287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6992 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2704  glucose-methanol-choline oxidoreductase  81.83 
 
 		 550 aa  902    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.051308  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  75.42 
 
 		 552 aa  875    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  79.17 
 
 		 535 aa  881    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  100 
 
 		 551 aa  1126    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  25.47 
 
 		 1150 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.13 
 
 		 786 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1255  FAD dependent oxidoreductase  28.48 
 
 		 889 aa  140  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3191  cholesterol oxidase  26.86 
 
 		 533 aa  139  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455037 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.25 
 
 		 1150 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5037  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.87 
 
 		 572 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13500  choline dehydrogenase-like flavoprotein  28.17 
 
 		 569 aa  124  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0994  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.05 
 
 		 505 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0279763  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0464  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 		 657 aa  110  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.558205  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3746  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.51 
 
 		 557 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4475  GMC oxidoreductase  26.67 
 
 		 554 aa  108  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00299763 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4224  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 		 564 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.61 
 
 		 556 aa  106  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2097  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.08 
 
 		 470 aa  104  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00213522  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4350  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.73 
 
 		 526 aa  100  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.95 
 
 		 623 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1728  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 		 587 aa  98.6  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.916893  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4522  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.95 
 
 		 520 aa  97.8  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464516  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.4 
 
 		 1132 aa  97.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.32 
 
 		 570 aa  96.3  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.07 
 
 		 515 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3081  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 547 aa  94  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2922  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 		 577 aa  94  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000517221  hitchhiker  0.0000805295 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.66 
 
 		 543 aa  94  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.550088  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1197  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 591 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1170  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 591 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1187  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 591 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.04 
 
 		 1152 aa  92.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1033  putative oxidoreductase chain  24.12 
 
 		 574 aa  92  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0731446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3274  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.29 
 
 		 543 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0584608  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.59 
 
 		 511 aa  91.3  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4906  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 		 578 aa  91.3  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.238026  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1514  FAD dependent oxidoreductase  25.44 
 
 		 578 aa  90.9  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2309  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  24.78 
 
 		 696 aa  89.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  23.54 
 
 		 1152 aa  89.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2312  GMC oxidoreductase  25.23 
 
 		 632 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943263  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1332  putative cholesterol oxidase  25.23 
 
 		 632 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2022  putative cholesterol oxidase  24.86 
 
 		 552 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2199  FAD dependent oxidoreductase  26.89 
 
 		 567 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1045  GMC oxidoreductase  25.23 
 
 		 653 aa  88.6  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3202  GMC oxidoreductase  25.23 
 
 		 632 aa  88.2  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.21 
 
 		 561 aa  88.2  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1417  GMC oxidoreductase family protein  25.23 
 
 		 632 aa  87.8  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3075  GMC oxidoreductase  25.23 
 
 		 632 aa  87.8  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3184  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.62 
 
 		 530 aa  87.4  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.275768  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0343  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.89 
 
 		 532 aa  87.4  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5122  GMC family oxidoreductase  26.07 
 
 		 532 aa  87  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2332  putative cholesterol oxidase  27.02 
 
 		 622 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.07 
 
 		 532 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0908  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 		 577 aa  86.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294321  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.93 
 
 		 572 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0256675  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.65 
 
 		 566 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257564  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5172  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.44 
 
 		 532 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2474  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.35 
 
 		 566 aa  85.1  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.826754 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00623  long chain fatty alcohol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17110)  23.89 
 
 		 745 aa  84.7  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345433  normal  0.817488 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.31 
 
 		 550 aa  83.6  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.87 
 
 		 526 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1176  hypothetical protein  28.3 
 
 		 563 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4248  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.42 
 
 		 586 aa  82  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0548  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.25 
 
 		 539 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4446  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.82 
 
 		 583 aa  80.9  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0454  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.06 
 
 		 570 aa  80.1  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.219134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.56 
 
 		 593 aa  79.7  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394863  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  23.71 
 
 		 528 aa  79.3  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5416  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.54 
 
 		 565 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.133389 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48204  predicted protein  23.88 
 
 		 786 aa  78.6  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3166  putative dehydrogenase transmembrane protein  26 
 
 		 506 aa  77.8  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1204  FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 		 581 aa  77.8  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0651029  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4774  Cholesterol oxidase  27.86 
 
 		 530 aa  77  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.2 
 
 		 527 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3834  FAD dependent oxidoreductase  28.9 
 
 		 563 aa  76.6  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10500  oxidoreductase  25.77 
 
 		 629 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.63635e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.87 
 
 		 527 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0350  GMC family oxidoreductase  22.99 
 
 		 539 aa  76.3  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4690  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.04 
 
 		 570 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.02417 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.29 
 
 		 556 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.49 
 
 		 553 aa  76.3  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0628  FAD dependent oxidoreductase  27.55 
 
 		 556 aa  74.7  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.35 
 
 		 556 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1077  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.48 
 
 		 504 aa  74.3  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.785546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2998  GMC family oxidoreductase  24.34 
 
 		 563 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3482  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.25 
 
 		 531 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.37 
 
 		 582 aa  73.9  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.38855  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0882  GMC family oxidoreductase  23.97 
 
 		 533 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  25 
 
 		 563 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  25 
 
 		 563 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  27.12 
 
 		 562 aa  73.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.633158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0857  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.87 
 
 		 531 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.11 
 
 		 526 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4189  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.77 
 
 		 537 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0880  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.87 
 
 		 531 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6532  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.33 
 
 		 562 aa  72.8  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0591  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.17 
 
 		 529 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.559544 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5724  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.14 
 
 		 573 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  25 
 
 		 563 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.53 
 
 		 518 aa  72.4  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>