More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6826 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 
447 aa  885    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2314  histidine kinase  48.55 
 
 
450 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.697892  normal  0.500466 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0461  histidine kinase  50.67 
 
 
453 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.74 
 
 
457 aa  326  5e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  44.47 
 
 
454 aa  295  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1359  histidine kinase  41.32 
 
 
469 aa  272  8.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.31 
 
 
475 aa  260  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  0.0334865 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3372  histidine kinase  49.36 
 
 
465 aa  259  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1614  ATPase domain-containing protein  43.7 
 
 
455 aa  258  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.959517  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  38.7 
 
 
476 aa  250  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  40.21 
 
 
490 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3422  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  49.13 
 
 
464 aa  226  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2105  histidine kinase  41.98 
 
 
480 aa  222  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.922613 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.52 
 
 
490 aa  212  9e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5469  histidine kinase  51.26 
 
 
456 aa  212  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.14 
 
 
352 aa  211  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.238567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0101  Signal transduction histidine kinase-like protein  52.24 
 
 
472 aa  209  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1325  ATP-binding region ATPase domain protein  38.64 
 
 
505 aa  207  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0702  histidine kinase  34.97 
 
 
523 aa  196  1e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37490  signal transduction histidine kinase  45.76 
 
 
420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0924231  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01700  signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
492 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.560312  normal  0.659062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1555  histidine kinase  46.44 
 
 
442 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.7 
 
 
455 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  39.64 
 
 
452 aa  179  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1599  ATPase domain-containing protein  41.2 
 
 
453 aa  179  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 
469 aa  173  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.64 
 
 
504 aa  173  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 
509 aa  173  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  36.31 
 
 
469 aa  172  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1611  ATPase domain-containing protein  35.25 
 
 
452 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.584949  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
469 aa  172  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1595  ATPase domain-containing protein  45.92 
 
 
481 aa  171  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.147276  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13770  signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 
586 aa  167  4e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  33.58 
 
 
490 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
517 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
532 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
532 aa  166  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  32.18 
 
 
448 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
515 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  31.55 
 
 
461 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
470 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
469 aa  163  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  36.95 
 
 
486 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 
459 aa  160  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4533  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 
484 aa  160  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 
524 aa  159  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  38.23 
 
 
460 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  36.1 
 
 
506 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 
522 aa  158  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 
524 aa  157  3e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  33.49 
 
 
471 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3970  two component transcriptional regulator  37.82 
 
 
466 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.241078  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  32.89 
 
 
469 aa  152  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.3 
 
 
471 aa  152  8e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1011  sensor histidine kinase  32.56 
 
 
448 aa  152  8.999999999999999e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
464 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  33.54 
 
 
503 aa  152  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 
465 aa  152  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0838031  hitchhiker  0.00424045 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 
406 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  37.74 
 
 
481 aa  150  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  37 
 
 
466 aa  151  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
464 aa  151  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 
504 aa  150  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1491  histidine kinase  26.28 
 
 
444 aa  150  6e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2007  ATPase domain-containing protein  35.61 
 
 
508 aa  150  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.639881  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3275  histidine kinase  37.13 
 
 
487 aa  149  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  37.63 
 
 
471 aa  149  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  36.54 
 
 
470 aa  149  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1970  hypothetical protein  27.3 
 
 
449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.310408  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  31.2 
 
 
466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  37.92 
 
 
450 aa  147  3e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31280  signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
498 aa  147  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.035777  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1527  histidine kinase  39.22 
 
 
343 aa  147  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  35.62 
 
 
477 aa  144  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  34.06 
 
 
592 aa  144  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.56 
 
 
437 aa  143  5e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0193  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 
426 aa  143  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  36.01 
 
 
520 aa  142  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 
384 aa  142  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  34.71 
 
 
408 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5673  two-component regulatory system sensory histidine kinase  35.47 
 
 
462 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0195  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 
377 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
477 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 
469 aa  140  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  29.77 
 
 
386 aa  140  3.9999999999999997e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2798  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
490 aa  140  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000774606  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 
438 aa  140  4.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 
462 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  30.46 
 
 
477 aa  139  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
480 aa  138  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.179975 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3037  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 
509 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0190  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
487 aa  138  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.482621 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4589  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 
473 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 
473 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0338673  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5174  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 
503 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0198  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
563 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0571647  normal  0.0293056 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2166  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
455 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1850  histidine kinase  41.56 
 
 
554 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0903  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 
468 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.211263  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 
495 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>