More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6956 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6956  isochorismatase-family hydrolase  100 
 
 
198 aa  390  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0402515  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0893  isochorismatase hydrolase  43.75 
 
 
226 aa  150  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  39.57 
 
 
187 aa  128  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  40.91 
 
 
189 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  40.53 
 
 
189 aa  122  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  39.15 
 
 
197 aa  122  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  44.38 
 
 
189 aa  121  8e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  38.97 
 
 
195 aa  118  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  41.38 
 
 
174 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  33.84 
 
 
197 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  36.42 
 
 
186 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3865  isochorismatase hydrolase  36.18 
 
 
189 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368607  normal  0.282134 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3979  isochorismatase hydrolase  36.18 
 
 
189 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627608  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4198  isochorismatase hydrolase  36.41 
 
 
189 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0806995 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0364  putative isochorismate hydrolase  36.36 
 
 
223 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4618  isochorismatase hydrolase  37.57 
 
 
218 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5005  putative isochorismatase hydrolase  35.9 
 
 
189 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454976  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6682  isochorismatase hydrolase  35.87 
 
 
212 aa  101  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0745  isochorismatase hydrolase  36.13 
 
 
211 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00955139 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3668  isochorismatase hydrolase  37.1 
 
 
243 aa  99.8  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.856402 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5339  isochorismatase hydrolase  35.08 
 
 
217 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.472338  normal  0.0895037 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3421  isochorismatase hydrolase  35.08 
 
 
217 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4947  isochorismatase hydrolase  35.08 
 
 
217 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000317708 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4889  isochorismatase hydrolase  34.97 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000690458 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4372  isochorismatase hydrolase  33.88 
 
 
211 aa  91.7  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.010386 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2669  isochorismatase hydrolase  31.49 
 
 
186 aa  86.3  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2725  isochorismatase hydrolase  31.49 
 
 
186 aa  86.3  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4146  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
183 aa  84  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0661023  normal  0.63192 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  27.46 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  30.05 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  29.57 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0217  isochorismatase hydrolase family protein  28.8 
 
 
211 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000108628  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0155  hypothetical protein  38.33 
 
 
135 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.586581  normal  0.969052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  28.71 
 
 
228 aa  71.2  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  30.05 
 
 
231 aa  71.2  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  28.96 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  28.96 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  28.96 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4714  isochorismatase hydrolase  38.18 
 
 
196 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  30.11 
 
 
248 aa  70.5  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  28.96 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  30.6 
 
 
241 aa  70.1  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  26.34 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  26.34 
 
 
185 aa  69.7  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  28.42 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  27.64 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  30.21 
 
 
258 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.418934 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  29.9 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  29.9 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  29.9 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  33.79 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  29.9 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  29.9 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  29.9 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  28.42 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  30.48 
 
 
230 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  26.37 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  31.15 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  30 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  26.37 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  26.92 
 
 
200 aa  67.8  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  29.51 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  29.9 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  31.05 
 
 
240 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  30.41 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  28.87 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  29.63 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  31.05 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  29.63 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  37.08 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  29.63 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  29.63 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  29.63 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3766  isochorismatase hydrolase  34.97 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.716861  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  33.87 
 
 
248 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  33.87 
 
 
248 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  33.87 
 
 
247 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3789  isochorismatase hydrolase  29.3 
 
 
208 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 
218 aa  63.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2306  isochorismatase hydrolase  28.02 
 
 
246 aa  64.3  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5030  Isochorismatase  28.65 
 
 
207 aa  63.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.54727 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  25.93 
 
 
205 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  25.87 
 
 
195 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  35.35 
 
 
247 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  27.81 
 
 
230 aa  62.8  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  30.3 
 
 
230 aa  62.8  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  30.85 
 
 
199 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  28.95 
 
 
188 aa  62.4  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  28.33 
 
 
246 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  31.77 
 
 
188 aa  62  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  28.57 
 
 
231 aa  62  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 
240 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  27.08 
 
 
230 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1936  isochorismatase hydrolase  31.89 
 
 
207 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  26.84 
 
 
240 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  33.03 
 
 
226 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  33.03 
 
 
226 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  30.69 
 
 
226 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>