106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6303 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6303  transcriptional regulator, PadR-like family  100 
 
 		 188 aa  377  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113883  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0613  transcriptional regulator, PadR-like family  56.28 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.121754  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2505  Transcriptional regulator PadR-like protein  51.35 
 
 		 195 aa  177  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.774349  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2598  transcriptional regulator PadR family protein  46.77 
 
 		 203 aa  155  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2796  PadR-like family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 187 aa  151  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4651  PadR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 191 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0244523  normal  0.199079 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0813  PadR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 195 aa  104  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.403384 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00046  transcriptional regulator  32.78 
 
 		 201 aa  98.6  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2248  PadR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 183 aa  96.3  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0137325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1892  PadR-like family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 176 aa  92.4  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.481903  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002309  predicted transcriptional regulator  41.75 
 
 		 179 aa  91.7  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2223  hypothetical protein  31.11 
 
 		 179 aa  91.3  7e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000756416  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2017  Transcriptional regulator PadR-like protein  31.41 
 
 		 181 aa  90.9  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00625751  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4576  PadR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 181 aa  90.9  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2628  transcriptional regulator, PadR-like family  34.23 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5461  PadR-like family transcriptional regulator  35 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26090  predicted transcriptional regulator  34.06 
 
 		 194 aa  80.9  0.000000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11201  hypothetical protein  37.4 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.705014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3692  transcriptional regulator, PadR-like family  36.57 
 
 		 176 aa  80.9  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.466556 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4818  transcriptional regulator, PadR-like family  30.56 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3741  transcriptional regulator, PadR-like family  30.56 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05461  hypothetical protein  30 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.797488  normal  0.144264 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2496  transcriptional regulator, PadR-like family  32.78 
 
 		 177 aa  77.4  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0617263  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1345  transcriptional regulator, PadR-like family  27.32 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4476  PadR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.949846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0095  PadR-like family regulatory protein  30.17 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1600  PadR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.797294  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1517  PadR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.178756  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5591  PadR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1272  transcriptional regulator  29.61 
 
 		 185 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.546135  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4271  PadR-like family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0469605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1923  transcriptional regulator, PadR-like family  31.68 
 
 		 184 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.870316 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1322  PadR-like family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 183 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.704884 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0010  PadR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.341135  normal  0.976075 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0862  PadR-like family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1343  PadR-like family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3673  PadR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0779  transcriptional regulator, PadR-like family  41.77 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.125594  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0838  transcriptional regulator, PadR-like family  28.7 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4824  transcriptional regulator, PadR-like family  37.93 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1910  PadR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1493  PadR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1669  PadR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.107785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1645  transcriptional regulator  26.19 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1946  transcriptional regulator, PadR family  26.19 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0172  PadR-like family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 242 aa  67.8  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.786766 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0225  transcriptional regulator, PadR-like family  36.76 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5568  transcriptional regulator, PadR-like family  48 
 
 		 176 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.630063  normal  0.41654 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3512  transcriptional repressor PadR  24.6 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1257  transcriptional regulator  43.42 
 
 		 174 aa  62  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.287326 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3146  PadR-like family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280559 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1331  PadR-like family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.673499  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4863  transcriptional regulator, PadR-like family  31.45 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1267  transcriptional regulator, PadR-like family  29.29 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0144  transcriptional regulator, PadR-like family  22.83 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0154267  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0079  PadR-like family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1076  PadR-like family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4870  PadR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4959  PadR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5238  PadR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 173 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1177  transcriptional regulator, PadR-like family  28.65 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0592255  hitchhiker  0.00870551 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2019  transcriptional regulator, PadR-like family  25 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.41981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0871  PadR-like family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138524  normal  0.0913911 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1942  transcriptional regulator, PadR-like family  30.18 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.649518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1362  transcriptional regulator, PadR-like family  34.52 
 
 		 223 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.323106  normal  0.883441 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1415  transcriptional regulator, PadR-like family  32.28 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0975835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2204  PadR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0586729  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1627  transcriptional regulator protein-like protein  28.71 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.155416 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3177  transcriptional regulator, PadR-like family  31.88 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.556918  normal  0.03966 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4160  transcriptional regulator, PadR-like family  27.97 
 
 		 222 aa  48.9  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354182  normal  0.0431624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8052  transcriptional regulator protein-like protein  30 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5734  transcriptional regulator, PadR-like family  35.37 
 
 		 172 aa  48.9  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4806  transcriptional regulator, PadR-like family  28.67 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5624  transcriptional regulator, PadR-like family  23.48 
 
 		 191 aa  47.8  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.218719 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2728  PadR-like family transcriptional regulator  30 
 
 		 110 aa  47.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323988  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4136  transcriptional regulator, PadR family  30 
 
 		 110 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.345707  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1102  transcriptional regulator, PadR family  30 
 
 		 110 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1561  transcriptional regulator, PadR-like family  39.24 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3858  PadR-like family transcriptional regulator  30 
 
 		 110 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4083  PadR family transcriptional regulator  30 
 
 		 110 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0865  hypothetical protein  38.89 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3772  PadR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 110 aa  45.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3787  PadR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 110 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4156  transcriptional regulator, PadR family  28.75 
 
 		 110 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.20651  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0311  PadR-like family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 138 aa  45.4  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3472  transcriptional regulator, PadR-like family  28.57 
 
 		 174 aa  45.1  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3940  PadR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 110 aa  44.7  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4248  PadR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 110 aa  44.7  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0680  PadR family transcriptional regulator  30 
 
 		 179 aa  45.1  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4050  transcriptional regulator, PadR family  28.75 
 
 		 110 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0615  PadR-like family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.169768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2526  PadR-like family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 183 aa  44.3  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0713427  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6781  transcriptional regulator, PadR-like family  26.97 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4588  transcriptional regulator, PadR-like family  34.67 
 
 		 125 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00658109  normal  0.0547899 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0045  transcriptional regulator, PadR-like family  34.67 
 
 		 110 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1999  transcriptional regulator, PadR-like family  32.71 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.893773  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1194  transcriptional regulator, PadR-like family  28.92 
 
 		 111 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2392  PadR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 149 aa  42.4  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0642121  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3110  transcriptional regulator, PadR-like family  17.21 
 
 		 325 aa  42.4  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000271029  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  36 
 
 		 217 aa  42.4  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>