More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6767 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0015  valyl-tRNA synthetase  65.51 
 
 
860 aa  1109    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139403  normal  0.950731 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09930  valyl-tRNA synthetase  61.03 
 
 
894 aa  1058    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231396  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2881  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  69.06 
 
 
858 aa  1152    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5200  valyl-tRNA synthetase  68.38 
 
 
876 aa  1147    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.725067  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1936  valyl-tRNA synthetase  69.58 
 
 
881 aa  1202    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1125  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  64.52 
 
 
916 aa  1074    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6767  valyl-tRNA synthetase  100 
 
 
845 aa  1709    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0832206 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1197  valyl-tRNA synthetase  55.98 
 
 
911 aa  966    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09690  valyl-tRNA synthetase  60.27 
 
 
895 aa  1040    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1581  aminoacyl-tRNA synthetase class Ia  68.48 
 
 
861 aa  1164    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1314  valyl-tRNA synthetase  67.5 
 
 
903 aa  1134    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0963  valyl-tRNA synthetase  64.1 
 
 
901 aa  1063    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1403  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  66.15 
 
 
886 aa  1091    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00382029  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09130  valyl-tRNA synthetase  62.24 
 
 
885 aa  1037    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0788672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3508  valyl-tRNA synthetase  67.39 
 
 
877 aa  1089    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633691  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0307  valyl-tRNA synthetase  55.42 
 
 
855 aa  860    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24280  valyl-tRNA synthetase  63.96 
 
 
906 aa  1068    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2292  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  79.67 
 
 
836 aa  1333    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.436685  normal  0.164077 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0192  valine--tRNA ligase  55.29 
 
 
925 aa  957    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0019  valyl-tRNA synthetase  65.25 
 
 
862 aa  1093    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.661225 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2401  valyl-tRNA synthetase  60.37 
 
 
873 aa  1043    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2593  valyl-tRNA synthetase  64.46 
 
 
902 aa  1057    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3473  valyl-tRNA synthetase  64.56 
 
 
871 aa  1056    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.560604  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1701  tRNA synthetase valyl/leucyl anticodon-binding protein  74.88 
 
 
846 aa  1259    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000331073  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2155  valyl-tRNA synthetase  60.67 
 
 
872 aa  1047    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123734 
 
 
-
 
NC_002978  WD0464  valyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 
864 aa  595  1e-169  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0088  valyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
802 aa  575  1.0000000000000001e-162  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0136  valyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 
808 aa  571  1e-161  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1241  valyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 
896 aa  528  1e-148  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3319  valyl-tRNA synthetase  35.64 
 
 
928 aa  501  1e-140  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0018  valyl-tRNA synthetase  37.41 
 
 
892 aa  496  1e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.910453  normal  0.161561 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1536  valyl-tRNA synthetase  36.64 
 
 
908 aa  494  9.999999999999999e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0205  valyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 
905 aa  488  1e-136  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.24706  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2626  valyl-tRNA synthetase  34.61 
 
 
865 aa  456  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1721  valyl-tRNA synthetase  34.97 
 
 
864 aa  448  1.0000000000000001e-124  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0309  valyl-tRNA synthetase  33.41 
 
 
886 aa  443  1e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1023  valyl-tRNA synthetase  33.49 
 
 
886 aa  444  1e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.17818  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1605  valyl-tRNA synthetase  34.08 
 
 
886 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1572  valyl-tRNA synthetase  34.2 
 
 
863 aa  442  9.999999999999999e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.330125  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2184  valyl-tRNA synthetase  33.09 
 
 
865 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1178  valyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 
858 aa  439  9.999999999999999e-123  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1456  valyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
886 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439058  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0807  valyl-tRNA synthetase  34.22 
 
 
855 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1976  valyl-tRNA synthetase  33.13 
 
 
869 aa  435  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2064  valyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 
863 aa  433  1e-120  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0944  valyl-tRNA synthetase  30.68 
 
 
906 aa  427  1e-118  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0325  valyl-tRNA synthetase  32.53 
 
 
809 aa  427  1e-118  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0403  valyl-tRNA synthetase  32.73 
 
 
865 aa  416  1e-114  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.52584  normal  0.0399554 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1497  valyl-tRNA synthetase  34.02 
 
 
799 aa  397  1e-109  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.702651  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1019  valyl-tRNA synthetase  34.39 
 
 
799 aa  393  1e-108  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000000648947 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1456  valyl-tRNA synthetase  32.85 
 
 
799 aa  387  1e-106  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1649  valyl-tRNA synthetase  33.75 
 
 
799 aa  387  1e-106  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.737664 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0166  valyl-tRNA synthetase  33.55 
 
 
806 aa  379  1e-103  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000560387  normal  0.070078 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1477  valyl-tRNA synthetase  30.68 
 
 
771 aa  376  1e-103  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1878  valyl-tRNA synthetase  30.59 
 
 
816 aa  363  9e-99  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0603  putative valyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 
877 aa  362  1e-98  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1683  valyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 
808 aa  345  2e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0962202  normal  0.0485293 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1109  valyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 
885 aa  302  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.25731 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0879  valyl-tRNA synthetase  29.9 
 
 
880 aa  299  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0658  valyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 
881 aa  299  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4355  valyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 
881 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4191  valyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 
881 aa  298  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4545  valyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 
881 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4690  valyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 
881 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4549  valyl-tRNA synthetase  28.1 
 
 
881 aa  298  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4576  valyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 
881 aa  297  4e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3530  valyl-tRNA synthetase  28.37 
 
 
943 aa  297  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.723438  normal  0.0830498 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12474  valyl-tRNA synthetase  29.4 
 
 
876 aa  297  5e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2474  valyl-tRNA synthetase  30.21 
 
 
891 aa  297  5e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1688  valyl-tRNA synthetase  29.65 
 
 
902 aa  297  6e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.524019 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3174  valyl-tRNA synthetase  27.62 
 
 
881 aa  297  6e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4202  valyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 
881 aa  296  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4303  valyl-tRNA synthetase  28.37 
 
 
881 aa  295  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7287  valyl-tRNA synthetase  30.37 
 
 
861 aa  295  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.429256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1535  valyl-tRNA synthetase  31.28 
 
 
883 aa  295  3e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0308753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4591  valyl-tRNA synthetase  27.98 
 
 
881 aa  295  3e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0513  valyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 
883 aa  294  4e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1723  valyl-tRNA synthetase  29.22 
 
 
912 aa  294  5e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.419395  hitchhiker  0.00814152 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3872  valyl-tRNA synthetase  30.14 
 
 
872 aa  293  8e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5994  valyl-tRNA synthetase  30.46 
 
 
874 aa  292  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.298309  normal  0.0937262 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0445  valyl-tRNA synthetase  29.13 
 
 
883 aa  291  3e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.262089  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2846  valyl-tRNA synthetase  29.56 
 
 
904 aa  291  5.0000000000000004e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.292827  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12260  valyl-tRNA synthetase  30.01 
 
 
882 aa  290  6e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2573  valyl-tRNA synthetase  29.47 
 
 
880 aa  290  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14590  valyl-tRNA synthetase  28.39 
 
 
882 aa  289  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3441  valyl-tRNA synthetase  29.18 
 
 
911 aa  288  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0294  valyl-tRNA synthetase  31.42 
 
 
882 aa  288  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3951  valyl-tRNA synthetase  29.01 
 
 
897 aa  288  4e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.594097  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3493  valyl-tRNA synthetase  29.19 
 
 
872 aa  287  5e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0959  valyl-tRNA synthetase  28.23 
 
 
950 aa  287  5e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3558  valyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 
883 aa  287  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462597  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3631  valyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 
883 aa  287  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0657894 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1392  valyl-tRNA synthetase  27.72 
 
 
902 aa  286  9e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0390871  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5880  valyl-tRNA synthetase  29.27 
 
 
903 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3563  valyl-tRNA synthetase  29.55 
 
 
883 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0532  valyl-tRNA synthetase  29.75 
 
 
880 aa  285  2.0000000000000002e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000120164  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6497  valyl-tRNA synthetase  28.59 
 
 
903 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1165  valyl-tRNA synthetase  29.33 
 
 
877 aa  285  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0322  valyl-tRNA synthetase  29.4 
 
 
894 aa  285  3.0000000000000004e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7290  valyl-tRNA synthetase  30.57 
 
 
882 aa  285  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0570872  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>