116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6683 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6683  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 188 aa  371  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  57.29 
 
 		 197 aa  201  6e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  55.38 
 
 		 197 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0942  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0072348  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4591  regulatory protein, TetR  50 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0937227  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5600  TetR family transcriptional regulator  49.71 
 
 		 279 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0144285  hitchhiker  0.006631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  48.74 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1957  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 205 aa  144  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  44.02 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  44.57 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2773  TetR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0242  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 208 aa  111  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3760  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.348424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3373  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.946701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3435  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0970833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3384  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4838  regulatory protein TetR  38.27 
 
 		 211 aa  95.1  5e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220923  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12279  transcriptional regulator  34.41 
 
 		 189 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 229 aa  67  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 232 aa  67  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0969  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.610377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  28.57 
 
 		 222 aa  53.9  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 239 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0746  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 193 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0760  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 193 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0740  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 193 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal  0.856133 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 223 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 196 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 223 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 183 aa  47.8  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 213 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6530  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.051486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 242 aa  45.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4502  putative transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 249 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 199 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 228 aa  45.1  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 216 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 255 aa  45.1  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 237 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 209 aa  43.9  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0369  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87327 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 225 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4718  TetR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 260 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  28.24 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  52.63 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  26.57 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1823  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 137 aa  42.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000376424  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 224 aa  42.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0767  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.504408  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 218 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 203 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  31.25 
 
 		 219 aa  41.6  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 194 aa  41.6  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  22.56 
 
 		 223 aa  42  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  41.6  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 228 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  21.51 
 
 		 198 aa  41.6  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 228 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 191 aa  41.6  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 228 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 232 aa  41.6  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 210 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 211 aa  41.6  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>