More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7068 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7068  PfkB  100 
 
 
297 aa  598  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  84.18 
 
 
297 aa  500  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  73.74 
 
 
309 aa  448  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  71.04 
 
 
298 aa  429  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3300  PfkB domain protein  69.36 
 
 
314 aa  418  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  51.01 
 
 
304 aa  277  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  46.23 
 
 
303 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1470  ribokinase-like domain-containing protein  48.81 
 
 
298 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1435  ribokinase-like domain-containing protein  46.94 
 
 
293 aa  212  5.999999999999999e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  43.54 
 
 
300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24440  sugar kinase, ribokinase  44.64 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.480444  normal  0.238886 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3778  PfkB domain protein  44.07 
 
 
297 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00891877  normal  0.801682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6402  kinase, PfkB family  39.6 
 
 
316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223985  normal  0.0576873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3558  PfkB domain protein  45.92 
 
 
287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.321996  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  35.45 
 
 
317 aa  163  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0416  PfkB  36.03 
 
 
320 aa  150  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2148  PfkB domain-containing protein  41.02 
 
 
312 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.950763  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2001  PfkB domain protein  33.22 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  31.08 
 
 
309 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  37.12 
 
 
331 aa  116  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  31.42 
 
 
328 aa  111  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  33.08 
 
 
328 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  34.07 
 
 
337 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  34.07 
 
 
337 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  35.04 
 
 
337 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  33.33 
 
 
407 aa  106  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  33.84 
 
 
333 aa  106  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  34.07 
 
 
337 aa  105  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  34.88 
 
 
331 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  29.01 
 
 
330 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  35.58 
 
 
304 aa  103  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  33.33 
 
 
332 aa  101  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  31.72 
 
 
338 aa  99.8  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  31.46 
 
 
337 aa  99  8e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  31.99 
 
 
335 aa  99  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  26.74 
 
 
334 aa  99  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  34.33 
 
 
331 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  31.72 
 
 
333 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  29.96 
 
 
330 aa  97.1  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  36.4 
 
 
316 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  29.96 
 
 
330 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1142  PfkB  31.44 
 
 
310 aa  96.3  6e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0676537  normal  0.093061 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  29.96 
 
 
330 aa  95.9  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  28.63 
 
 
335 aa  95.9  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  28.46 
 
 
335 aa  95.5  9e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  32.08 
 
 
333 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2477  ribokinase-like domain-containing protein  32.44 
 
 
307 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  24.55 
 
 
338 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  31.6 
 
 
333 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  26.07 
 
 
333 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  27.88 
 
 
333 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1170  PfkB domain-containing protein  29.14 
 
 
305 aa  93.6  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0154398  normal  0.362053 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1278  PfkB domain-containing protein  34.18 
 
 
317 aa  93.2  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  30.97 
 
 
333 aa  93.2  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  31.27 
 
 
298 aa  92.4  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2615  PfkB domain protein  29.77 
 
 
305 aa  92.4  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  33.08 
 
 
305 aa  92.4  9e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  31.5 
 
 
333 aa  91.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  31.99 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  30.4 
 
 
334 aa  90.9  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  30.86 
 
 
333 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0200  ribokinase  28.34 
 
 
313 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.933367 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  28.28 
 
 
360 aa  90.5  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  29.17 
 
 
330 aa  90.1  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  27.51 
 
 
330 aa  89.7  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  27.51 
 
 
330 aa  89.7  6e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  31.94 
 
 
333 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  26.62 
 
 
336 aa  89  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  33.68 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  28.15 
 
 
315 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  29.77 
 
 
329 aa  88.2  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  27.51 
 
 
331 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  31.35 
 
 
328 aa  87.4  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2276  PfkB domain protein  32.13 
 
 
307 aa  86.3  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.303585  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  30.74 
 
 
322 aa  85.9  7e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  33.76 
 
 
308 aa  85.9  7e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  31.15 
 
 
324 aa  85.9  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  32.46 
 
 
329 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  33 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  26.97 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  27.24 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  30.2 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  34.52 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  33.21 
 
 
330 aa  83.6  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  28.03 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  32.22 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  27.97 
 
 
322 aa  83.6  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  33.46 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  31.95 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  28.77 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  30.88 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  29.93 
 
 
323 aa  82.8  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  29 
 
 
317 aa  82.4  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  29.41 
 
 
323 aa  82.4  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  33.7 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  29.74 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  31.58 
 
 
314 aa  81.6  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  33.21 
 
 
302 aa  82  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  32.09 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  30.19 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>