More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6110 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6110  preprotein translocase subunit YajC, putative  100 
 
 
121 aa  242  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.249779 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2062  preprotein translocase subunit YajC  72.86 
 
 
113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.373337  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1811  preprotein translocase, YajC subunit  46.51 
 
 
111 aa  93.6  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.690098  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2092  protein translocase subunit yajC  48.81 
 
 
102 aa  92.4  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1801  preprotein translocase, YajC subunit  46.43 
 
 
112 aa  92  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0543558  hitchhiker  0.0000220066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2112  preprotein translocase, YajC subunit  58.75 
 
 
134 aa  84  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00156357  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2108  preprotein translocase, YajC subunit  39.81 
 
 
135 aa  80.5  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1941  preprotein translocase, YajC subunit  48.57 
 
 
113 aa  77  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0541773  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0840  preprotein translocase, YajC subunit  52.24 
 
 
102 aa  77  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151299  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1797  preprotein translocase, YajC subunit  43.75 
 
 
128 aa  75.9  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284758  normal  0.10344 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3052  preprotein translocase, YajC subunit  51.19 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193234  normal  0.994127 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2303  preprotein translocase, YajC subunit  49.32 
 
 
137 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17540  preprotein translocase, YajC subunit  34.91 
 
 
127 aa  71.6  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.162392 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  41.18 
 
 
109 aa  71.6  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4006  protein translocase subunit yajC  40.48 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3356  preprotein translocase, YajC subunit  40.48 
 
 
110 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  34.17 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1995  preprotein translocase, YajC subunit  42.31 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0113559 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1342  preprotein translocase, YajC subunit  50 
 
 
131 aa  70.1  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0529442  normal  0.794399 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12608  preprotein translocase subunit YajC  40.86 
 
 
115 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0597309  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1367  preprotein translocase, YajC subunit  39.56 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.263653 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  39.76 
 
 
105 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  39.76 
 
 
106 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  37.97 
 
 
108 aa  68.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  40 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2517  preprotein translocase subunit YajC  37.65 
 
 
91 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0485  preprotein translocase, YajC subunit  39.51 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1165  preprotein translocase subunit  36.59 
 
 
92 aa  67.4  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000132016  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  39.22 
 
 
121 aa  67  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  34.62 
 
 
123 aa  67  0.00000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15090  preprotein translocase, YajC subunit  39.09 
 
 
125 aa  67  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  38.96 
 
 
106 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  41.77 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  41.77 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1372  protein translocase subunit yajC  36.73 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2388  protein translocase subunit yajC  39.33 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1662  protein translocase subunit yajC  31.33 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198451  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4263  preprotein translocase subunit YajC  45.9 
 
 
86 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000229584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3825  preprotein translocase YajC subunit  41.33 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0618005  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  38.16 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0700  preprotein translocase subunit YajC  45.9 
 
 
86 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000310911  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  37.66 
 
 
103 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  36.71 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3886  preprotein translocase, YajC subunit  36.9 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.305651  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0931  preprotein translocase subunit YajC  38.27 
 
 
90 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  39.53 
 
 
105 aa  62.8  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3213  protein translocase subunit yajC  34.23 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1694  preprotein translocase, YajC subunit  40.18 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3175  preprotein translocase, YajC subunit  43.37 
 
 
107 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1384  preprotein translocase, YajC subunit  32.93 
 
 
92 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000396106  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1202  preprotein translocase, YajC subunit  41.46 
 
 
86 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.36693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4501  preprotein translocase subunit YajC  44.26 
 
 
86 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000906179  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4311  preprotein translocase subunit YajC  44.26 
 
 
86 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000102118  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4149  preprotein translocase subunit YajC  44.26 
 
 
86 aa  62.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000425836  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4160  preprotein translocase subunit YajC  44.26 
 
 
86 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152675  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4550  preprotein translocase subunit YajC  44.26 
 
 
86 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000437166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4496  preprotein translocase subunit YajC  44.26 
 
 
86 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000482906 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4646  preprotein translocase subunit YajC  44.26 
 
 
86 aa  62.4  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00688005  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1698  preprotein translocase, YajC subunit  38.04 
 
 
123 aa  62.8  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4535  preprotein translocase subunit YajC  44.26 
 
 
86 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000852882  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1194  protein translocase subunit yajC  31.71 
 
 
92 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00219424  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0682  preprotein translocase, YajC subunit  33 
 
 
137 aa  62  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2355  preprotein translocase, YajC subunit  33.67 
 
 
159 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458983  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1667  preprotein translocase, YajC subunit  37.97 
 
 
93 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0070914  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  35.71 
 
 
95 aa  61.6  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  35.71 
 
 
91 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2443  protein translocase subunit yajC  33.33 
 
 
101 aa  62  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0348045  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3465  preprotein translocase, YajC subunit  34.12 
 
 
114 aa  61.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113386  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  36.14 
 
 
108 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  36.14 
 
 
108 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  35.8 
 
 
109 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3133  preprotein translocase subunit YajC  44.26 
 
 
86 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4646  protein translocase subunit yajC  36.9 
 
 
94 aa  60.8  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.479824  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3392  preprotein translocase, YajC subunit  39.13 
 
 
127 aa  61.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000230513  hitchhiker  0.00000668456 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  36.47 
 
 
109 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  36 
 
 
110 aa  61.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  44.59 
 
 
112 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4088  preprotein translocase, YajC subunit  39.29 
 
 
91 aa  60.8  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.310824  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  38.55 
 
 
108 aa  60.8  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1728  preprotein translocase, YajC subunit  39.02 
 
 
86 aa  60.5  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.136772  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  35.37 
 
 
117 aa  60.5  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1695  preprotein translocase, YajC subunit  39.02 
 
 
86 aa  60.5  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2030  preprotein translocase, YajC subunit  36.17 
 
 
181 aa  60.5  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000255015 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3817  preprotein translocase subunit YajC  36 
 
 
110 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0436653  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1358  preprotein translocase, YajC subunit  35.37 
 
 
90 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00135815  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2275  preprotein translocase subunit YajC  42.11 
 
 
117 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2314  preprotein translocase subunit YajC  42.11 
 
 
117 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19372  normal  0.374026 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2322  preprotein translocase subunit YajC  42.11 
 
 
117 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.90527  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  37.97 
 
 
127 aa  60.1  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  34.18 
 
 
118 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1458  preprotein translocase, YajC subunit  33.33 
 
 
99 aa  60.1  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000156531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0839  preprotein translocase, YajC subunit  37.93 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00524  preprotein translocase subunit YajC  33.33 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  36.71 
 
 
118 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  32.58 
 
 
168 aa  60.1  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  36.25 
 
 
107 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12870  preprotein translocase, YajC subunit  32.58 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.195332  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  31.4 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  35.64 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2834  protein translocase subunit yajC  33.73 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>