More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6287 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 304 aa  592  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  48.84 
 
 		 302 aa  229  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  40.22 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  37.67 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  38.58 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  40.13 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 301 aa  149  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  37.01 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  35.88 
 
 		 304 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  36.5 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  35.02 
 
 		 327 aa  139  4.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  36.24 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  38.17 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  34.48 
 
 		 303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  36.39 
 
 		 304 aa  136  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 308 aa  136  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  36.98 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  36.75 
 
 		 316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  35.4 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  34.51 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  36.72 
 
 		 309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  35.13 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  33.21 
 
 		 308 aa  123  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  34.69 
 
 		 311 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  32.51 
 
 		 298 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  38.97 
 
 		 350 aa  122  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 		 309 aa  122  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  36.63 
 
 		 294 aa  122  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  36.61 
 
 		 308 aa  122  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 323 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 323 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 323 aa  122  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4632  transcriptional regulator, LysR family  35.38 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  35.38 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  34.43 
 
 		 333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  35.59 
 
 		 294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  39.76 
 
 		 287 aa  119  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 292 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 304 aa  115  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  34.12 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5689  transcriptional regulator, LysR family  34.17 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  34.98 
 
 		 310 aa  112  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  34.83 
 
 		 303 aa  112  9e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  31.29 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2187  LysR substrate-binding protein  38.87 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  32.24 
 
 		 291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0914  transcriptional regulator, LysR family  35.51 
 
 		 301 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  34.41 
 
 		 296 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1602  fhu operon transcriptional regulator  28.67 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2547  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 310 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.372947 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  33.73 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  30.74 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4073  transcriptional regulator, LysR family  34.69 
 
 		 313 aa  105  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.817309 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0807  transcriptional regulator, LysR family  30.23 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2120  LysR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.526762  normal  0.085988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0303  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3497  transcriptional regulator, LysR family  35.11 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137062 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3999  transcriptional regulator, LysR family  34.94 
 
 		 311 aa  103  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 312 aa  103  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 307 aa  102  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2523  LysR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 298 aa  102  9e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0665746  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0450  LysR substrate-binding protein  32.81 
 
 		 310 aa  102  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  32.56 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2097  LysR family transcriptional regulator  29.43 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.732708  normal  0.0491263 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1625  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991587  normal  0.570552 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1603  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2640  RuBisCO operon transcriptional regulator  30.23 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  36.58 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1193  transcriptional regulator, LysR family  33.57 
 
 		 347 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073439 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0208  transcriptional regulator, LysR family  32.48 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00330  transcriptional regulator  35.79 
 
 		 304 aa  99.8  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6120  transcriptional regulator, LysR family  30.95 
 
 		 302 aa  99.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2872  transcriptional regulator, LysR family  30.82 
 
 		 302 aa  99.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1352  transcriptional regulator, LysR family  31.66 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000043904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4505  transcriptional regulator, LysR family  32.62 
 
 		 299 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002320  Transcriptional regulator, LysR family  27.34 
 
 		 303 aa  97.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.726256  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1256  transcriptional regulator, LysR family  30.98 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360363  decreased coverage  0.00967719 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2539  LysR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224397  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1309  LysR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120853  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00035  DNA-binding transcriptional regulator OxyR  27.24 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  29.12 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 297 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4100  transcriptional regulator, LysR family  34.19 
 
 		 319 aa  96.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  0.0246683 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 		 300 aa  96.3  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 305 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>