240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7072 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7072  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 216 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22730  transcriptional regulator, TetR family  68.06 
 
 		 216 aa  303  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2416  TetR family transcriptional regulator  68.54 
 
 		 247 aa  295  4e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00485209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3769  TetR family transcriptional regulator  67.14 
 
 		 235 aa  292  3e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.396044  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3842  TetR family transcriptional regulator  67.14 
 
 		 235 aa  292  3e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4236  TetR family transcriptional regulator  68.57 
 
 		 236 aa  291  4e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3781  TetR family transcriptional regulator  67.14 
 
 		 235 aa  291  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1790  transcriptional regulator, TetR family  65.4 
 
 		 224 aa  289  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121253  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2597  transcriptional regulator, TetR family  64.62 
 
 		 218 aa  283  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127933  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1506  TetR family transcriptional regulator  67.13 
 
 		 227 aa  274  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212096  hitchhiker  0.000526239 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3489  transcriptional regulator, TetR family  64.42 
 
 		 230 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2891  transcriptional regulator, TetR family  63.51 
 
 		 236 aa  258  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2889  transcriptional regulator, TetR family  59.13 
 
 		 227 aa  201  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5743  regulatory protein TetR  41.34 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.405607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3894  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 223 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0466911 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2515  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00143422  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4057  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2468  TetR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0388  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1768  regulatory protein, TetR  31.92 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3285  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 270 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0301  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.593617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 317 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 272 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 272 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 276 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4548  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225011  normal  0.280375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0521  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.769368  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  32.52 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 238 aa  65.1  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0223  regulatory protein TetR  36.36 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.029073 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  49.35 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3294  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1699  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0964215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5753  hypothetical protein  41.67 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.391996 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 229 aa  61.6  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2515  regulatory protein, TetR  45.21 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.977555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  28.48 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3897  regulatory protein, TetR  29.66 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0396363  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2773  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00136461  normal  0.297144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1677  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.688428  normal  0.314033 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4645  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  37.36 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1888  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3522  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  37.36 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0538  putative transcription regulator protein  30.36 
 
 		 340 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548249  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  40.43 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  38.89 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0106  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.180704  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  31.18 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1790  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.536923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  57.14 
 
 		 220 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4603  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 240 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6888  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 254 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  31.18 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3446  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 335 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0433  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 354 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.425009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02639  transcriptional regulator  37.36 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 239 aa  49.7  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  43.1 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>