23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6861 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6861  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  168  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.178172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3388  gas vesicle protein GVPa  70.27 
 
 		 87 aa  97.1  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.185348  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2349  gas vesicle protein GVPa  48 
 
 		 104 aa  68.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.364276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2340  gas vesicle protein GVPa  69.77 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2387  gas vesicle protein GVPa  69.77 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2381  gas vesicle protein GVPa  69.77 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.817742  normal  0.389389 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4700  gas vesicle protein GVPa  69.81 
 
 		 65 aa  60.1  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1803  gas vesicle protein GVPa  54.35 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0704  hypothetical protein  46.77 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4702  gas vesicle protein GVPa  40.98 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1813  gas vesicle protein GVPa  45.45 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0694  putative gas vesicle synthesis protein  40.91 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.783723 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1260  gas vesicle protein GVPa  35.19 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128453  normal  0.705808 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1262  gas vesicle protein GVPa  46.34 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.026389  normal  0.71927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0075  gas vesicle protein GVPa  40.91 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0645865  decreased coverage  0.000500428 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2351  gas vesicle protein GVPa  46.34 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2335  gas vesicle protein GVPa  43.9 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00675738 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2330  gas vesicle protein GVPa  47.5 
 
 		 103 aa  42  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032613 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0071  gas vesicle protein GVPa  44.68 
 
 		 230 aa  41.6  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0463018  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2405  gas vesicle protein GVPa  39.53 
 
 		 119 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6859  hypothetical protein  43.14 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2408  gas vesicle protein GVPa  31.75 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3580  gas vesicle protein GVPa  36.17 
 
 		 104 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>