More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6982 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 
183 aa  374  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  65.19 
 
 
178 aa  246  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  61.11 
 
 
181 aa  224  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  57.29 
 
 
192 aa  217  7e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  53.8 
 
 
182 aa  199  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  52.69 
 
 
203 aa  196  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  51.34 
 
 
199 aa  190  7e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  47.49 
 
 
180 aa  176  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  46.45 
 
 
181 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  44.26 
 
 
181 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.08 
 
 
188 aa  161  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.67 
 
 
201 aa  156  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0181  bifunctional deaminase-reductase domain protein  42.62 
 
 
204 aa  153  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  46.41 
 
 
179 aa  151  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  45 
 
 
183 aa  152  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  46.11 
 
 
187 aa  150  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  41.44 
 
 
183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7653  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.72 
 
 
187 aa  144  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  40.74 
 
 
204 aa  144  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  39.56 
 
 
180 aa  142  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.82 
 
 
204 aa  141  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40 
 
 
181 aa  138  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  39.29 
 
 
215 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3191  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.75 
 
 
183 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.8 
 
 
204 aa  136  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.72 
 
 
201 aa  136  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  42.39 
 
 
178 aa  135  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  42.13 
 
 
178 aa  135  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  36.14 
 
 
228 aa  132  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.38 
 
 
188 aa  131  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  38.71 
 
 
186 aa  131  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  41.51 
 
 
180 aa  131  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  39.18 
 
 
198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  39.43 
 
 
178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.27 
 
 
219 aa  129  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.17 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.72 
 
 
217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.69 
 
 
221 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.97 
 
 
199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1444  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.59 
 
 
209 aa  124  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.87184  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.44 
 
 
180 aa  124  5e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.5 
 
 
185 aa  124  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  34.55 
 
 
221 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  36.98 
 
 
219 aa  122  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  37.36 
 
 
183 aa  121  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.16 
 
 
221 aa  121  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.5 
 
 
187 aa  121  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0509  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.89 
 
 
201 aa  120  9e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.381053  decreased coverage  0.000000276564 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  36.08 
 
 
218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  34.02 
 
 
200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  31.61 
 
 
185 aa  118  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  40.88 
 
 
181 aa  117  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.67 
 
 
178 aa  117  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3694  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35.68 
 
 
201 aa  116  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.426681  normal  0.227028 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.08 
 
 
221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  35.57 
 
 
200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.46 
 
 
189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  34.38 
 
 
208 aa  112  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.79 
 
 
189 aa  112  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.79 
 
 
197 aa  111  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.7 
 
 
204 aa  111  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4363  deaminase-reductase domain-containing protein  35.05 
 
 
203 aa  111  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  36.32 
 
 
196 aa  111  6e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.99 
 
 
224 aa  110  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  36 
 
 
179 aa  110  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.04 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  37.04 
 
 
190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6219  deaminase-reductase domain-containing protein  36.75 
 
 
221 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.330344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.91 
 
 
178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.85 
 
 
204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.76 
 
 
188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.36 
 
 
176 aa  107  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0067  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.18 
 
 
157 aa  107  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.482424  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2317  hypothetical protein  35.05 
 
 
199 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.91 
 
 
188 aa  105  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2638  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.92 
 
 
217 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  34.92 
 
 
217 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.0195663 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00910  dihydrofolate reductase  35.56 
 
 
183 aa  105  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1734  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.62 
 
 
187 aa  104  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.594103  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.26 
 
 
178 aa  104  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  34.81 
 
 
177 aa  104  9e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2667  deaminase-reductase domain-containing protein  34.39 
 
 
217 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.440195  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5486  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.08 
 
 
181 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.024354  normal  0.977362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  35.11 
 
 
189 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.8 
 
 
183 aa  103  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5078  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.25 
 
 
210 aa  102  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6223  deaminase-reductase domain-containing protein  33.16 
 
 
214 aa  101  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  32.26 
 
 
180 aa  101  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3814  deaminase-reductase domain-containing protein  34.18 
 
 
205 aa  101  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.04 
 
 
177 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  32.12 
 
 
182 aa  100  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5956  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.7 
 
 
188 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1109  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.11 
 
 
190 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.05668  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.74 
 
 
202 aa  99.8  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4632  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.11 
 
 
183 aa  99.4  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170903  normal  0.134226 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.23 
 
 
193 aa  98.2  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2593  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.87 
 
 
200 aa  98.2  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000229137 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.73 
 
 
192 aa  97.8  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3635  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.13 
 
 
208 aa  97.8  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1513  deaminase-reductase domain-containing protein  36.56 
 
 
187 aa  97.1  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000068195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>