More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6395 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  100 
 
 
402 aa  793    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0941641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0439  GtrA family protein  68.73 
 
 
425 aa  481  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0902  GtrA family protein  69.79 
 
 
428 aa  479  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258028  normal  0.0796887 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  60.99 
 
 
435 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  59.34 
 
 
416 aa  440  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  57 
 
 
460 aa  427  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4426  glycosyl transferase family protein  59.17 
 
 
437 aa  428  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739527  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3923  glycosyl transferase family protein  60.05 
 
 
421 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.496701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3997  glycosyl transferase family protein  60.05 
 
 
421 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3938  glycosyl transferase family protein  60.05 
 
 
421 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.24037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1721  glycosyl transferase family 2  60.4 
 
 
424 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  53.02 
 
 
496 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1939  glycosyl transferase family 2  58.99 
 
 
415 aa  412  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  59.18 
 
 
410 aa  411  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0828  glycosyl transferase family 2  57.22 
 
 
422 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2268  glycosyl transferase family protein  58.49 
 
 
411 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371965  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2627  glycosyl transferase family 2  54.45 
 
 
412 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.97683 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  58.29 
 
 
409 aa  391  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4506  glycosyl transferase family 2  55.44 
 
 
378 aa  323  4e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2367  family 2 glycosyl transferase  46.98 
 
 
389 aa  317  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00481537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1923  glycosyl transferase family 2  63.52 
 
 
266 aa  300  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0651  glycosyl transferase family protein  61 
 
 
333 aa  296  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4090  glycosyl transferase family 2  55.78 
 
 
441 aa  267  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3686  glycosyl transferase family 2  54.11 
 
 
326 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3989  glycosyl transferase family protein  51.98 
 
 
238 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  38.15 
 
 
606 aa  160  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  40.98 
 
 
237 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  37.65 
 
 
613 aa  151  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1493  hypothetical protein  38.14 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.055606 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0724  glycosyl transferase family protein  38.92 
 
 
239 aa  144  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0205855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  36.49 
 
 
574 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0693  glycosyl transferase family protein  35.92 
 
 
238 aa  137  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0904184  normal  0.159851 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  36.02 
 
 
238 aa  130  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 
255 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
273 aa  114  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  31.51 
 
 
259 aa  110  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
262 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  30.33 
 
 
253 aa  107  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
276 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 
256 aa  106  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  32.68 
 
 
276 aa  106  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 
256 aa  103  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 
238 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
256 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  34 
 
 
380 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57548  UDP-glucose:dolichyl-phosphate glucosyltransferase  28.63 
 
 
325 aa  100  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
273 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 
320 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
261 aa  97.1  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0229  glycosyl transferase family 2  33.8 
 
 
243 aa  95.9  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4956  glycosyl transferase family 2  33.79 
 
 
245 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193051  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3994  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
267 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  25.19 
 
 
267 aa  91.7  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 
236 aa  91.7  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2556  GtrA family protein  39.33 
 
 
168 aa  90.1  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0257163  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3007  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.23 
 
 
246 aa  89.7  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0582425 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.64 
 
 
780 aa  88.2  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  31.92 
 
 
883 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.96 
 
 
248 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.48 
 
 
809 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 
314 aa  87  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.81 
 
 
247 aa  87  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1870  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 
237 aa  85.9  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
246 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0517  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 
243 aa  84.7  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2293  GtrA family protein  40.15 
 
 
163 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000202396 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.33 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1276  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 
246 aa  84  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0381743  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  25.58 
 
 
272 aa  82.4  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
251 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  30.32 
 
 
414 aa  81.3  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0073  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
232 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1925  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
242 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000240959  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
394 aa  79.7  0.00000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  32.86 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3591  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.73 
 
 
252 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2023  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
314 aa  79.3  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
262 aa  79  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.77 
 
 
244 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  31.63 
 
 
263 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3976  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 
514 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
262 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19705  dolichyl-phosphate mannosyltransferase  28.3 
 
 
236 aa  79  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.872705  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  28.29 
 
 
340 aa  78.2  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
586 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2667  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5439  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 
318 aa  77  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.431845 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  31.75 
 
 
242 aa  76.3  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.56 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1211  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.73 
 
 
257 aa  75.9  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13175  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  26.57 
 
 
227 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 
231 aa  75.5  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4209  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
346 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.220629 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1038  glycosyl transferase family protein  23.81 
 
 
685 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.152383  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1361  hypothetical protein  26.02 
 
 
388 aa  74.3  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  24.5 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3118  glycosyl transferase family protein  26.37 
 
 
235 aa  74.3  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000616031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>