More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6815 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  100 
 
 
452 aa  885    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  44.35 
 
 
411 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  64.25 
 
 
440 aa  252  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  54.82 
 
 
378 aa  227  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  53.42 
 
 
382 aa  224  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  53.55 
 
 
378 aa  216  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  55.45 
 
 
378 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  36.69 
 
 
412 aa  204  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  50.64 
 
 
369 aa  202  9e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  50.41 
 
 
356 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  52.24 
 
 
427 aa  199  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  52.34 
 
 
218 aa  195  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  53.99 
 
 
383 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  51.4 
 
 
365 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  51.4 
 
 
365 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  51.4 
 
 
365 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  56.72 
 
 
391 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  46.33 
 
 
402 aa  179  7e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  53.81 
 
 
364 aa  172  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  49.05 
 
 
215 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  44.95 
 
 
412 aa  170  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  61.7 
 
 
363 aa  163  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 
401 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  63.38 
 
 
370 aa  160  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  49.75 
 
 
322 aa  160  6e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  66.67 
 
 
366 aa  159  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  59.56 
 
 
137 aa  143  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  38.73 
 
 
209 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.99 
 
 
208 aa  127  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  37.07 
 
 
209 aa  127  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  41.29 
 
 
222 aa  124  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  41.29 
 
 
222 aa  124  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  37.25 
 
 
213 aa  124  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  38.42 
 
 
214 aa  122  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  36.89 
 
 
212 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  35.15 
 
 
200 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  39.51 
 
 
205 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  33.98 
 
 
253 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  39.81 
 
 
205 aa  114  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  35.64 
 
 
243 aa  114  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  34.5 
 
 
200 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  37.44 
 
 
235 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  36.71 
 
 
212 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  36.71 
 
 
212 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  44.78 
 
 
210 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 
211 aa  111  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  37.86 
 
 
220 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  31.73 
 
 
203 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  37.56 
 
 
229 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  37.56 
 
 
220 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  34.31 
 
 
203 aa  109  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  31.73 
 
 
203 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  31.73 
 
 
203 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 
213 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  37.56 
 
 
227 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  38.05 
 
 
221 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  38.05 
 
 
221 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  37.07 
 
 
220 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  37.07 
 
 
220 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  37.07 
 
 
220 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  37.07 
 
 
229 aa  107  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  37.56 
 
 
198 aa  107  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  33 
 
 
202 aa  106  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.67 
 
 
212 aa  106  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 
213 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  36.59 
 
 
229 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  31.25 
 
 
203 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  37.56 
 
 
221 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  37.38 
 
 
220 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  30.77 
 
 
203 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  30.77 
 
 
203 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  35.78 
 
 
202 aa  104  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  32.65 
 
 
196 aa  104  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  36.55 
 
 
198 aa  104  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  35.64 
 
 
213 aa  104  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  35.61 
 
 
220 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  37.07 
 
 
220 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  45.74 
 
 
132 aa  103  6e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.31 
 
 
201 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  47.83 
 
 
133 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  34.98 
 
 
201 aa  100  5e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  34.98 
 
 
212 aa  100  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  34.98 
 
 
201 aa  100  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  30.29 
 
 
203 aa  100  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 
217 aa  100  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  35.82 
 
 
212 aa  99.8  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  45.24 
 
 
253 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  34.52 
 
 
213 aa  99  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  45.24 
 
 
168 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
223 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  27.72 
 
 
212 aa  98.6  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  45.24 
 
 
253 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  37.44 
 
 
214 aa  99  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  30.62 
 
 
205 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  32.18 
 
 
212 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  37.7 
 
 
209 aa  98.2  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.74 
 
 
201 aa  97.8  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  37.07 
 
 
208 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  34.78 
 
 
240 aa  97.8  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  45.6 
 
 
198 aa  97.1  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>