187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6451 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6451  exonuclease SbcC  100 
 
 		 1291 aa  2402    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0663249  normal  0.0228854 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  63.97 
 
 		 1249 aa  368  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  53.22 
 
 		 995 aa  285  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  47.29 
 
 		 881 aa  255  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  42.82 
 
 		 986 aa  227  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  51.05 
 
 		 989 aa  223  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  55.67 
 
 		 962 aa  221  8.999999999999998e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2960  DNA repair exonuclease, SbcC  54.24 
 
 		 1191 aa  213  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.263309 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  48.88 
 
 		 1025 aa  213  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  52.26 
 
 		 995 aa  204  9e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  47.11 
 
 		 986 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  47.66 
 
 		 1023 aa  196  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  54.44 
 
 		 1047 aa  177  9e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1225  putative exonuclease  49.25 
 
 		 1058 aa  176  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  39.57 
 
 		 1022 aa  175  5e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0124  putative exonuclease  42.32 
 
 		 1046 aa  174  6.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0895241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  44.56 
 
 		 1020 aa  168  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08420  exonuclease SbcC  45.6 
 
 		 1009 aa  164  9e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  44.44 
 
 		 1006 aa  164  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  41.12 
 
 		 1020 aa  162  5e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  44.51 
 
 		 1030 aa  161  6e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  38.78 
 
 		 1018 aa  161  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  39.29 
 
 		 1013 aa  160  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  41.18 
 
 		 1017 aa  159  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  38.58 
 
 		 1018 aa  158  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  40.47 
 
 		 1018 aa  158  7e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  44.32 
 
 		 953 aa  158  8e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  37.44 
 
 		 1039 aa  157  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  41.12 
 
 		 1018 aa  155  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  38.68 
 
 		 1049 aa  155  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  39.7 
 
 		 1081 aa  155  5e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  43.02 
 
 		 1029 aa  155  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  43.02 
 
 		 1029 aa  155  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  43.02 
 
 		 1029 aa  155  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2998  putative exonuclease  43.02 
 
 		 1029 aa  155  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000658197  decreased coverage  0.00861967 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2461  putative exonuclease  43.02 
 
 		 1029 aa  155  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000696116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2391  exonuclease, putative  43.02 
 
 		 1029 aa  154  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2136  exonuclease SbcC  43.02 
 
 		 1029 aa  154  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.142558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2122  exonuclease  43.02 
 
 		 1029 aa  154  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.837048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2379  putative exonuclease  43.02 
 
 		 1029 aa  154  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  40.72 
 
 		 1018 aa  154  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  42.46 
 
 		 1029 aa  154  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  40.29 
 
 		 1020 aa  153  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  40.72 
 
 		 1018 aa  152  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  38.66 
 
 		 1018 aa  151  7e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  41.9 
 
 		 1029 aa  151  9e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  38.66 
 
 		 1018 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  38.66 
 
 		 1018 aa  151  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  39.09 
 
 		 1018 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  26.05 
 
 		 1009 aa  150  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  26.05 
 
 		 1009 aa  150  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  39.18 
 
 		 1018 aa  149  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  39.09 
 
 		 1018 aa  148  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  39.09 
 
 		 1018 aa  148  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  39.09 
 
 		 1018 aa  148  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  24.78 
 
 		 1009 aa  147  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  40.11 
 
 		 1018 aa  147  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  37.63 
 
 		 1038 aa  134  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3946  exonuclease protein  38.27 
 
 		 1024 aa  133  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1443  ATPase for DNA repair  37.7 
 
 		 1046 aa  124  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1031  SMC domain-containing protein  36.41 
 
 		 1033 aa  117  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  38.53 
 
 		 1214 aa  116  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  35.21 
 
 		 1180 aa  115  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  37.5 
 
 		 1214 aa  115  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0760  SMC domain protein  37.43 
 
 		 1165 aa  114  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000289262  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0207  exonuclease SbcC  33.68 
 
 		 1172 aa  113  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0205  exonuclease SbcC  33.16 
 
 		 1172 aa  112  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.305096  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  27.69 
 
 		 1213 aa  112  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1364  ATP-dependent dsDNA exonuclease  31.63 
 
 		 1059 aa  111  9.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  42.14 
 
 		 1303 aa  111  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  46.41 
 
 		 1164 aa  111  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  40 
 
 		 1307 aa  110  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  34.24 
 
 		 1211 aa  109  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  35.32 
 
 		 810 aa  109  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  37.69 
 
 		 815 aa  108  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  37.25 
 
 		 1214 aa  108  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  41.24 
 
 		 1238 aa  108  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  37.25 
 
 		 1214 aa  108  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  30.7 
 
 		 1011 aa  108  8e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  36.76 
 
 		 1214 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  47.54 
 
 		 1214 aa  105  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  34.98 
 
 		 1099 aa  105  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  40.46 
 
 		 1155 aa  104  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  39.31 
 
 		 1226 aa  104  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  40.71 
 
 		 1346 aa  104  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  44 
 
 		 1227 aa  103  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0283  SMC domain protein  36.54 
 
 		 1223 aa  103  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  42.01 
 
 		 1226 aa  103  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  31.71 
 
 		 1091 aa  102  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1488  SMC domain protein  33.51 
 
 		 1114 aa  102  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  40.11 
 
 		 1042 aa  102  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  26.48 
 
 		 1219 aa  102  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  33.1 
 
 		 1230 aa  102  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  30.48 
 
 		 1108 aa  101  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3443  SMC protein-like  37.65 
 
 		 1232 aa  100  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  42.75 
 
 		 1223 aa  100  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  32.68 
 
 		 1091 aa  100  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  41.51 
 
 		 1227 aa  100  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  46.15 
 
 		 1234 aa  98.6  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3278  SMC domain-containing protein  37.28 
 
 		 1229 aa  98.2  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>