12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6266 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6266  hypothetical protein  100 
 
 
523 aa  1042    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.120187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0269  hypothetical protein  43.91 
 
 
490 aa  388  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0317  hypothetical protein  39.93 
 
 
539 aa  334  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0876  hypothetical protein  45.45 
 
 
704 aa  177  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.187127  normal  0.454396 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6989  hypothetical protein  30.46 
 
 
712 aa  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240907  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7051  hypothetical protein  33.23 
 
 
814 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38810  hypothetical protein  27.97 
 
 
776 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.707868  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2107  hypothetical protein  24.72 
 
 
603 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.586574 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1699  hypothetical protein  26.58 
 
 
577 aa  124  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.769745  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0094  hypothetical protein  44.26 
 
 
125 aa  100  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.395549  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2323  hypothetical protein  25.9 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1821  hypothetical protein  44.57 
 
 
428 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>