More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7074 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5233  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.96 
 
 		 704 aa  808    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157625 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4745  ATP-dependent DNA helicase RecQ  61.46 
 
 		 691 aa  804    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.865957 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22560  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.81 
 
 		 979 aa  748    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0184  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  55.42 
 
 		 741 aa  660    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1612  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  57.12 
 
 		 733 aa  711    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.644858 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0376  ATP-dependent DNA helicase RecQ  64.11 
 
 		 712 aa  777    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3301  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  65.53 
 
 		 723 aa  876    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1626  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  70.14 
 
 		 706 aa  931    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.135098  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1524  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.69 
 
 		 712 aa  777    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 		 689 aa  1370    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5040  ATP-dependent DNA helicase RecQ  61.6 
 
 		 691 aa  807    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5950  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.76 
 
 		 749 aa  790    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0569292 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0677  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.94 
 
 		 754 aa  784    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00766403  normal  0.0478204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3226  ATP-dependent DNA helicase RecQ family  62.08 
 
 		 691 aa  777    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225844  hitchhiker  0.0000186089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5584  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  62.2 
 
 		 718 aa  784    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128967  normal  0.346665 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03530  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.65 
 
 		 734 aa  714    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0447  ATP-dependent DNA helicase RecQ  64.5 
 
 		 708 aa  775    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0452326  decreased coverage  0.00000647403 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1091  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  53.03 
 
 		 788 aa  688    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.305899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  66.81 
 
 		 691 aa  844    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346189  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  60.89 
 
 		 724 aa  788    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  0.167588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4657  ATP-dependent DNA helicase RecQ  61.46 
 
 		 691 aa  804    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0819  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  55.75 
 
 		 745 aa  702    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  55.9 
 
 		 766 aa  709    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.572742  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06850  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.93 
 
 		 713 aa  727    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2394  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  56.44 
 
 		 756 aa  686    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396069  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0672  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.56 
 
 		 729 aa  699    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20415  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18920  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.1 
 
 		 762 aa  651    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275245  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0133  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.58 
 
 		 714 aa  760    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.931384  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1571  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.08 
 
 		 693 aa  556  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.000060483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.62 
 
 		 708 aa  550  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1532  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.63 
 
 		 697 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4035  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  49.48 
 
 		 679 aa  545  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000527005  normal  0.0486665 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1940  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.76 
 
 		 706 aa  545  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187923  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0827  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.12 
 
 		 706 aa  540  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.493882  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1318  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.63 
 
 		 756 aa  537  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0376564  decreased coverage  0.0000000122508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0315  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  48.07 
 
 		 698 aa  531  1e-149  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0559  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.38 
 
 		 698 aa  527  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000154535  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3804  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.49 
 
 		 698 aa  525  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00343497  decreased coverage  0.0000140841 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3718  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.45 
 
 		 698 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4347  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.65 
 
 		 699 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0558193  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0485  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.3 
 
 		 697 aa  498  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0673  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40 
 
 		 695 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.293047  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.32 
 
 		 693 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000979868  decreased coverage  0.000575313 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1436  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.77 
 
 		 691 aa  486  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000631982  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1126  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.09 
 
 		 691 aa  472  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.760992  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0495  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.6 
 
 		 448 aa  266  1e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.75 
 
 		 543 aa  243  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.75 
 
 		 543 aa  243  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.75 
 
 		 543 aa  243  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.61 
 
 		 602 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.92 
 
 		 1376 aa  234  4.0000000000000004e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0829  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.6 
 
 		 546 aa  230  6e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.27 
 
 		 588 aa  226  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.76 
 
 		 545 aa  224  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.31 
 
 		 563 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.39 
 
 		 562 aa  218  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.7 
 
 		 552 aa  213  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.16 
 
 		 646 aa  212  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.94 
 
 		 590 aa  211  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.36 
 
 		 708 aa  209  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.1 
 
 		 626 aa  207  6e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.8 
 
 		 607 aa  207  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138004  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1249  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.67 
 
 		 557 aa  207  6e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6295  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.95 
 
 		 590 aa  206  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4547  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.66 
 
 		 556 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908744  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.43 
 
 		 591 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4974  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34 
 
 		 568 aa  201  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581094  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.5 
 
 		 716 aa  200  7.999999999999999e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4005  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.84 
 
 		 630 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4236  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.02 
 
 		 535 aa  198  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6470  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.4 
 
 		 624 aa  196  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0566058 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0072  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.51 
 
 		 674 aa  195  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.234386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2232  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.04 
 
 		 634 aa  195  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.319875  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1535  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.72 
 
 		 596 aa  194  4e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.297932  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1542  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.14 
 
 		 592 aa  194  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1229  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.77 
 
 		 779 aa  194  5e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0514  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.61 
 
 		 599 aa  194  6e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3200  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.74 
 
 		 600 aa  193  7e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.61 
 
 		 706 aa  193  8e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.82 
 
 		 725 aa  193  8e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1914  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.82 
 
 		 588 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.92 
 
 		 705 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1003  superfamily II DNA helicase  38.91 
 
 		 597 aa  192  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000133719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.15 
 
 		 611 aa  192  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.15 
 
 		 611 aa  192  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0911  superfamily II DNA helicase  37.74 
 
 		 621 aa  192  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.75 
 
 		 451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1924  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family protein  38.87 
 
 		 669 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.71 
 
 		 728 aa  191  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6077  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.39 
 
 		 618 aa  191  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.9148  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  33.33 
 
 		 705 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.77 
 
 		 602 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.73 
 
 		 707 aa  191  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.85 
 
 		 714 aa  190  5.999999999999999e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.46 
 
 		 736 aa  190  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.53 
 
 		 737 aa  190  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.33 
 
 		 705 aa  190  9e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.33 
 
 		 705 aa  190  9e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.04 
 
 		 705 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.33 
 
 		 705 aa  190  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>