83  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  36.93 
 
 
579 aa  310  4e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  37.19 
 
 
577 aa  310  4e-83  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7687  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  38.39 
 
 
500 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  37.16 
 
 
508 aa  307  4.0000000000000004e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1256  AMP-dependent synthetase and ligase  38.81 
 
 
573 aa  306  5.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.590511 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  37.06 
 
 
561 aa  306  6e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2193  AMP-dependent synthetase and ligase  37.01 
 
 
576 aa  306  6e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 
583 aa  306  8.000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  37.31 
 
 
549 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 
506 aa  304  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0228  AMP-dependent synthetase and ligase  35.86 
 
 
558 aa  303  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  35.51 
 
 
520 aa  301  2e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  36.69 
 
 
565 aa  300  6e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3950  AMP-dependent synthetase and ligase  36.52 
 
 
559 aa  299  8e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0302713  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3572  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase protein  36.43 
 
 
557 aa  298  1e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2902  AMP-dependent synthetase and ligase  37.78 
 
 
523 aa  298  2e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.475075  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3299  AMP-dependent synthetase and ligase  36.52 
 
 
559 aa  298  2e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1704  AMP-dependent synthetase and ligase  37.24 
 
 
599 aa  297  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180137  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>