More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6079 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6079  hypothetical protein  100 
 
 		 420 aa  830    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.533874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1693  major facilitator superfamily MFS_1  54.29 
 
 		 422 aa  385  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00531073  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  38.65 
 
 		 404 aa  253  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1608  hypothetical protein  38.15 
 
 		 404 aa  250  4e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4653  major facilitator superfamily MFS_1  37.09 
 
 		 438 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.689399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4774  major facilitator transporter  35.7 
 
 		 443 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2608  major facilitator superfamily MFS_1  34.88 
 
 		 426 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.669442  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0832  major facilitator superfamily MFS_1  38.96 
 
 		 443 aa  196  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533006  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1719  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 447 aa  196  7e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33800  Major Facilitator Superfamily transporter  36.17 
 
 		 505 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.714924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 		 445 aa  192  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0850  major facilitator superfamily MFS_1  38.08 
 
 		 408 aa  192  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.427056  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3075  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 423 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  34.83 
 
 		 415 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1264  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 		 422 aa  190  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  34.32 
 
 		 422 aa  188  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 428 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0063  major facilitator superfamily protein  34.41 
 
 		 419 aa  173  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.586585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0836  major facilitator superfamily MFS_1  34.27 
 
 		 443 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0261  major facilitator superfamily MFS_1  33.26 
 
 		 438 aa  172  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0905059 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4618  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 426 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  35.27 
 
 		 449 aa  170  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0499  major facilitator superfamily MFS_1  34.01 
 
 		 436 aa  169  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4368  major facilitator superfamily permease  34.06 
 
 		 431 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0513  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 430 aa  168  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000815548 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10460  Major Facilitator Superfamily transporter  33.33 
 
 		 450 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 524 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0425  major facilitator transporter  35.45 
 
 		 430 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4356  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 388 aa  156  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  normal  0.27139 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2356  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 426 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3729  enterobactin exporter EntS  29.98 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.818592  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 415 aa  139  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  30.38 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1861  enterobactin exporter EntS  30.32 
 
 		 443 aa  134  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1327  enterobactin exporter EntS  29.76 
 
 		 424 aa  134  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00590508  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  28.33 
 
 		 424 aa  131  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3197  major facilitator superfamily MFS_1  30.71 
 
 		 427 aa  127  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000392196 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0689  enterobactin exporter EntS  29.65 
 
 		 414 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.38667 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0751  enterobactin exporter EntS  30.17 
 
 		 414 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0424  drug:proton antiporter  29.65 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0705  enterobactin exporter EntS  29.89 
 
 		 414 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.427412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  30.31 
 
 		 415 aa  121  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0632  enterobactin exporter EntS  29.6 
 
 		 414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.314833  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0646  enterobactin exporter EntS  29.6 
 
 		 414 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00558  predicted transporter  29.23 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3035  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0642  enterobactin exporter EntS  29.23 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0611  enterobactin exporter EntS  29.23 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0611  enterobactin exporter EntS  29.23 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0493  enterobactin exporter EntS  29.23 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3053  enterobactin exporter EntS  29.23 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0676  enterobactin exporter EntS  29.23 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.565934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00547  hypothetical protein  29.23 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 406 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 456 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  28.92 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 425 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 416 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  27.63 
 
 		 412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  28.37 
 
 		 421 aa  114  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  26.12 
 
 		 416 aa  113  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1807  hypothetical protein  29.26 
 
 		 553 aa  112  9e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 406 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1123  enterobactin exporter EntS  27.16 
 
 		 415 aa  109  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.115316  normal  0.860817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1952  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  28.08 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 451 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3423  enterobactin exporter EntS  27.37 
 
 		 422 aa  108  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.408147  normal  0.319337 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 421 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2863  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 		 445 aa  107  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 412 aa  106  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  27.59 
 
 		 410 aa  106  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  28.54 
 
 		 412 aa  106  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  28.23 
 
 		 403 aa  106  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 476 aa  106  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 418 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  30.69 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  26.6 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  30.69 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  25.82 
 
 		 452 aa  103  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0363  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 		 455 aa  104  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 424 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 		 442 aa  103  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  27.55 
 
 		 399 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  28.94 
 
 		 429 aa  103  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  26.35 
 
 		 408 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>