More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6337 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 226 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4063  GntR family transcriptional regulator  46.82 
 
 		 242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  46.02 
 
 		 268 aa  167  9e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  39.2 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  38 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  35.32 
 
 		 250 aa  99.8  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  37.19 
 
 		 216 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 255 aa  98.6  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 238 aa  97.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  31.9 
 
 		 244 aa  95.1  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0503  GntR domain protein  33.19 
 
 		 234 aa  94.7  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232387 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  31.9 
 
 		 244 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  30 
 
 		 243 aa  94.4  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 252 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  30.36 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  30.36 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  30.36 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  35.53 
 
 		 216 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  35.84 
 
 		 242 aa  92.4  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 230 aa  92.8  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  38.37 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  32.74 
 
 		 268 aa  92.8  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  33.94 
 
 		 234 aa  92.4  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  30.84 
 
 		 239 aa  92  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  33.49 
 
 		 240 aa  91.7  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  31.36 
 
 		 241 aa  91.7  9e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  34.55 
 
 		 273 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  28.14 
 
 		 238 aa  89.4  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 219 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 261 aa  89  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2979  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 302 aa  88.6  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0803123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  33.65 
 
 		 235 aa  88.6  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  30.32 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  33.65 
 
 		 247 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  33.48 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0977  GntR domain protein  30.3 
 
 		 244 aa  87  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243501  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 247 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  32.02 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3543  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4148  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 246 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0271  GntR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 236 aa  85.9  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  32.87 
 
 		 264 aa  85.5  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2961  GntR domain-containing protein  31.19 
 
 		 259 aa  85.1  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  36.04 
 
 		 238 aa  85.1  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3910  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.18 
 
 		 258 aa  84.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  33.65 
 
 		 222 aa  84.7  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  29.06 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.65 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  32.61 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1447  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.384199 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  36.36 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  32.58 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  29.02 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4079  DNA-binding transcriptional repressor LldR  28.76 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3972  DNA-binding transcriptional repressor LldR  28.76 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.773658 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 268 aa  83.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4017  DNA-binding transcriptional repressor LldR  28.76 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0037  GntR domain protein  35.02 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2876  GntR domain protein  32.89 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0036  GntR domain-containing protein  28.51 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4617  GntR domain protein  33.77 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3894  DNA-binding transcriptional repressor LldR  28.33 
 
 		 258 aa  81.6  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659933 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  32.21 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 267 aa  81.6  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  33.62 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0711  GntR domain-containing protein  32.72 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.121808 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2385  GntR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.655367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2122  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3643  GntR domain-containing protein  31.19 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  33.65 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  33.81 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  29.46 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  30.8 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  30.67 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  32.86 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0839  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4409  GntR domain protein  32.3 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  33.8 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2361  GntR domain protein  33.94 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  32.27 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  34.04 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02963  DNA-binding transcriptional repressor  26.82 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02914  hypothetical protein  26.82 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0602  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  26.82 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1106  GntR domain-containing protein  34.36 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4061  regulatory protein GntR, HTH  32.56 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2324  regulatory protein  39.87 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4590  GntR domain-containing protein  29.2 
 
 		 263 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.845166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  33.62 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>