More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6024 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  79.21 
 
 
535 aa  844    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  100 
 
 
537 aa  1085    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  54.64 
 
 
542 aa  546  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  55.2 
 
 
538 aa  520  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  50.74 
 
 
542 aa  487  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  48.07 
 
 
545 aa  404  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  38.27 
 
 
569 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  37.07 
 
 
541 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  39.19 
 
 
544 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  30.91 
 
 
574 aa  282  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  36.38 
 
 
576 aa  274  3e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4369  amidohydrolase 3  37.68 
 
 
548 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4750  amidohydrolase 3  37.68 
 
 
548 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4456  amidohydrolase 3  37.68 
 
 
548 aa  272  1e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359354  normal  0.0420903 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  35.4 
 
 
532 aa  267  5e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  34.84 
 
 
564 aa  264  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  33.75 
 
 
573 aa  260  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  36.19 
 
 
569 aa  259  9e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  34.92 
 
 
560 aa  259  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  34.18 
 
 
527 aa  258  2e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  33.82 
 
 
616 aa  250  4e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  33.39 
 
 
564 aa  247  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  33.81 
 
 
580 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3243  amidohydrolase 3  33.4 
 
 
573 aa  246  8e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.262757  normal  0.0106893 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  35.11 
 
 
569 aa  245  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  31.87 
 
 
546 aa  242  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  35.16 
 
 
565 aa  241  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  33.82 
 
 
580 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  30.51 
 
 
550 aa  238  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  30.21 
 
 
585 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  31.34 
 
 
603 aa  237  4e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  33.7 
 
 
553 aa  236  6e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  33.71 
 
 
545 aa  234  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  30.25 
 
 
552 aa  230  6e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  34.1 
 
 
620 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  31.12 
 
 
565 aa  226  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  34.69 
 
 
574 aa  224  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  33.85 
 
 
601 aa  223  4.9999999999999996e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  31.46 
 
 
583 aa  223  8e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  31.26 
 
 
556 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0992  hypothetical protein  31.28 
 
 
583 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  32.98 
 
 
564 aa  221  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  34.4 
 
 
530 aa  221  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  31.39 
 
 
548 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  28.65 
 
 
557 aa  217  4e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  31 
 
 
553 aa  217  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  33.15 
 
 
565 aa  216  7e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  33.63 
 
 
583 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  33.63 
 
 
583 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  30.57 
 
 
613 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  32.12 
 
 
556 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  33.33 
 
 
553 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  33.63 
 
 
543 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  33.47 
 
 
568 aa  212  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  30.21 
 
 
608 aa  210  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  29.5 
 
 
619 aa  209  7e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  32.43 
 
 
606 aa  209  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  34.35 
 
 
579 aa  208  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  31.03 
 
 
583 aa  207  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  32.64 
 
 
522 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  36.05 
 
 
536 aa  207  5e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4740  amidohydrolase 3  31.01 
 
 
589 aa  204  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.185447 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  31.78 
 
 
546 aa  203  7e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.97 
 
 
544 aa  202  9.999999999999999e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  31.83 
 
 
584 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  30.83 
 
 
543 aa  201  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  32.04 
 
 
560 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  32.54 
 
 
554 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  32.84 
 
 
576 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  28.47 
 
 
596 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  29.64 
 
 
537 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  27.47 
 
 
539 aa  196  6e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  29.17 
 
 
543 aa  196  7e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  31.79 
 
 
549 aa  196  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  31.66 
 
 
560 aa  192  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  35.16 
 
 
536 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  33.09 
 
 
544 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2556  Amidohydrolase 3  33.27 
 
 
556 aa  191  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3185  amidohydrolase 3  32.35 
 
 
560 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214251  normal  0.510937 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3204  amidohydrolase 3  26.94 
 
 
580 aa  190  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0492365  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  31.74 
 
 
552 aa  190  7e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0927  amidohydrolase 3  28.44 
 
 
582 aa  190  7e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  31.75 
 
 
543 aa  189  8e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  30.4 
 
 
563 aa  189  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  30.9 
 
 
556 aa  189  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3370  Amidohydrolase 3  29.47 
 
 
558 aa  188  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000202317  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  31.76 
 
 
551 aa  188  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3987  amidohydrolase 3  29.37 
 
 
563 aa  187  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  27.87 
 
 
544 aa  187  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  35.6 
 
 
532 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3862  amidohydrolase 3  29.37 
 
 
563 aa  186  8e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  32.17 
 
 
547 aa  184  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2742  hypothetical protein  32.15 
 
 
531 aa  182  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.166091  hitchhiker  0.000567669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  32.84 
 
 
548 aa  182  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  32.46 
 
 
549 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  29.19 
 
 
555 aa  181  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  27.9 
 
 
533 aa  181  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  30.31 
 
 
550 aa  181  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  33.04 
 
 
540 aa  180  4.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  29.87 
 
 
541 aa  179  9e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>