More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6349 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3797  IS605 family transposase OrfB  83.22 
 
 		 429 aa  716    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.414505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6349  transposase  100 
 
 		 429 aa  871    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5477  IS605 family transposase OrfB  56.82 
 
 		 416 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.461601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3319  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  56.06 
 
 		 415 aa  409  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.947288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1584  IS891/IS1136/IS1341 family transposase  55.31 
 
 		 417 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.758267 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  54.45 
 
 		 397 aa  385  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  54.45 
 
 		 397 aa  385  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1800  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  51.3 
 
 		 386 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.500943 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2022  IS605 family transposase OrfB  36.18 
 
 		 402 aa  212  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000253507  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0448  IS605 family transposase orfB  36.18 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01390  predicted transposase  36.18 
 
 		 402 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01400  hypothetical protein  36.18 
 
 		 402 aa  209  6e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2166  IS605 family transposase OrfB  36.18 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  35.06 
 
 		 402 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1062  IS605 family transposase orfB  36.18 
 
 		 402 aa  207  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000017458  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1611  IS605 family transposase OrfB  36.18 
 
 		 402 aa  207  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1294  IS605 family transposase OrfB  35.82 
 
 		 411 aa  207  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  38.02 
 
 		 399 aa  207  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3890  IS605 family transposase OrfB  36.34 
 
 		 402 aa  207  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1516  IS605 family transposase OrfB  35.92 
 
 		 402 aa  206  6e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2214  transposase, IS605 OrfB family  36.66 
 
 		 382 aa  206  9e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.645387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2227  IS605 family transposase OrfB  36.66 
 
 		 382 aa  206  9e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.722641 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5722  transposase, IS605 orfB family  35.82 
 
 		 402 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000324341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0613  IS605 family transposase OrfB  36.05 
 
 		 411 aa  205  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  35.92 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7257  IS605 family transposase OrfB  37.75 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal  0.105213 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3630  transposase, IS605 orfB family  35.4 
 
 		 402 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0279  IS605 family transposase OrfB  35.92 
 
 		 411 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0714  IS605 family transposase OrfB  36.8 
 
 		 381 aa  196  6e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0845  IS605 family transposase OrfB  36.8 
 
 		 381 aa  196  9e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  32.94 
 
 		 422 aa  194  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2764  IS605 family transposase OrfB  34.02 
 
 		 411 aa  193  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.432246  normal  0.196965 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1058  ISAfe8, transposase  36.87 
 
 		 408 aa  192  7e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19621  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2963  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  38.2 
 
 		 399 aa  192  9e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.268101  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3266  transposase  38.2 
 
 		 399 aa  192  9e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.364761 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1215  ISAfe8, transposase  36.87 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.630529  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1278  IS605 family transposase OrfB  34.47 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.716474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3880  IS605 family transposase OrfB  34.55 
 
 		 411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16800  transposase, IS605  34.08 
 
 		 403 aa  190  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00750  Transposase, IS891/IS1136/IS1341/IS605  34.09 
 
 		 403 aa  189  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42370  transposase  33.83 
 
 		 403 aa  187  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5850  IS605 family transposase OrfB  37.19 
 
 		 399 aa  187  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15780  transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.83 
 
 		 406 aa  186  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3502  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.72 
 
 		 406 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6989  transposase  33.16 
 
 		 400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5691  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.53 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6840  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  38.36 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.643066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  33.58 
 
 		 399 aa  184  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1215  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.73 
 
 		 399 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0567342  normal  0.0860408 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3509  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  38.96 
 
 		 398 aa  177  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4187  IS605 family transposase OrfB  33.25 
 
 		 422 aa  169  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1550  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.16 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734191  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1390  transposase  31.36 
 
 		 348 aa  157  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0279929  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2738  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  33.94 
 
 		 361 aa  156  6e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0127  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  38.29 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.291596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1280  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.78 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0486  transposase  29.88 
 
 		 348 aa  154  4e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0583  transposase  29.88 
 
 		 348 aa  154  4e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2213  transposase IS605 OrfB family  32.25 
 
 		 376 aa  152  8e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2560  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  32.09 
 
 		 431 aa  150  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.747478  normal  0.0116534 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3183  transposase, IS605 OrfB family  29.91 
 
 		 496 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3354  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.02 
 
 		 403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0649  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  28.61 
 
 		 435 aa  137  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3904  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  37.87 
 
 		 517 aa  136  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0294  IS605 family transposase OrfB  27.27 
 
 		 424 aa  133  5e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.414871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1677  putative transposase IS605 family  27.96 
 
 		 449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0778  transposase, IS605 OrfB family  29.76 
 
 		 500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  28.54 
 
 		 384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2272  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  29.13 
 
 		 391 aa  125  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.641277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  31.23 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0373  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  28.43 
 
 		 444 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  32 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  30.9 
 
 		 370 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3396  IS605 family transposase OrfB  29.44 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000848869  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2680  transposase  44.23 
 
 		 229 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0345302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3173  transposase, IS605 OrfB  30.39 
 
 		 474 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.184045 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3325  IS605 family transposase OrfB  28.46 
 
 		 399 aa  117  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.156682  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  30.15 
 
 		 370 aa  117  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1958  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  28.19 
 
 		 440 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0714326  normal  0.520814 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1931  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  28.19 
 
 		 440 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2736  transposase, IS605 OrfB family  27.66 
 
 		 391 aa  116  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.312474 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3581  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  28.19 
 
 		 444 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  28.78 
 
 		 393 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0201  IS605 family transposase OrfB  29.97 
 
 		 385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000194492  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0459  IS605 family transposase OrfB  26.11 
 
 		 401 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  26.87 
 
 		 370 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  26.36 
 
 		 370 aa  112  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  26.61 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3089  transposase, IS605 OrfB family  30.55 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.154586 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2479  transposase, IS605 OrfB family  26 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  26.74 
 
 		 393 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1180  transposase, IS605 OrfB family  29.26 
 
 		 399 aa  111  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0545445  normal  0.213807 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  26.87 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  29.76 
 
 		 376 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  26.61 
 
 		 370 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  26.87 
 
 		 370 aa  111  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1914  transposase, IS605 OrfB family  29.26 
 
 		 399 aa  111  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.70549 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  26.68 
 
 		 383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0285  IS891/IS1136/IS1341 transposase  25.34 
 
 		 461 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.310253  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  26.68 
 
 		 383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>