More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6083 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6083  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
360 aa  713    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2038  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  81.1 
 
 
363 aa  523  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.253762  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2062  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  67.23 
 
 
358 aa  462  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.27635  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2144  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  68.18 
 
 
380 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00653947  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  57.77 
 
 
381 aa  362  6e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0982529  normal  0.120585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1732  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  54.24 
 
 
408 aa  358  9.999999999999999e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0544412  decreased coverage  0.000497213 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1266  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  58.77 
 
 
335 aa  315  6e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.227258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5479  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  52.25 
 
 
383 aa  298  8e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.681291 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3165  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.61 
 
 
389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00426594  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2464  ATPase domain-containing protein  47.67 
 
 
342 aa  268  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.731259  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 
546 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
874 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
453 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 
489 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
444 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 
597 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
594 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
597 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 
590 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0443  Signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
475 aa  146  5e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
758 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
718 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  32.17 
 
 
762 aa  143  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
592 aa  143  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 
1319 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
591 aa  142  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1160  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.43 
 
 
829 aa  142  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.380489 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 
815 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0937  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 
534 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0830916  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 
460 aa  140  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 
609 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2551  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 
401 aa  140  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
473 aa  140  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
587 aa  140  4.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  32.75 
 
 
581 aa  139  6e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 
600 aa  139  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 
599 aa  139  7e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
607 aa  139  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 
468 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 
737 aa  138  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.224344 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4365  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
514 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108097  normal  0.083954 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 
701 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 
608 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
608 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 
458 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 
571 aa  138  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 
612 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.18 
 
 
944 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1987  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.49 
 
 
577 aa  137  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
620 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
695 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.69 
 
 
1002 aa  136  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  35.37 
 
 
539 aa  136  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  33.23 
 
 
537 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 
593 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  31.14 
 
 
617 aa  135  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
581 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  32.68 
 
 
581 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0803  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 
365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
590 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  28.12 
 
 
1629 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4104  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.61 
 
 
557 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0461305 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
583 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1579  histidine kinase  29.68 
 
 
583 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3930  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0182336 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 
612 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
590 aa  134  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 
423 aa  134  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 
590 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 
591 aa  134  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 
2161 aa  134  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0065  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
377 aa  134  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 
763 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.508031  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  30.7 
 
 
595 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
641 aa  133  5e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
3470 aa  133  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 
892 aa  133  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0094  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 
621 aa  133  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1083  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.72 
 
 
887 aa  132  6.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.240403  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 
556 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1115  sensor histidine kinase  29.8 
 
 
446 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
484 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 
611 aa  132  9e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
412 aa  132  9e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
584 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.75 
 
 
1064 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 
1043 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 
584 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 
621 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2361  two component sensor histidine kinase  29.81 
 
 
827 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
1021 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
585 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3846  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 
352 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 
646 aa  130  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  31.7 
 
 
591 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 
979 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
639 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.01 
 
 
456 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
639 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>