More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6530 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1504  helicase c2  56.95 
 
 
672 aa  674    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328202  normal  0.416282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2347  helicase c2  59.88 
 
 
670 aa  710    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.490547  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6530  putative ATP-dependent helicase  100 
 
 
674 aa  1348    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290122  normal  0.0410108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0995  helicase c2  63.24 
 
 
681 aa  837    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900844  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3345  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.67 
 
 
694 aa  777    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127637  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3841  helicase c2  60.71 
 
 
665 aa  715    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478709  normal  0.0359375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2167  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  59.64 
 
 
706 aa  725    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17400  DNA helicase, Rad3  56.19 
 
 
765 aa  674    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0589917  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  58.04 
 
 
664 aa  684    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2205  helicase c2  74.45 
 
 
676 aa  905    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.632178  normal  0.363279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  60.71 
 
 
665 aa  716    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29270  DNA helicase, Rad3  64.85 
 
 
684 aa  830    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3929  helicase c2  60.71 
 
 
665 aa  716    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0336304  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4298  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.92 
 
 
666 aa  731    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.641288 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1280  helicase c2  61.65 
 
 
677 aa  705    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0225088  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1957  helicase c2  59.83 
 
 
699 aa  748    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0276528  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1812  helicase c2  50.49 
 
 
706 aa  629  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1467  helicase c2  52.05 
 
 
690 aa  609  1e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0659778  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10610  DNA helicase, Rad3  49.35 
 
 
673 aa  601  1e-170  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.382167  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23060  DNA helicase, Rad3  52.47 
 
 
692 aa  597  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0774743 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1256  helicase c2  52.9 
 
 
696 aa  594  1e-168  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1563  helicase c2  52.83 
 
 
728 aa  593  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192384  decreased coverage  0.00181092 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0323  helicase c2  52.17 
 
 
699 aa  590  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1469  helicase c2  52.12 
 
 
685 aa  592  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000142659 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3824  helicase c2  53.69 
 
 
676 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00296278  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0280  helicase c2  50.52 
 
 
683 aa  580  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0332575 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07310  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  51.39 
 
 
699 aa  572  1.0000000000000001e-162  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0239  helicase c2  50 
 
 
664 aa  574  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2435  helicase c2  51.95 
 
 
679 aa  553  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.184328  normal  0.864461 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1052  helicase c2  47.79 
 
 
669 aa  517  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.325194 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1566  helicase c2  57.56 
 
 
844 aa  477  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102401  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1480  helicase c2  55.15 
 
 
710 aa  474  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.124092  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  35.54 
 
 
643 aa  295  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  33.43 
 
 
674 aa  290  8e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  33.69 
 
 
660 aa  289  9e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0532  helicase c2  36.77 
 
 
649 aa  287  4e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  31.42 
 
 
636 aa  285  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  36.36 
 
 
633 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  31.78 
 
 
646 aa  284  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  34.81 
 
 
650 aa  284  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1545  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.88 
 
 
944 aa  284  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.676592  decreased coverage  0.000191845 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  34.65 
 
 
650 aa  283  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  33.18 
 
 
658 aa  281  3e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  32.84 
 
 
652 aa  279  1e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  33.03 
 
 
639 aa  278  3e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1154  DNA polymerase III, epsilon subunit  31.56 
 
 
921 aa  275  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  35.67 
 
 
631 aa  275  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4459  helicase c2  35.71 
 
 
633 aa  274  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157065  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.96 
 
 
927 aa  272  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  34.17 
 
 
743 aa  273  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  32.24 
 
 
652 aa  272  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  32.78 
 
 
707 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  35.25 
 
 
647 aa  271  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1612  putative ATP-dependent helicase  35.58 
 
 
751 aa  269  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100383  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  34.16 
 
 
729 aa  266  7e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2094  helicase c2  35.13 
 
 
673 aa  266  7e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.239782  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1779  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  33.23 
 
 
641 aa  265  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  33.54 
 
 
640 aa  265  3e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  31.49 
 
 
646 aa  262  1e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2524  helicase c2  35.18 
 
 
755 aa  263  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00188741  decreased coverage  0.000000000263353 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  31.64 
 
 
644 aa  262  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1824  helicase c2  31.96 
 
 
664 aa  261  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.678424  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  26.49 
 
 
832 aa  261  3e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  31.19 
 
 
646 aa  259  9e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  33.53 
 
 
645 aa  259  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  33.23 
 
 
653 aa  258  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2081  ATP-dependent helicase DinG  31.07 
 
 
633 aa  258  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  32.66 
 
 
641 aa  257  6e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  32.66 
 
 
641 aa  257  6e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2251  ATP-dependent helicase, putative  33.43 
 
 
755 aa  257  6e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.247338  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3093  helicase c2  35.22 
 
 
681 aa  256  8e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  34.45 
 
 
757 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  31.49 
 
 
636 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  31.49 
 
 
636 aa  254  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  31.49 
 
 
636 aa  254  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  30.69 
 
 
929 aa  254  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  31.49 
 
 
636 aa  254  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  31.49 
 
 
636 aa  254  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  31.49 
 
 
636 aa  254  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  33.33 
 
 
646 aa  254  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  31.49 
 
 
636 aa  254  3e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  30.35 
 
 
669 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  31.49 
 
 
636 aa  254  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  30.65 
 
 
640 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2532  helicase c2  30.35 
 
 
640 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6284  helicase c2  33.69 
 
 
749 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1795  helicase c2  33.69 
 
 
749 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2302  ATP-dependent helicase, DinG family protein  31.71 
 
 
662 aa  253  6e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.783815  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2207  putative ATP-dependent helicase  34.14 
 
 
749 aa  253  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  33.23 
 
 
651 aa  253  8.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  32.56 
 
 
952 aa  252  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2316  helicase c2  32.95 
 
 
670 aa  252  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  26.22 
 
 
667 aa  251  2e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2413  helicase c2  30.45 
 
 
669 aa  252  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0561182  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1859  helicase c2  30.34 
 
 
674 aa  252  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347581  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  31.35 
 
 
636 aa  252  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1991  ATP-dependent helicase, putative  34.59 
 
 
645 aa  251  3e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1805  helicase c2  30.34 
 
 
659 aa  251  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  32.17 
 
 
659 aa  251  4e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  31.27 
 
 
651 aa  250  5e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>