226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6631 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  100 
 
 
468 aa  906    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  60.9 
 
 
472 aa  458  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  59.78 
 
 
465 aa  443  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  55.25 
 
 
503 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  55.25 
 
 
503 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  55.56 
 
 
503 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  51.18 
 
 
476 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  37.78 
 
 
456 aa  271  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  37.61 
 
 
481 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  31.57 
 
 
446 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  36.38 
 
 
481 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  30.73 
 
 
446 aa  207  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  37.11 
 
 
470 aa  206  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  35.42 
 
 
470 aa  203  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1204  MmgE/PrpD family protein  28.98 
 
 
449 aa  202  9e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  30.73 
 
 
446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  35.06 
 
 
451 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  42.86 
 
 
447 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  34.44 
 
 
468 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  39.63 
 
 
458 aa  190  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  36.7 
 
 
461 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  35.48 
 
 
461 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  31.56 
 
 
460 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  35.23 
 
 
450 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  36.34 
 
 
456 aa  173  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  34.86 
 
 
450 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  31.69 
 
 
457 aa  169  8e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  34.73 
 
 
447 aa  168  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  35.52 
 
 
461 aa  167  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  36.48 
 
 
455 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  37.04 
 
 
468 aa  166  8e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  33.57 
 
 
455 aa  166  9e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  36.66 
 
 
456 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  36.34 
 
 
461 aa  162  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  39.5 
 
 
454 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  39.5 
 
 
458 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  33.06 
 
 
463 aa  160  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  37.44 
 
 
500 aa  160  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1703  Fis family transcriptional regulator  29.53 
 
 
453 aa  159  7e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0229045 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  35.63 
 
 
457 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  37.6 
 
 
451 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  33.05 
 
 
463 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  30.64 
 
 
449 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  33.05 
 
 
464 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6810  MmgE/PrpD family protein  30.41 
 
 
460 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1932  MmgE/PrpD family protein  34.7 
 
 
467 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  35.34 
 
 
451 aa  154  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  34.38 
 
 
451 aa  153  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  30.6 
 
 
490 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  35.02 
 
 
460 aa  152  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  33.33 
 
 
461 aa  150  5e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  34.52 
 
 
471 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2657  MmgE/PrpD  33.59 
 
 
504 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  33.54 
 
 
458 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  32.77 
 
 
454 aa  147  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  29 
 
 
453 aa  145  1e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  34.46 
 
 
451 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  35 
 
 
459 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  32.44 
 
 
481 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  31.84 
 
 
474 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  30.34 
 
 
488 aa  144  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  32.34 
 
 
454 aa  144  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  34.98 
 
 
453 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  29 
 
 
453 aa  144  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  31.39 
 
 
483 aa  142  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1511  MmgE/PrpD  28.74 
 
 
472 aa  142  9e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  32.94 
 
 
457 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  32.77 
 
 
450 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  30.77 
 
 
449 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  32.2 
 
 
449 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0780  2-methylcitrate dehydratase  30.38 
 
 
453 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  32.05 
 
 
462 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  32.63 
 
 
453 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  30.82 
 
 
441 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0820  2-methylcitrate dehydratase  29.22 
 
 
457 aa  141  3e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  36.86 
 
 
462 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  33.55 
 
 
458 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  29.52 
 
 
482 aa  140  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.183054 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  31.4 
 
 
501 aa  139  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7945  MmgE/PrpD family protein  37.18 
 
 
465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762062  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  32.79 
 
 
454 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  30.17 
 
 
441 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1051  MmgE/PrpD family protein  36.75 
 
 
449 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0583163  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  34.93 
 
 
462 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  35.32 
 
 
442 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  27.49 
 
 
469 aa  133  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  31.67 
 
 
458 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0116  MmgE/PrpD family protein  32.33 
 
 
454 aa  133  7.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  33.24 
 
 
451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  33.77 
 
 
443 aa  132  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  31.87 
 
 
476 aa  130  7.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001534  MmgE/PrpD family protein  27.97 
 
 
453 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  31.74 
 
 
450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6601  MmgE/PrpD family protein  31.52 
 
 
462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.148689 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  31.94 
 
 
463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  31.48 
 
 
486 aa  126  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1242  MmgE/PrpD family protein  29.74 
 
 
458 aa  122  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.424636  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  30.97 
 
 
453 aa  120  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6759  MmgE/PrpD  34.18 
 
 
482 aa  120  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2582  putative MmgE/Prp family protein  31.75 
 
 
494 aa  120  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.194391 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>