295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6952 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  100 
 
 
178 aa  362  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.67 
 
 
188 aa  157  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.39 
 
 
199 aa  144  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  40.33 
 
 
178 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  41.85 
 
 
183 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4303  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.32 
 
 
208 aa  130  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933393  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.97 
 
 
188 aa  129  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.1 
 
 
192 aa  127  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  43.18 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  39.44 
 
 
181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.16 
 
 
192 aa  120  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.46 
 
 
180 aa  120  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  37.22 
 
 
183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  39.44 
 
 
180 aa  117  7e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.11 
 
 
176 aa  117  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.16 
 
 
182 aa  117  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  41.57 
 
 
179 aa  116  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.13 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  40.33 
 
 
188 aa  114  6e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  34.25 
 
 
181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  39.25 
 
 
199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  36.98 
 
 
190 aa  111  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.63 
 
 
188 aa  111  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.96 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  38.55 
 
 
178 aa  110  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.69 
 
 
194 aa  108  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  35.45 
 
 
189 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  36.88 
 
 
177 aa  108  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  34.81 
 
 
181 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.22 
 
 
186 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  34.57 
 
 
182 aa  107  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  35.83 
 
 
180 aa  106  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  36.13 
 
 
188 aa  104  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  30.43 
 
 
185 aa  103  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.22 
 
 
187 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  36.08 
 
 
215 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.43 
 
 
188 aa  102  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  37.31 
 
 
204 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  34.78 
 
 
181 aa  101  6e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.95 
 
 
181 aa  101  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  34.97 
 
 
183 aa  101  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.7 
 
 
188 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  36.7 
 
 
188 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  33.33 
 
 
179 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.57 
 
 
204 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  32.97 
 
 
172 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  36.7 
 
 
188 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.57 
 
 
221 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.45 
 
 
187 aa  99.4  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.22 
 
 
187 aa  98.6  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.41 
 
 
183 aa  98.6  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.57 
 
 
204 aa  97.8  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.43 
 
 
188 aa  97.1  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  34.57 
 
 
187 aa  97.1  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  35.29 
 
 
199 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  34.74 
 
 
188 aa  96.3  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  34.03 
 
 
198 aa  95.5  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32 
 
 
189 aa  95.5  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  36.49 
 
 
167 aa  94.7  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.16 
 
 
181 aa  94.7  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.58 
 
 
183 aa  93.6  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1010  bifunctional deaminase-reductase-like  34.2 
 
 
221 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1147  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.12 
 
 
183 aa  93.6  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000436586 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.15 
 
 
193 aa  94  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.68 
 
 
187 aa  93.6  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3561  deaminase-reductase domain-containing protein  38.26 
 
 
180 aa  94  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0136  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.05 
 
 
212 aa  93.2  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  34.01 
 
 
196 aa  92.4  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0471  deaminase-reductase domain-containing protein  35.29 
 
 
184 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0146314  normal  0.097517 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1797  deaminase-reductase domain-containing protein  32.64 
 
 
219 aa  92  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.558254  hitchhiker  0.000529334 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.25 
 
 
186 aa  91.7  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  32.81 
 
 
218 aa  91.3  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.07 
 
 
187 aa  91.3  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.99 
 
 
221 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0488933  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.22 
 
 
217 aa  90.5  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.98 
 
 
203 aa  90.5  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.76 
 
 
187 aa  90.1  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3816  deaminase-reductase domain-containing protein  34.81 
 
 
187 aa  89.4  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.600873  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.73 
 
 
201 aa  89.4  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.81 
 
 
185 aa  90.1  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.22 
 
 
190 aa  89  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2883  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.02 
 
 
188 aa  89  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518785 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.52 
 
 
182 aa  88.2  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3644  hypothetical protein  38.76 
 
 
190 aa  88.2  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.2 
 
 
178 aa  88.2  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3935  deaminase-reductase domain-containing protein  35.48 
 
 
181 aa  86.3  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0619635  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  29.61 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  32.46 
 
 
200 aa  86.3  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  34 
 
 
195 aa  86.3  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.87 
 
 
185 aa  85.9  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.54 
 
 
204 aa  85.9  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.97 
 
 
182 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.43 
 
 
182 aa  85.5  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  32.42 
 
 
182 aa  84.7  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2826  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.09 
 
 
221 aa  84.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676201  normal  0.258226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5175  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.69 
 
 
219 aa  84.3  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0126564 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0286  bifunctional deaminase-reductase-like  35.8 
 
 
178 aa  83.6  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.742257  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.9 
 
 
177 aa  83.6  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.68 
 
 
184 aa  83.6  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.67 
 
 
177 aa  82.8  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>