79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6868 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6868  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  602  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2326  hypothetical protein  74.58 
 
 
301 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.402322 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1658  protein of unknown function DUF75  61.54 
 
 
304 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14850  ATP-grasp superfamily enzyme  56.04 
 
 
307 aa  342  5e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0926  hypothetical protein  55.52 
 
 
313 aa  323  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5325  protein of unknown function DUF75  54.24 
 
 
298 aa  315  7e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1722  hypothetical protein  53.87 
 
 
306 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.000637714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1737  hypothetical protein  53.2 
 
 
306 aa  310  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226503  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5648  protein of unknown function DUF75  52.36 
 
 
307 aa  308  5.9999999999999995e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.424673 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3749  hypothetical protein  49.66 
 
 
301 aa  299  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0709366  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1579  protein of unknown function DUF75  48.03 
 
 
314 aa  289  4e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1247  hypothetical protein  50.16 
 
 
312 aa  288  9e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0984474 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0798  protein of unknown function DUF75  50.17 
 
 
319 aa  285  7e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4966  protein of unknown function DUF75  46.31 
 
 
304 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5208  hypothetical protein  49.17 
 
 
307 aa  281  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00169383  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2219  hypothetical protein  47.47 
 
 
334 aa  279  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.849197  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2162  hypothetical protein  47.47 
 
 
334 aa  279  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530975  hitchhiker  0.00210211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2173  hypothetical protein  47.47 
 
 
334 aa  279  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1266  protein of unknown function DUF75  51.43 
 
 
312 aa  276  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.825703  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2427  protein of unknown function DUF75  53.6 
 
 
315 aa  275  7e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22940  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  46.08 
 
 
312 aa  271  8.000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.15902 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3951  hypothetical protein  45.57 
 
 
330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0028  hypothetical protein  48.04 
 
 
310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2446  hypothetical protein  44.26 
 
 
329 aa  263  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.211453 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1509  protein of unknown function DUF75  46.2 
 
 
311 aa  258  7e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0466221  normal  0.187119 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1825  protein of unknown function DUF75  45.13 
 
 
311 aa  256  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2127  protein of unknown function DUF75  51.18 
 
 
316 aa  256  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12728  hypothetical protein  45.18 
 
 
324 aa  255  6e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1614  hypothetical protein  45.39 
 
 
312 aa  249  5e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125325  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2852  hypothetical protein  43.52 
 
 
311 aa  248  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1608  protein of unknown function DUF75  43.52 
 
 
312 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000205047 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16730  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  41.86 
 
 
348 aa  237  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2232  protein of unknown function DUF75  41.2 
 
 
342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1060  protein of unknown function DUF75  43.97 
 
 
310 aa  232  6e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419014  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13300  Protein of unknown function DUF75  40.94 
 
 
318 aa  204  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00661171  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10660  Protein of unknown function DUF75  38.17 
 
 
325 aa  200  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.120435  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15610  Protein of unknown function DUF75  34.92 
 
 
353 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5919  hypothetical protein  28.22 
 
 
284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3162  hypothetical protein  30.26 
 
 
296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3212  hypothetical protein  29.93 
 
 
296 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.550185  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3150  hypothetical protein  29.93 
 
 
296 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0142521  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  28.33 
 
 
299 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1548  protein of unknown function DUF75  28.12 
 
 
279 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2210  protein of unknown function DUF75  29.15 
 
 
298 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3475  hypothetical protein  28.57 
 
 
296 aa  106  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3052  hypothetical protein  28.23 
 
 
292 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2143  protein of unknown function DUF75  27.24 
 
 
301 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0211773  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  26.67 
 
 
281 aa  103  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2630  hypothetical protein  27.43 
 
 
282 aa  102  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2444  protein of unknown function DUF75  27.72 
 
 
288 aa  102  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2290  protein of unknown function DUF75  29.93 
 
 
286 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5826  protein of unknown function DUF75  26.33 
 
 
297 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22756  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1855  hypothetical protein  27.37 
 
 
284 aa  99.8  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.982924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4500  hypothetical protein  25.17 
 
 
282 aa  96.3  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00701907 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2785  protein of unknown function DUF75  25.52 
 
 
286 aa  96.3  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000787132  hitchhiker  0.0000705422 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22220  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  27.49 
 
 
290 aa  95.9  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.737687 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  21.92 
 
 
311 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0447  hypothetical protein  24.29 
 
 
277 aa  91.7  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000016468  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12157  hypothetical protein  26.76 
 
 
292 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00120164  normal  0.853503 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16230  Protein of unknown function DUF75  28.16 
 
 
269 aa  90.5  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1842  protein of unknown function DUF75  25.62 
 
 
294 aa  89  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5396  protein of unknown function DUF75  26.94 
 
 
302 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2324  hypothetical protein  25.87 
 
 
289 aa  87.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.102651  decreased coverage  0.000172466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2170  hypothetical protein  25.26 
 
 
289 aa  86.3  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260059  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2670  protein of unknown function DUF75  25.59 
 
 
286 aa  85.5  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361609  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13900  ATP-grasp superfamily enzyme  26.62 
 
 
286 aa  84.3  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331595  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  26.13 
 
 
285 aa  82  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2246  protein of unknown function DUF75  25.35 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640776  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1173  hypothetical protein  24.91 
 
 
283 aa  75.9  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  25.09 
 
 
296 aa  74.7  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1912  protein of unknown function DUF75  24.65 
 
 
301 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000183665 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20950  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  22.61 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1837  protein of unknown function DUF75  27.39 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4890  hypothetical protein  24.13 
 
 
280 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11820  ATP-grasp superfamily enzyme  26.53 
 
 
316 aa  71.2  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485047  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2169  hypothetical protein  25.26 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0362139  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  25.26 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2640  hypothetical protein  24.41 
 
 
280 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512604  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3209  hypothetical protein  23.75 
 
 
312 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>