262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6916 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6916  hypothetical protein  100 
 
 
399 aa  806    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1605  Radical SAM domain protein  66.92 
 
 
410 aa  551  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13217  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5726  radical SAM domain-containing protein  55.95 
 
 
414 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0512  Radical SAM domain protein  53.13 
 
 
815 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.663169  normal  0.326238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0440  Radical SAM domain protein  50.93 
 
 
389 aa  356  3.9999999999999996e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.64062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2654  radical SAM domain-containing protein  50.28 
 
 
781 aa  347  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0138301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6513  Radical SAM domain protein  46.51 
 
 
418 aa  344  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.214971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7955  Radical SAM domain protein  47.47 
 
 
794 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.025578  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0901  Radical SAM domain protein  38.48 
 
 
414 aa  267  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.912701 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2646  radical SAM family protein  35.36 
 
 
723 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3007  Radical SAM domain protein  27.53 
 
 
431 aa  113  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4347  radical SAM domain-containing protein  23.98 
 
 
413 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  23.84 
 
 
385 aa  104  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  23.84 
 
 
385 aa  103  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  23.84 
 
 
385 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  23.84 
 
 
385 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  23.84 
 
 
385 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  24.02 
 
 
369 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  23.84 
 
 
385 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  23.84 
 
 
385 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  23.84 
 
 
385 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  24.36 
 
 
370 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2994  Radical SAM domain protein  22.93 
 
 
366 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00145585  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  26.97 
 
 
381 aa  95.1  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  24.09 
 
 
383 aa  94  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  22.1 
 
 
370 aa  92.4  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  25.14 
 
 
438 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1732  radical SAM domain-containing protein  22.99 
 
 
393 aa  90.9  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0603581  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  22.87 
 
 
391 aa  90.5  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  22.87 
 
 
391 aa  90.5  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  25.35 
 
 
280 aa  90.5  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  22.58 
 
 
391 aa  89.4  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  25.13 
 
 
397 aa  89  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3367  putative sulfatase regulator  25.21 
 
 
408 aa  87  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.917343 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  26.1 
 
 
411 aa  86.7  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  25.2 
 
 
411 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  26.65 
 
 
411 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133586  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  27.81 
 
 
485 aa  85.9  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0932  putative sulfatase regulator  25.21 
 
 
408 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4120  arylsulfatase-activating protein AslB  26.76 
 
 
411 aa  85.1  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000574144  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0985  radical SAM domain-containing protein  25.21 
 
 
408 aa  85.5  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.43 
 
 
431 aa  84.3  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  25.28 
 
 
405 aa  84.3  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2436  Radical SAM domain protein  22.89 
 
 
407 aa  84  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  26.35 
 
 
444 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.15 
 
 
431 aa  83.2  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.15 
 
 
431 aa  82.8  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  25.55 
 
 
411 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.88 
 
 
447 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  26.29 
 
 
411 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  26.33 
 
 
414 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  26.29 
 
 
411 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4972  putative arylsulfatase regulatory protein  36.36 
 
 
370 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.86 
 
 
431 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03675  predicted regulator of arylsulfatase activity  24.66 
 
 
411 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00136934  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03624  hypothetical protein  24.66 
 
 
411 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  21.93 
 
 
368 aa  80.5  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  23.68 
 
 
428 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 
402 aa  79.3  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.95 
 
 
395 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0597  putative arylsulfatase regulatory protein  22.59 
 
 
401 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.95 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  26.73 
 
 
397 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.95 
 
 
396 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  26.24 
 
 
394 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  26.11 
 
 
394 aa  76.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.45 
 
 
398 aa  76.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  26.24 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.68 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0795005 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0763  Radical SAM domain protein  21.73 
 
 
407 aa  74.3  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  25.71 
 
 
394 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  36.25 
 
 
344 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2075  putative arylsulfatase regulatory protein  22.22 
 
 
399 aa  73.6  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  23.53 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0045  Radical SAM domain protein  20.65 
 
 
374 aa  73.2  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1683  radical SAM family protein  28.76 
 
 
460 aa  72.4  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24704  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0156  radical SAM domain-containing protein  36.07 
 
 
377 aa  72  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  21.47 
 
 
433 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  21.68 
 
 
398 aa  70.1  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  24.01 
 
 
398 aa  70.1  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  25.07 
 
 
477 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  32.87 
 
 
481 aa  69.7  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3282  Radical SAM domain protein  22.28 
 
 
393 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3642  Radical SAM domain protein  28.09 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3638  Radical SAM domain protein  28.09 
 
 
403 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.775121  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  26.9 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.73 
 
 
398 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  20.62 
 
 
435 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  21.01 
 
 
439 aa  67.8  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  24.73 
 
 
452 aa  67.4  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2073  radical SAM domain-containing protein  21.27 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0151054  normal  0.88541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1902  radical SAM domain-containing protein  21.27 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04221  putative arylsulfatase regulatory protein  22.92 
 
 
391 aa  67.4  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2137  Radical SAM domain protein  28.05 
 
 
401 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  20.9 
 
 
435 aa  67  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.73 
 
 
398 aa  66.6  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.73 
 
 
398 aa  66.6  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  20.4 
 
 
435 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  31.33 
 
 
484 aa  66.6  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  33.78 
 
 
457 aa  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.136582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>