159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6847 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  100 
 
 		 188 aa  368  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  46.94 
 
 		 197 aa  151  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  50.81 
 
 		 182 aa  141  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  46.96 
 
 		 210 aa  105  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  43.36 
 
 		 178 aa  105  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  47.12 
 
 		 180 aa  104  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  40.46 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  44.92 
 
 		 244 aa  99.8  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  40.5 
 
 		 174 aa  97.8  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  40.5 
 
 		 174 aa  97.8  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5679  copper resistance protein CopC  47.25 
 
 		 184 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241881 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  37.42 
 
 		 206 aa  89.4  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  33.67 
 
 		 207 aa  89.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  37.74 
 
 		 226 aa  89  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 		 184 aa  88.2  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  38.57 
 
 		 226 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  35.33 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  49.5 
 
 		 284 aa  85.9  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  37.76 
 
 		 170 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5210  copper resistance protein CopC  41.84 
 
 		 434 aa  85.9  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  36.69 
 
 		 172 aa  84.3  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  36.88 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  36.63 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  32.1 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  35.62 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  34.76 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  39.2 
 
 		 559 aa  79  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4979  hypothetical protein  31.87 
 
 		 198 aa  77.8  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  34.31 
 
 		 869 aa  75.9  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  39.8 
 
 		 118 aa  74.3  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  39.32 
 
 		 208 aa  74.3  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  38.52 
 
 		 189 aa  72.8  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  39.39 
 
 		 265 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  43.75 
 
 		 593 aa  71.6  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  29.68 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  30.53 
 
 		 565 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  30.05 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  30.72 
 
 		 560 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  40.62 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  30.53 
 
 		 564 aa  69.3  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  37.19 
 
 		 578 aa  67.8  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  37.39 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  39.29 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  36.07 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  39 
 
 		 607 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  40 
 
 		 551 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  29.32 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  36.44 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  36.26 
 
 		 605 aa  65.1  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  32.12 
 
 		 613 aa  64.7  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  35 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  32.52 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  34.21 
 
 		 528 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  36.89 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  26.23 
 
 		 544 aa  62.8  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  25.78 
 
 		 547 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  25 
 
 		 549 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  32.67 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  32.67 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  25 
 
 		 544 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  25.41 
 
 		 547 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  34.82 
 
 		 121 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0381  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  34.82 
 
 		 121 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  31.05 
 
 		 588 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  27.13 
 
 		 547 aa  60.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  27.13 
 
 		 549 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  33.65 
 
 		 121 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  24.59 
 
 		 544 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  24.59 
 
 		 544 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1429  copper resistance protein CopC  31.93 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  37.37 
 
 		 519 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  33.06 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5005  copper resistance protein CopC  33.57 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  34.82 
 
 		 546 aa  60.1  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  31.67 
 
 		 590 aa  59.3  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0602  copper resistance protein CopC  39.51 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000550062 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3575  copper resistance protein CopC  42.39 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.310709  normal  0.0481479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  31.85 
 
 		 576 aa  58.5  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36820  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  32.74 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00403371  normal  0.543816 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  33.04 
 
 		 121 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  34.33 
 
 		 130 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  30.58 
 
 		 119 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  33.62 
 
 		 513 aa  56.6  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  29.17 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3812  copper resistance protein CopC  37.1 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.994582  normal  0.824411 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  32.76 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  32.35 
 
 		 424 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4567  copper resistance protein CopC  29.6 
 
 		 272 aa  55.1  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  37.89 
 
 		 649 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  27.33 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  31.9 
 
 		 124 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  31.9 
 
 		 124 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  31.9 
 
 		 124 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1742  copper resistance protein CopC  31.03 
 
 		 137 aa  53.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  31.9 
 
 		 124 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  31.9 
 
 		 124 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  30.77 
 
 		 571 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>