More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6995 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  100 
 
 		 255 aa  517  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4119  transcriptional regulator, AraC family  53.56 
 
 		 262 aa  253  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.840918  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2693  helix-turn-helix domain-containing protein  53.63 
 
 		 261 aa  248  7e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.129803  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  49.39 
 
 		 281 aa  231  8.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  48.16 
 
 		 261 aa  217  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6374  transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 		 255 aa  175  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6355  transcriptional regulator, AraC family  36.69 
 
 		 265 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6385  transcriptional regulator, AraC family  38.78 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0874  AraC family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 296 aa  142  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2180  helix-turn-helix domain-containing protein  38.19 
 
 		 281 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.971115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0872  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 292 aa  118  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12670  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  33.03 
 
 		 250 aa  108  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  29.88 
 
 		 297 aa  102  9e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0610  helix-turn-helix domain-containing protein  31.62 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2175  AraC family transcriptional regulator  42.99 
 
 		 281 aa  99  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0644092  normal  0.0265794 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  45.45 
 
 		 168 aa  98.2  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2057  helix-turn-helix domain-containing protein  39.39 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 204 aa  96.3  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 316 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  32.56 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  32.71 
 
 		 530 aa  82.8  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3232  transcriptional regulator, AraC family  42.71 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0599312  hitchhiker  0.0000105754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  40.22 
 
 		 156 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  37.11 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1482  transcriptional regulator, AraC family  35.58 
 
 		 345 aa  79.3  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  38.83 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  40.59 
 
 		 322 aa  79  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  44.32 
 
 		 148 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  39.18 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4847  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5440  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5422  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424919  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2776  AraC family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3159  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2020  transcriptional regulator, AraC family  36.76 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  33.01 
 
 		 332 aa  75.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  32.99 
 
 		 308 aa  75.5  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 278 aa  75.1  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  40 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 162 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  35.05 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  40.82 
 
 		 150 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  30.23 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0677  transposon Tn10 TetD protein  37.62 
 
 		 113 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 134 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0620  transposon Tn10 TetD protein  37.62 
 
 		 113 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0739  transposon Tn10 TetD protein  37.62 
 
 		 113 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0634  transposon Tn10 TetD protein  37.62 
 
 		 113 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 146 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 146 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3186  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 146 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0693  transposon Tn10 TetD protein  37.62 
 
 		 113 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  38.54 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4617  transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107807 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1711  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  34.65 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0971  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000205729  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1528  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  38.54 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  30.61 
 
 		 537 aa  72.8  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  33.83 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  41.67 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  27.72 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 341 aa  72  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  32.38 
 
 		 519 aa  72  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0079  transcriptional regulator, AraC family  35.05 
 
 		 187 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.294253  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  34.34 
 
 		 308 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28970  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91786  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1692  transcriptional regulator, AraC family  46.43 
 
 		 144 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4763  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6331  transcriptional regulator, AraC family  37.82 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>