More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6964 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 553 aa  1065    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  54.84 
 
 		 528 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  51.08 
 
 		 509 aa  449  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  50.68 
 
 		 526 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  51.99 
 
 		 536 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  50.74 
 
 		 524 aa  436  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  46.39 
 
 		 562 aa  435  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  51.79 
 
 		 513 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  49.9 
 
 		 517 aa  418  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  50.19 
 
 		 521 aa  414  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  51.14 
 
 		 528 aa  405  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  52.64 
 
 		 481 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  44.95 
 
 		 518 aa  392  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  46.88 
 
 		 529 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  48.1 
 
 		 501 aa  388  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  50.5 
 
 		 496 aa  381  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  45.77 
 
 		 584 aa  375  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  48.19 
 
 		 509 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  42.3 
 
 		 514 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  47.7 
 
 		 508 aa  371  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  48.71 
 
 		 558 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  42.4 
 
 		 509 aa  365  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  48.4 
 
 		 540 aa  369  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  44.69 
 
 		 509 aa  364  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  47.55 
 
 		 539 aa  363  4e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  44.55 
 
 		 528 aa  363  5.0000000000000005e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  48.89 
 
 		 502 aa  362  8e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  47.71 
 
 		 575 aa  362  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  44.27 
 
 		 535 aa  360  5e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  47.11 
 
 		 514 aa  359  9e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  41.81 
 
 		 541 aa  349  8e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  48.46 
 
 		 516 aa  347  2e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  46.14 
 
 		 506 aa  342  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  47.22 
 
 		 497 aa  334  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.88 
 
 		 537 aa  332  7.000000000000001e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  45.19 
 
 		 533 aa  332  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  42.97 
 
 		 601 aa  328  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  41.98 
 
 		 588 aa  329  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 525 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  42.86 
 
 		 525 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 525 aa  327  3e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  40.12 
 
 		 532 aa  325  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  41.62 
 
 		 516 aa  324  2e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  43.55 
 
 		 513 aa  323  7e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  43.07 
 
 		 563 aa  322  9.999999999999999e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  47.21 
 
 		 513 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  44.82 
 
 		 521 aa  316  7e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  46.84 
 
 		 477 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  42.74 
 
 		 554 aa  310  4e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  45.76 
 
 		 535 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  42.4 
 
 		 555 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  39.72 
 
 		 519 aa  300  4e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  42 
 
 		 524 aa  286  5.999999999999999e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  37.64 
 
 		 503 aa  277  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  39.34 
 
 		 490 aa  277  4e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  40.12 
 
 		 505 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  42.66 
 
 		 508 aa  269  8.999999999999999e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  37.94 
 
 		 511 aa  269  8.999999999999999e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  40.88 
 
 		 516 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 		 520 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  40.42 
 
 		 492 aa  254  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  37.35 
 
 		 517 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  41.5 
 
 		 536 aa  251  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  37.99 
 
 		 516 aa  246  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  34.84 
 
 		 500 aa  244  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  37.22 
 
 		 510 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.02 
 
 		 534 aa  243  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.92 
 
 		 525 aa  243  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.03 
 
 		 532 aa  241  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  36.63 
 
 		 503 aa  240  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  36.49 
 
 		 513 aa  238  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.96 
 
 		 538 aa  230  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  38.79 
 
 		 528 aa  230  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  35.94 
 
 		 500 aa  228  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.77 
 
 		 503 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 495 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  35.81 
 
 		 517 aa  227  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  35.26 
 
 		 516 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  35.68 
 
 		 500 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1370  major facilitator superfamily MFS_1  39.57 
 
 		 506 aa  223  7e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.6 
 
 		 519 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 514 aa  220  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  39.02 
 
 		 511 aa  219  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2238  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.67 
 
 		 525 aa  219  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.166861  hitchhiker  0.0000537278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.74 
 
 		 607 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.77 
 
 		 522 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  34.59 
 
 		 519 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 504 aa  213  9e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33 
 
 		 626 aa  212  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.92 
 
 		 520 aa  211  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3332  major facilitator superfamily MFS_1  36.59 
 
 		 515 aa  209  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.25944 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  33.4 
 
 		 495 aa  207  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  33.19 
 
 		 495 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  33.19 
 
 		 495 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  33.19 
 
 		 495 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1752  methyl viologen resistance protein SmvA  33.19 
 
 		 495 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  35.33 
 
 		 501 aa  204  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.138936 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  34.99 
 
 		 522 aa  204  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 		 503 aa  204  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  35.27 
 
 		 509 aa  202  9e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>