225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7092 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  494  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  70.04 
 
 		 258 aa  355  3.9999999999999996e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  64.03 
 
 		 254 aa  314  9e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  60.8 
 
 		 254 aa  301  6.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  63.86 
 
 		 301 aa  291  6e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  64.11 
 
 		 250 aa  291  8e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  57.26 
 
 		 252 aa  286  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  59.04 
 
 		 253 aa  285  2.9999999999999996e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  62.1 
 
 		 254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0096  LamB/YcsF family protein  59.44 
 
 		 249 aa  281  5.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000523388 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  56.85 
 
 		 256 aa  280  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  58.63 
 
 		 252 aa  280  1e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  59.04 
 
 		 254 aa  280  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  57.96 
 
 		 255 aa  279  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  61.69 
 
 		 255 aa  278  5e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  54.44 
 
 		 254 aa  276  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  62.5 
 
 		 304 aa  275  4e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  61.04 
 
 		 254 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  61.04 
 
 		 254 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  61.04 
 
 		 254 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0099  LamB/YcsF family protein  57.43 
 
 		 255 aa  275  7e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5927  LamB/YcsF family protein  60 
 
 		 252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  57.6 
 
 		 251 aa  272  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  57.26 
 
 		 252 aa  268  5e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  60.48 
 
 		 253 aa  267  1e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  54.62 
 
 		 254 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3558  LamB/YcsF family protein  59.76 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1451  LamB/YcsF family protein  58.23 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  52.82 
 
 		 258 aa  259  2e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  54.62 
 
 		 264 aa  259  4e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  56.73 
 
 		 257 aa  259  4e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  56.85 
 
 		 249 aa  259  4e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  54.8 
 
 		 252 aa  258  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  54.4 
 
 		 255 aa  255  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0313  LamB/YcsF family protein  52.02 
 
 		 249 aa  248  7e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0975  LamB/YcsF family protein  54.44 
 
 		 250 aa  247  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0323656  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  48.4 
 
 		 250 aa  246  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2770  LamB/YcsF family protein  55.38 
 
 		 299 aa  238  5.999999999999999e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00407074  hitchhiker  0.0000126458 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6367  hypothetical protein  52.87 
 
 		 254 aa  235  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0512992  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4577  LamB/YcsF family protein  51.46 
 
 		 258 aa  234  9e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.701806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  49.4 
 
 		 250 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1312  LamB/YcsF family protein  51.46 
 
 		 258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4098  LamB/YcsF family protein  51.05 
 
 		 259 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3309  LamB/YcsF family protein  49.4 
 
 		 254 aa  231  6e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.716241  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2978  LamB/YcsF family protein  49.4 
 
 		 254 aa  231  6e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2113  LamB/YcsF family protein  49.4 
 
 		 254 aa  231  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3370  LamB/YcsF family protein  49.4 
 
 		 254 aa  231  6e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0447  LamB/YcsF family protein  49.4 
 
 		 262 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0251  LamB/YcsF family protein  49.4 
 
 		 254 aa  231  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0264  LamB/YcsF family protein  49.4 
 
 		 254 aa  231  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0974794  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3877  LamB/YcsF family protein  50.62 
 
 		 259 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.441072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0228  LamB/YcsF family protein  49 
 
 		 254 aa  226  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  49.4 
 
 		 250 aa  225  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  44.58 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1405  LamB/YcsF family protein  47.28 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  50.4 
 
 		 260 aa  223  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4365  LamB/YcsF family protein  46.8 
 
 		 246 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0902  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3084  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 		 254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3058  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 		 254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0249954 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  44.12 
 
 		 255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2950  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 		 254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.815554 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3034  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 		 254 aa  222  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.689834 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  44.12 
 
 		 255 aa  221  8e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0089  LamB/YcsF family protein  45.38 
 
 		 246 aa  221  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0380957  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  48.19 
 
 		 250 aa  221  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3199  LamB/YcsF family protein  49.59 
 
 		 247 aa  221  9e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.96795  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5077  LamB/YcsF family protein  49 
 
 		 255 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.709601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  46.8 
 
 		 250 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2425  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 		 274 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16977  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3039  LamB/YcsF family protein  50.6 
 
 		 274 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  43.7 
 
 		 255 aa  220  9.999999999999999e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2802  LamB/YcsF family protein  45.56 
 
 		 273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1029  LamB/YcsF family protein  49.37 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3378  LamB/YcsF family protein  49.79 
 
 		 249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  0.571628 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  44.49 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37270  LamB/YcsF family protein  49.59 
 
 		 247 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000305457  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05397  hypothetical protein  49.79 
 
 		 260 aa  219  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.491165 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  51.43 
 
 		 256 aa  218  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  49.4 
 
 		 255 aa  219  5e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58540  hypothetical protein  48.55 
 
 		 251 aa  218  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  50 
 
 		 260 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  47.04 
 
 		 255 aa  218  7.999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0064  LamB/YcsF family protein  46.18 
 
 		 246 aa  217  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6386  LamB/YcsF family protein  48.59 
 
 		 254 aa  216  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.631285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0535  LamB/YcsF family protein  52.02 
 
 		 256 aa  215  5.9999999999999996e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.884685  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  42.08 
 
 		 255 aa  215  5.9999999999999996e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29760  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  52.89 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1572  LamB/YcsF family protein  52.4 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  48.57 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  44.8 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5125  hypothetical protein  47.3 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.702011  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3426  LamB/YcsF family protein  44.18 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.864417  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  48.59 
 
 		 260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  48.39 
 
 		 255 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  45.02 
 
 		 254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5814  LamB/YcsF family protein  45.38 
 
 		 257 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.0676141 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  46.61 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  46.59 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2917  LamB/YcsF family protein  46.72 
 
 		 256 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>