More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6682 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  100 
 
 
521 aa  1014    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  66.86 
 
 
528 aa  657    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  75.43 
 
 
532 aa  748    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  60.69 
 
 
518 aa  561  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  55.68 
 
 
529 aa  541  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  55.81 
 
 
527 aa  532  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  56.9 
 
 
540 aa  524  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  56.19 
 
 
525 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  56.19 
 
 
525 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  56.19 
 
 
525 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.86 
 
 
572 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  55.98 
 
 
545 aa  503  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  54.48 
 
 
527 aa  499  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  58.21 
 
 
521 aa  491  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  55.62 
 
 
524 aa  479  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  54.91 
 
 
520 aa  474  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  52.56 
 
 
531 aa  450  1e-125  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  49.16 
 
 
534 aa  412  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  50.09 
 
 
550 aa  411  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  39.93 
 
 
556 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.67 
 
 
531 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.59 
 
 
533 aa  335  9e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  39.93 
 
 
531 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  39.67 
 
 
531 aa  316  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.1 
 
 
534 aa  313  4.999999999999999e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  33.87 
 
 
563 aa  311  1e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  36.84 
 
 
552 aa  310  4e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  35.12 
 
 
583 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  35.23 
 
 
559 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  35.03 
 
 
584 aa  292  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  34.48 
 
 
557 aa  290  4e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.39 
 
 
565 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  33.45 
 
 
554 aa  284  3.0000000000000004e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  36.13 
 
 
538 aa  278  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  41.42 
 
 
546 aa  273  6e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.15 
 
 
568 aa  272  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  29.81 
 
 
586 aa  266  5e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.6 
 
 
536 aa  259  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.44 
 
 
579 aa  258  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.04 
 
 
564 aa  249  8e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.83 
 
 
535 aa  242  9e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  34.58 
 
 
532 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  35.8 
 
 
531 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  33.82 
 
 
527 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  32.7 
 
 
534 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  32.27 
 
 
502 aa  229  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1270  FAD linked oxidase-like  37.42 
 
 
532 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.544288 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  33.69 
 
 
534 aa  226  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.6 
 
 
520 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  37.94 
 
 
467 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.39 
 
 
510 aa  219  7.999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.47 
 
 
516 aa  217  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  32.34 
 
 
465 aa  217  4e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  36.07 
 
 
470 aa  217  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  33.97 
 
 
517 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.86 
 
 
516 aa  214  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  35.65 
 
 
520 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.73 
 
 
523 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  31.52 
 
 
513 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02617  predicted FAD containing dehydrogenase  28.6 
 
 
484 aa  183  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0916  FAD linked oxidase domain protein  28.6 
 
 
484 aa  183  8.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02580  hypothetical protein  28.6 
 
 
484 aa  183  8.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4029  FAD binding domain protein  28.6 
 
 
484 aa  182  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.637066 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2901  FAD binding domain-containing protein  28.81 
 
 
484 aa  182  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.468939  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0940  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.6 
 
 
484 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2912  FAD binding domain-containing protein  28.6 
 
 
484 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3074  FAD binding domain-containing protein  28.6 
 
 
484 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  30.23 
 
 
554 aa  177  3e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2461  alkylglycerone-phosphate synthase  27.47 
 
 
484 aa  172  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2367  FAD linked oxidase domain protein  29.79 
 
 
451 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3321  FAD linked oxidase domain protein  38.03 
 
 
572 aa  157  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0988206  normal  0.0174959 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  28.4 
 
 
459 aa  143  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  28.01 
 
 
459 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2664  putative D-lactate dehydrogenase (cytochrome) oxidoreductase protein  29.42 
 
 
472 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal  0.501651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5156  FAD linked oxidase domain protein  28.34 
 
 
479 aa  140  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0518  FAD linked oxidase domain protein  32.43 
 
 
472 aa  139  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.98 
 
 
470 aa  138  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2906  FAD linked oxidase domain protein  28.07 
 
 
462 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2031  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.63 
 
 
492 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1319  FAD linked oxidase domain protein  28.33 
 
 
457 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.07435e-25 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3977  putative FAD-binding oxidase  28.94 
 
 
471 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0995058 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.38 
 
 
469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2035  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.76 
 
 
475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0118217 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  30.23 
 
 
495 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1348  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.25 
 
 
470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  25.94 
 
 
470 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  25.94 
 
 
470 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1890  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.75 
 
 
461 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.180802 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3296  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.61 
 
 
473 aa  135  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0160978  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0721  FAD linked oxidase domain protein  28.73 
 
 
471 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.33027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2494  FAD linked oxidase domain protein  28.4 
 
 
472 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.94 
 
 
470 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.47 
 
 
469 aa  133  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101334  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  26.4 
 
 
461 aa  133  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1299  FAD linked oxidase-like  30.83 
 
 
456 aa  133  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.913204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.94 
 
 
470 aa  133  9e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  25.94 
 
 
470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0703  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.11 
 
 
469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.403494 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.73 
 
 
470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0735  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.91 
 
 
469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>