252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7037 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7037  hypothetical protein  100 
 
 
387 aa  785    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1931  phage integrase family protein  53.3 
 
 
218 aa  218  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0950556  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  27.74 
 
 
416 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  25.75 
 
 
400 aa  133  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  29.52 
 
 
477 aa  130  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  26.21 
 
 
392 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  27.86 
 
 
378 aa  122  8e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  27.44 
 
 
379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  26.1 
 
 
414 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  27.51 
 
 
363 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  24.8 
 
 
391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  26.9 
 
 
377 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  27.79 
 
 
402 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  29.73 
 
 
377 aa  105  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  22.58 
 
 
378 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  26.43 
 
 
422 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  24.79 
 
 
386 aa  101  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  25.06 
 
 
422 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  24.75 
 
 
431 aa  100  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  28.16 
 
 
371 aa  100  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  26.39 
 
 
387 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  24.01 
 
 
369 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  27.66 
 
 
426 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  24.27 
 
 
369 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  22.66 
 
 
383 aa  94.4  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  25 
 
 
390 aa  92.8  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  26.18 
 
 
357 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  28.43 
 
 
305 aa  89.4  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  25.8 
 
 
368 aa  89.4  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1133  phage integrase  25.23 
 
 
454 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00289406  hitchhiker  0.000832848 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.12 
 
 
374 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23.12 
 
 
374 aa  87  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  26.22 
 
 
463 aa  86.3  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  23.24 
 
 
369 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  24.8 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  23.72 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  25.85 
 
 
376 aa  83.2  0.000000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  24.69 
 
 
423 aa  82.8  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  23.51 
 
 
383 aa  81.3  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  22.11 
 
 
389 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  22.45 
 
 
381 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  24.24 
 
 
325 aa  79.7  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  23.61 
 
 
374 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  23.69 
 
 
393 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1451  integrase family protein  27.6 
 
 
371 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  24.49 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  24.91 
 
 
381 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  27.97 
 
 
407 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  24.35 
 
 
443 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  24.91 
 
 
381 aa  77  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  24.07 
 
 
370 aa  77  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  23.64 
 
 
437 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  23.37 
 
 
373 aa  75.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  23.82 
 
 
451 aa  75.5  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  23.97 
 
 
435 aa  74.7  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  25.13 
 
 
378 aa  73.9  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4016  phage integrase family protein  28.57 
 
 
487 aa  73.2  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  25.26 
 
 
406 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1457  integrase family protein  26.53 
 
 
380 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0407  phage integrase  24.18 
 
 
503 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.995866 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3794  integrase family protein  23.95 
 
 
445 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0397442 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3743  integrase family protein  23.95 
 
 
445 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1569  integrase family protein  27.76 
 
 
422 aa  70.5  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  24.28 
 
 
404 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  26.04 
 
 
416 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  24.4 
 
 
385 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0524  integrase family protein  25.77 
 
 
407 aa  67.8  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236803  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0017  integrase family protein  24.85 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  26.57 
 
 
412 aa  66.2  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3390  phage integrase  26.61 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  22.11 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  22.73 
 
 
370 aa  66.2  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0572  integrase  21.88 
 
 
372 aa  65.5  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000288735  normal  0.557029 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0634  integrase  21.88 
 
 
372 aa  65.5  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000314832  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0768  integrase family protein  25.94 
 
 
397 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23 
 
 
376 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  23 
 
 
376 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1294  integrase family protein  27.91 
 
 
393 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  24.24 
 
 
391 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  24.73 
 
 
402 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  26.95 
 
 
397 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  24.63 
 
 
409 aa  61.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  25.73 
 
 
379 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  25.73 
 
 
379 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  26.6 
 
 
411 aa  60.8  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0961  phage integrase  22.32 
 
 
414 aa  60.8  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.531442  unclonable  0.0000381875 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  25 
 
 
401 aa  60.5  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  22.4 
 
 
398 aa  60.5  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  21.57 
 
 
413 aa  60.5  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  24.58 
 
 
392 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3878  integrase family protein  24.54 
 
 
380 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  19.66 
 
 
391 aa  59.7  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3437  integrase family protein  30.13 
 
 
458 aa  58.9  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494815  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1112  integrase family protein  20.51 
 
 
338 aa  59.3  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0304  phage integrase family protein  22.02 
 
 
401 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  25.99 
 
 
386 aa  58.9  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  22.04 
 
 
376 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  24.24 
 
 
392 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0311  phage integrase family protein  22.02 
 
 
401 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1182  phage integrase family protein  20.33 
 
 
376 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000913824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>