More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7047 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  100 
 
 		 492 aa  929    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.88 
 
 		 474 aa  347  3e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  47.15 
 
 		 454 aa  324  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.43 
 
 		 487 aa  319  7e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2088  major facilitator superfamily MFS_1  47.1 
 
 		 492 aa  301  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.51 
 
 		 498 aa  300  3e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.14 
 
 		 487 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.09 
 
 		 514 aa  283  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.57 
 
 		 490 aa  283  5.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.32 
 
 		 763 aa  281  3e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.45 
 
 		 519 aa  275  9e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  41.41 
 
 		 553 aa  274  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.49 
 
 		 507 aa  271  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.8 
 
 		 509 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.83 
 
 		 788 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.26 
 
 		 508 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.51 
 
 		 489 aa  267  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.96 
 
 		 500 aa  262  8.999999999999999e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9044  putative transmembrane efflux protein  42.69 
 
 		 492 aa  262  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.92 
 
 		 487 aa  262  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.48 
 
 		 519 aa  262  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.92 
 
 		 496 aa  262  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.29 
 
 		 527 aa  261  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.92 
 
 		 534 aa  253  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.47 
 
 		 479 aa  252  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  38.01 
 
 		 491 aa  252  1e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.35 
 
 		 478 aa  248  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40 
 
 		 1112 aa  248  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.45 
 
 		 522 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  41.55 
 
 		 485 aa  246  4.9999999999999997e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.72 
 
 		 493 aa  246  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  39.87 
 
 		 498 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  39.14 
 
 		 494 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0362  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.42 
 
 		 479 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0845  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.42 
 
 		 479 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.880414  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  40.39 
 
 		 506 aa  245  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  40.49 
 
 		 497 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5131  major facilitator superfamily MFS_1  42.11 
 
 		 487 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0817  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.27 
 
 		 479 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278156  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.94 
 
 		 487 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  40.74 
 
 		 475 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  38.35 
 
 		 490 aa  243  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3935  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.09 
 
 		 479 aa  243  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000976381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.83 
 
 		 499 aa  243  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8232  major facilitator superfamily MFS_1  40.21 
 
 		 513 aa  242  9e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.41 
 
 		 498 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.419184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  42.04 
 
 		 481 aa  241  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.07 
 
 		 506 aa  236  6e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4243  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.73 
 
 		 504 aa  236  7e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.02 
 
 		 505 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.64 
 
 		 501 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0624  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 475 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.14 
 
 		 480 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1398  drug resistance MFS transporter  43.14 
 
 		 480 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0776  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.44 
 
 		 488 aa  233  8.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000908237 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1483  drug resistance MFS transporter  42.92 
 
 		 480 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  39.74 
 
 		 501 aa  231  3e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.32 
 
 		 480 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.189888  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3195  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.32 
 
 		 480 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.88533  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.32 
 
 		 480 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.32 
 
 		 480 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3141  drug resistance MFS transporter  42.32 
 
 		 480 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3178  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.32 
 
 		 480 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1885  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.32 
 
 		 480 aa  229  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.33 
 
 		 487 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.608352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5138  major facilitator superfamily MFS_1  43.61 
 
 		 477 aa  228  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.328168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  38 
 
 		 481 aa  227  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.53 
 
 		 489 aa  226  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  41.79 
 
 		 471 aa  226  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3892  major facilitator superfamily MFS_1  42.77 
 
 		 511 aa  226  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.741716  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0441  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.92 
 
 		 478 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.92 
 
 		 478 aa  225  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.4 
 
 		 482 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.4 
 
 		 482 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 519 aa  225  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1200  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.7 
 
 		 478 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4079  major facilitator transporter  38.31 
 
 		 470 aa  224  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0276069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.7 
 
 		 478 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3703  permease of the major facilitator superfamily  41 
 
 		 477 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805067  normal  0.0440675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0766  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.51 
 
 		 499 aa  223  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.176707 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1424  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.97 
 
 		 548 aa  223  7e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.589759  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.64 
 
 		 481 aa  223  8e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4413  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.04 
 
 		 497 aa  222  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  38.39 
 
 		 483 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4981  major facilitator superfamily MFS_1  39.54 
 
 		 518 aa  221  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.547375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  35.32 
 
 		 487 aa  220  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.77 
 
 		 482 aa  220  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7158  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.06 
 
 		 502 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.454502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8633  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.16 
 
 		 488 aa  220  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 		 463 aa  220  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5593  major facilitator superfamily MFS_1  41.03 
 
 		 499 aa  219  7e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8208  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  41.81 
 
 		 463 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3373  major facilitator superfamily MFS_1  38.95 
 
 		 482 aa  219  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  34.73 
 
 		 470 aa  218  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5578  major facilitator superfamily MFS_1  41.37 
 
 		 478 aa  217  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  37.65 
 
 		 507 aa  217  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.53 
 
 		 510 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.55 
 
 		 478 aa  217  5e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1611  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.69 
 
 		 503 aa  216  7e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  36.72 
 
 		 476 aa  216  8e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>