More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6397 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  100 
 
 		 237 aa  460  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0904  two component transcriptional regulator, winged helix family  68.38 
 
 		 254 aa  297  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.936287  normal  0.32173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  60.5 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  60 
 
 		 231 aa  271  9e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  63.88 
 
 		 227 aa  271  9e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  60 
 
 		 231 aa  268  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  60 
 
 		 230 aa  265  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  60 
 
 		 230 aa  265  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  60 
 
 		 230 aa  265  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.87 
 
 		 228 aa  259  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  58.62 
 
 		 230 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7401  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.47 
 
 		 229 aa  255  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.263718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1155  two component transcriptional regulator  60.53 
 
 		 235 aa  242  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.503115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.02 
 
 		 224 aa  239  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32770  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  59.13 
 
 		 229 aa  239  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.04 
 
 		 228 aa  238  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4519  response regulator receiver  58.95 
 
 		 234 aa  236  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.135212  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.17 
 
 		 238 aa  234  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  59.13 
 
 		 228 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  52.79 
 
 		 236 aa  232  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.33 
 
 		 229 aa  232  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.28 
 
 		 224 aa  230  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  51.72 
 
 		 228 aa  229  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  53.71 
 
 		 232 aa  228  9e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  49.57 
 
 		 236 aa  227  1e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  53.25 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.97 
 
 		 225 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  53.95 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1564  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.77 
 
 		 223 aa  224  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194978  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  53.51 
 
 		 224 aa  224  7e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0228  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.23 
 
 		 223 aa  224  9e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.63 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  51.32 
 
 		 224 aa  223  3e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  51.91 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.63 
 
 		 242 aa  222  4e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  53.02 
 
 		 406 aa  222  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.56 
 
 		 225 aa  221  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.07 
 
 		 225 aa  221  6e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.56 
 
 		 273 aa  219  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  50.86 
 
 		 248 aa  218  7e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  52.42 
 
 		 240 aa  216  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  49.57 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  53.04 
 
 		 225 aa  214  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.21 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  53.3 
 
 		 229 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  48.9 
 
 		 223 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.64 
 
 		 241 aa  211  7e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  48.31 
 
 		 233 aa  211  7.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  46.7 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  48.29 
 
 		 257 aa  209  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  49.36 
 
 		 271 aa  208  5e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.72 
 
 		 224 aa  208  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  45.81 
 
 		 227 aa  207  8e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  45.81 
 
 		 227 aa  207  8e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  45.81 
 
 		 227 aa  207  8e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.26 
 
 		 239 aa  207  8e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.72 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.25 
 
 		 224 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  47.58 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.81 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  48.48 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4284  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.26 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 		 224 aa  206  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3221  DNA-binding response regulator  45.22 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3265  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.23 
 
 		 245 aa  205  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.45002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.92 
 
 		 231 aa  205  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2401  two component transcriptional regulator  51.75 
 
 		 283 aa  205  5e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0476592  normal  0.0197415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5089  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.53 
 
 		 242 aa  205  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160869  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 		 223 aa  204  8e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  51.08 
 
 		 242 aa  204  9e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.71 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.52 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  48.05 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  48.07 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0015  two component transcriptional regulator  45.61 
 
 		 228 aa  203  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.04 
 
 		 243 aa  203  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  46.7 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  45.81 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2944  two component transcriptional regulator  45.81 
 
 		 224 aa  202  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0958095  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0468  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.11 
 
 		 223 aa  202  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  48.28 
 
 		 248 aa  202  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3673  response regulator receiver  42.61 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  47.6 
 
 		 236 aa  202  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.68 
 
 		 223 aa  201  6e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  48.91 
 
 		 246 aa  201  9e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2675  DNA-binding response regulator  44.25 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0180828  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2492  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 224 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.22217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2673  DNA-binding response regulator  44.25 
 
 		 224 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.05 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1873  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  46.72 
 
 		 243 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0187  two component transcriptional regulator  52.23 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.91 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2231  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.58 
 
 		 226 aa  198  5e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1404  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 229 aa  198  5e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1940  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.89 
 
 		 219 aa  198  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359722  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0274  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.79 
 
 		 232 aa  198  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.701823  normal  0.83989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>