216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6680 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6680  thioesterase  100 
 
 
142 aa  293  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0588358  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4685  thioesterase superfamily protein  77.61 
 
 
138 aa  225  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  71.64 
 
 
136 aa  212  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  66.92 
 
 
137 aa  185  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  57.04 
 
 
175 aa  172  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4906  thioesterase superfamily protein  60.9 
 
 
142 aa  168  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.825665  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  54.48 
 
 
147 aa  166  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  53.73 
 
 
147 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1213  thioesterase superfamily protein  58.87 
 
 
150 aa  163  6.9999999999999995e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00301171  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  58.59 
 
 
153 aa  161  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  56.72 
 
 
149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  53.73 
 
 
153 aa  159  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  51.88 
 
 
143 aa  158  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  52.52 
 
 
188 aa  158  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  52.67 
 
 
143 aa  158  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  50.76 
 
 
164 aa  157  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  53.79 
 
 
203 aa  157  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  52.99 
 
 
162 aa  156  9e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000075245  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  54.2 
 
 
145 aa  155  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  54.96 
 
 
145 aa  155  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  52.99 
 
 
162 aa  155  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  53.33 
 
 
149 aa  154  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  53.44 
 
 
148 aa  154  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  54.2 
 
 
145 aa  153  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  54.2 
 
 
145 aa  153  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  52.99 
 
 
153 aa  152  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  54.55 
 
 
150 aa  153  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  53.44 
 
 
145 aa  152  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  53.44 
 
 
145 aa  152  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  53.44 
 
 
145 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3281  hypothetical protein  53.44 
 
 
150 aa  150  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.704366  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  54.4 
 
 
181 aa  151  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  54.4 
 
 
181 aa  150  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  54.4 
 
 
149 aa  150  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  54.4 
 
 
149 aa  150  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  54.4 
 
 
149 aa  150  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  54.4 
 
 
149 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  48.85 
 
 
147 aa  149  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  51.91 
 
 
145 aa  149  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  50.76 
 
 
147 aa  149  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  52.27 
 
 
155 aa  149  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153197  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  53.97 
 
 
147 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1902  thioesterase superfamily protein  52.67 
 
 
163 aa  147  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.119468 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  50.76 
 
 
160 aa  148  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  50.38 
 
 
142 aa  147  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  52.31 
 
 
153 aa  147  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  52.31 
 
 
153 aa  146  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  51.15 
 
 
144 aa  146  9e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  53.03 
 
 
147 aa  146  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  46.97 
 
 
148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  54.96 
 
 
143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  49.62 
 
 
145 aa  143  8.000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  54.2 
 
 
143 aa  142  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1026  thioesterase superfamily protein  51.91 
 
 
137 aa  142  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5810  thioesterase superfamily protein  50.75 
 
 
143 aa  141  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  49.21 
 
 
156 aa  140  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  56.64 
 
 
125 aa  140  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  48.85 
 
 
150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3146  thioesterase superfamily protein  48.85 
 
 
143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433869  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  48.09 
 
 
150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  49.19 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  49.19 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  49.19 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  45.32 
 
 
155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  48 
 
 
151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3272  thioesterase superfamily protein  44.03 
 
 
149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.96014  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07356  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16350)  38.89 
 
 
169 aa  105  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.374208 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1058  putative thioesterase  34.56 
 
 
151 aa  93.6  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0254  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
146 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0152562 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0279  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
146 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0269  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 
146 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4956  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000294278 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  31.01 
 
 
137 aa  67.4  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  26.89 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 
136 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  29.46 
 
 
154 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  28.68 
 
 
154 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
136 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  31.86 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  30.08 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  23.91 
 
 
138 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 
161 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
142 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  26.02 
 
 
139 aa  57.4  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
145 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  30.89 
 
 
134 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  29.13 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1442  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.444446  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
135 aa  55.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
136 aa  55.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  30.47 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  30.17 
 
 
140 aa  53.9  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 
148 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 
133 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>