More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6908 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6908  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  651    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4666  protein of unknown function DUF21  55.76 
 
 
337 aa  288  7e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0118  hypothetical protein  51.84 
 
 
344 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.667221  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1369  hypothetical protein  49.41 
 
 
354 aa  269  4e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.791695  hitchhiker  0.00309173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1410  hypothetical protein  48.52 
 
 
354 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.42093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5780  protein of unknown function DUF21  47.67 
 
 
353 aa  256  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1940  protein of unknown function DUF21  44.62 
 
 
336 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.177932  normal  0.094391 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24010  CBS domain-containing protein  44.97 
 
 
358 aa  239  2.9999999999999997e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.864311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0048  hypothetical protein  47.19 
 
 
334 aa  236  6e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.783092  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1686  CBS  41.62 
 
 
340 aa  228  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3478  hypothetical protein  44.48 
 
 
332 aa  225  9e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3491  hypothetical protein  44.48 
 
 
332 aa  225  9e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648386  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3541  hypothetical protein  44.48 
 
 
332 aa  225  9e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5678  protein of unknown function DUF21  42.38 
 
 
347 aa  224  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400614  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05870  CBS domain-containing protein  40.24 
 
 
342 aa  217  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0413  protein of unknown function DUF21  43.5 
 
 
333 aa  217  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3860  protein of unknown function DUF21  44.51 
 
 
350 aa  216  5e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00358184  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2682  hypothetical protein  42.64 
 
 
332 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2794  protein of unknown function DUF21  42.56 
 
 
340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0446  protein of unknown function DUF21  42.02 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3861  hypothetical protein  44.17 
 
 
332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.14179 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0016  protein of unknown function DUF21  41.72 
 
 
334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.430522  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2370  protein of unknown function DUF21  38.48 
 
 
355 aa  208  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.1834 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2950  protein of unknown function DUF21  43.44 
 
 
341 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3000  hypothetical protein  39.46 
 
 
355 aa  204  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.911183  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1953  hypothetical protein  40.56 
 
 
348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2483  protein of unknown function DUF21  37.96 
 
 
365 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2815  hypothetical protein  37.35 
 
 
351 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2859  hypothetical protein  37.35 
 
 
351 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2842  hypothetical protein  37.35 
 
 
351 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3365  hypothetical protein  37.76 
 
 
353 aa  195  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3095  hypothetical protein  36.87 
 
 
353 aa  195  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0319  protein of unknown function DUF21  37.5 
 
 
342 aa  192  5e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000713194  normal  0.0140808 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1235  protein of unknown function DUF21  38.82 
 
 
346 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5345  protein of unknown function DUF21  37.39 
 
 
348 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31510  CBS domain-containing protein  35.94 
 
 
346 aa  187  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  34.77 
 
 
437 aa  186  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1721  protein of unknown function DUF21  37.03 
 
 
357 aa  186  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3114  hypothetical protein  37.5 
 
 
345 aa  185  9e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3663  hypothetical protein  34.64 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22520  CBS domain-containing protein  35.82 
 
 
351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0313025  normal  0.775283 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0062  protein of unknown function DUF21  34.64 
 
 
346 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0913  hypothetical protein  37.69 
 
 
365 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471869  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2642  hypothetical protein  33.73 
 
 
356 aa  176  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2318  protein of unknown function DUF21  36.6 
 
 
357 aa  175  8e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  31.45 
 
 
446 aa  174  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0361  CBS domain-containing protein  29.13 
 
 
449 aa  172  5e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2765  protein of unknown function DUF21  35.26 
 
 
358 aa  172  5.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.850743  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1382  protein of unknown function DUF21  30.33 
 
 
446 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2961  protein of unknown function DUF21  35.4 
 
 
376 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.192256  hitchhiker  0.00460853 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09600  CBS domain-containing protein  35.12 
 
 
346 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2719  hypothetical protein  35.01 
 
 
349 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.244319  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6403  hypothetical protein  37.2 
 
 
335 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  30.43 
 
 
430 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  32.62 
 
 
446 aa  170  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  31.04 
 
 
432 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2723  protein of unknown function DUF21  34.03 
 
 
443 aa  169  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2388  protein of unknown function DUF21  33.73 
 
 
442 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0507  protein of unknown function DUF21  37.27 
 
 
366 aa  168  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11869  hypothetical protein  33.94 
 
 
345 aa  168  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000548462  normal  0.224514 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0742  hypothetical protein  29.56 
 
 
449 aa  168  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0726  hypothetical protein  29.56 
 
 
449 aa  168  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2377  protein of unknown function DUF21  35.01 
 
 
356 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000976861 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  30.75 
 
 
432 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  27.41 
 
 
435 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  27.41 
 
 
435 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  27.41 
 
 
435 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  27.41 
 
 
435 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07760  CBS domain-containing protein  37.96 
 
 
352 aa  166  4e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  27.41 
 
 
435 aa  166  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  27.41 
 
 
435 aa  165  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  27.11 
 
 
435 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  28.74 
 
 
448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  27.11 
 
 
435 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  31.23 
 
 
432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  29.94 
 
 
446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2371  protein of unknown function DUF21  33.53 
 
 
490 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.304604 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  30.61 
 
 
438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0575  CBS domain-containing protein  30.93 
 
 
361 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0608  CBS domain-containing protein  30.93 
 
 
361 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  27.81 
 
 
435 aa  162  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  30.93 
 
 
432 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  30.93 
 
 
432 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0117  hypothetical protein  33.85 
 
 
440 aa  161  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.852884  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  29.55 
 
 
432 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  29.32 
 
 
428 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4594  hypothetical protein  36.47 
 
 
442 aa  161  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6404  hypothetical protein  35.33 
 
 
452 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  32.01 
 
 
443 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  27.41 
 
 
434 aa  161  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  30.77 
 
 
440 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2962  protein of unknown function DUF21  34.03 
 
 
486 aa  159  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387429  hitchhiker  0.00195258 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4692  magnesium and cobalt efflux protein CorC  29.61 
 
 
425 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200662  hitchhiker  0.0000000000000291685 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1223  protein of unknown function DUF21  38.01 
 
 
347 aa  160  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.166933  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1725  hypothetical protein  30.82 
 
 
440 aa  159  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  27.5 
 
 
435 aa  159  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0455  conserved hypothetical protein, putative efflux protein (DUF21 domain protein)  29.69 
 
 
456 aa  159  9e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.844865  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0921  protein of unknown function DUF21  32.92 
 
 
443 aa  158  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  30.47 
 
 
442 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  30.18 
 
 
442 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>