99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6656 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6656  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  100 
 
 
222 aa  435  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2227  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  61.14 
 
 
229 aa  241  6e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20930  hypothetical protein  51.79 
 
 
221 aa  158  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.451934  normal  0.0186523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1874  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  46.64 
 
 
223 aa  141  1e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0168  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  44.29 
 
 
220 aa  134  1e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1492  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  55.86 
 
 
216 aa  128  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.619524  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5354  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  43.69 
 
 
204 aa  127  1e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0971  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.03 
 
 
269 aa  117  2e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301105  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0844  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  36.36 
 
 
249 aa  105  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.777561  hitchhiker  0.00161698 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0339  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.41 
 
 
241 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.30715 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5438  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.09 
 
 
154 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1748  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.53 
 
 
154 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2531  hypothetical protein  35.33 
 
 
161 aa  99  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0528604 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3679  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.85 
 
 
151 aa  98.2  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4327  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  38.85 
 
 
154 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.510988  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2073  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  36.3 
 
 
980 aa  95.9  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.576081  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5319  putative carbon monoxide dehydrogenase, coxG accessory protein  36.23 
 
 
148 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.500561 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1781  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  37.68 
 
 
153 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1598  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.97 
 
 
204 aa  92  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0365  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.73 
 
 
198 aa  91.7  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2608  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.09 
 
 
148 aa  90.9  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0470  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.33 
 
 
213 aa  90.9  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2052  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  36.03 
 
 
1011 aa  90.9  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.806962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1744  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  36.03 
 
 
1011 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.919932 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2185  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  36.3 
 
 
1012 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6673  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  37.9 
 
 
1019 aa  89  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.581747  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3097  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.51 
 
 
147 aa  88.6  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889249  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1630  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.97 
 
 
155 aa  88.2  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.442595  normal  0.5824 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  35.57 
 
 
152 aa  88.6  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  6.88113e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1464  hypothetical protein  32.51 
 
 
213 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.273128 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0056  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.1 
 
 
151 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.752516  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5890  xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit apoprotein  34.56 
 
 
1012 aa  86.7  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614012  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4356  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  32.61 
 
 
232 aa  85.9  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.51 
 
 
193 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2206  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.33 
 
 
148 aa  85.5  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0292084  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0573  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.86 
 
 
197 aa  85.5  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2963  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.65 
 
 
216 aa  85.1  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748718  normal  0.0394978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0040  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.88 
 
 
151 aa  84.3  1e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0072  putative carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.16 
 
 
246 aa  82.4  5e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766775  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32.88 
 
 
155 aa  82  6e-15  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4535  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.13 
 
 
202 aa  81.3  1e-14  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5862  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.97 
 
 
158 aa  81.3  1e-14  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0360  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  33.61 
 
 
187 aa  81.3  1e-14  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0006  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.33 
 
 
156 aa  80.5  2e-14  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0420  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.72 
 
 
182 aa  80.9  2e-14  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110218  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1349  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.51 
 
 
224 aa  80.1  3e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.224808  normal  0.101404 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1413  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.51 
 
 
224 aa  79.7  3e-14  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  0.135915 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0848  carbon-monoxide dehydrogenase  35.29 
 
 
997 aa  79.3  4e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.682595 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2253  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.1 
 
 
243 aa  79  5e-14  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0481685 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1141  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.69 
 
 
178 aa  77.8  1e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.654627  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1525  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.13 
 
 
176 aa  77.4  2e-13  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.187738  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3553  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.25 
 
 
157 aa  76.6  3e-13  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.530671  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3719  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  34.72 
 
 
983 aa  76.6  3e-13  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0644  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.57 
 
 
141 aa  76.3  4e-13  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0290775  normal  0.389247 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2879  hypothetical protein  29.49 
 
 
176 aa  76.3  4e-13  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.434233  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2661  putative carbon monoxide dehydrogenase  30.34 
 
 
176 aa  73.9  2e-12  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283506  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1814  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  34.65 
 
 
208 aa  72  6e-12  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96745  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3296  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  35.71 
 
 
987 aa  72  6e-12  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0204451  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0668  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding  35.34 
 
 
988 aa  70.9  2e-11  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295598  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0023  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.99 
 
 
152 aa  70.9  2e-11  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1301  aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase molybdopterin binding  35.54 
 
 
988 aa  67  2e-10  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.648743 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0298  hypothetical protein  28.57 
 
 
150 aa  66.6  3e-10  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2090  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  31.47 
 
 
151 aa  66.2  3e-10  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.679244  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1445  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32 
 
 
158 aa  66.2  4e-10  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.101992  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0284  hypothetical protein  28.57 
 
 
150 aa  66.2  4e-10  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.364944  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1283  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  32 
 
 
158 aa  66.2  4e-10  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.112632  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4723  carbon-monoxide dehydrogenase (acceptor)  35.29 
 
 
991 aa  65.5  6e-10  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102833  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0235  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.87 
 
 
139 aa  65.5  6e-10  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.548712  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10374  oxidoreductase  29.89 
 
 
200 aa  64.7  1e-09  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00057735  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0368  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.2 
 
 
152 aa  63.9  2e-09  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1231  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25.87 
 
 
150 aa  63.5  2e-09  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.99571  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3262  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.67 
 
 
253 aa  58.9  5e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234433  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3210  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.83 
 
 
237 aa  58.5  7e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.924727  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0120  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.93 
 
 
212 aa  57  2e-07  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.391115  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2034  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.82 
 
 
241 aa  57  2e-07  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2526  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.24 
 
 
181 aa  56.6  3e-07  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0569  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  21.68 
 
 
148 aa  56.6  3e-07  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0217411 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2767  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.15 
 
 
185 aa  56.2  4e-07  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0494  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.44 
 
 
222 aa  53.5  3e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462994  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3032  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  30.47 
 
 
225 aa  53.5  3e-06  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0343994  normal  0.0106587 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0505  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.44 
 
 
222 aa  53.5  3e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.746959  normal  0.248334 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0483  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.44 
 
 
222 aa  53.5  3e-06  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0704  hypothetical protein  26.67 
 
 
253 aa  52.4  5e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0213  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  23.66 
 
 
154 aa  52.4  5e-06  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4237  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  29.17 
 
 
469 aa  50.1  3e-05  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1564  carbon monoxide dehydrogenase, large subunit apoprotein  24.65 
 
 
1027 aa  50.1  3e-05  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.151361  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0232  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.35 
 
 
198 aa  48.1  9e-05  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0032  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  22.54 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.262475 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2147  putative carbon monoxide dehydrogenase, CoxG subunit  25.82 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.295033  normal  0.334057 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0474  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  25 
 
 
248 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0413426 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4689  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.4 
 
 
240 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.969168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4984  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.4 
 
 
240 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.990283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4601  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.4 
 
 
240 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1377  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.63 
 
 
149 aa  45.8  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.667187  normal  0.46376 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1636  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  26.14 
 
 
237 aa  45.8  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1572  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.4 
 
 
241 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615405  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0119  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  27.89 
 
 
147 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4562  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  28.24 
 
 
306 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3597  carbon monoxide dehydrogenase subunit G  24.16 
 
 
254 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0237636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>