More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6023 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  100 
 
 
466 aa  931    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  75.27 
 
 
465 aa  698    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  61.83 
 
 
480 aa  556  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  61.54 
 
 
474 aa  551  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  61.9 
 
 
473 aa  551  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  58.39 
 
 
482 aa  524  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  56.48 
 
 
462 aa  492  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  57.89 
 
 
457 aa  486  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  57.02 
 
 
456 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  57.02 
 
 
456 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  56.8 
 
 
456 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  55.89 
 
 
472 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  58.59 
 
 
460 aa  460  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  54.61 
 
 
460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  54.61 
 
 
460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  54.17 
 
 
460 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  49.12 
 
 
466 aa  378  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  48.55 
 
 
463 aa  372  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  46.09 
 
 
472 aa  362  6e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  45.01 
 
 
462 aa  346  6e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  44.62 
 
 
460 aa  341  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  42.96 
 
 
460 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  46.62 
 
 
466 aa  329  6e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  43.84 
 
 
462 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  43.28 
 
 
475 aa  302  9e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  44.32 
 
 
454 aa  299  6e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  41 
 
 
476 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  40.56 
 
 
468 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  40.56 
 
 
475 aa  292  9e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  42.2 
 
 
468 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  40.83 
 
 
468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2675  FAD dependent oxidoreductase  40.68 
 
 
468 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19770  hypothetical protein  42.33 
 
 
468 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3143  FAD dependent oxidoreductase  38.81 
 
 
491 aa  272  9e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3244  FAD dependent oxidoreductase  38.43 
 
 
491 aa  271  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  37.96 
 
 
469 aa  261  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0879  FAD dependent oxidoreductase  38.09 
 
 
491 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3678  hypothetical protein  37.03 
 
 
489 aa  248  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2910  hypothetical protein  38.46 
 
 
493 aa  246  8e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  38.39 
 
 
464 aa  239  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0699  FAD dependent oxidoreductase  36.64 
 
 
456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
459 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  35.19 
 
 
463 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 
464 aa  189  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  34.26 
 
 
463 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  34.26 
 
 
463 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  33.41 
 
 
463 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 
457 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  33.26 
 
 
465 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  34.69 
 
 
470 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  29.77 
 
 
470 aa  176  8e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  34.26 
 
 
496 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  30.57 
 
 
453 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  32.56 
 
 
465 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  31.07 
 
 
462 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  30.51 
 
 
466 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  31.78 
 
 
491 aa  172  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  35.73 
 
 
473 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  30.51 
 
 
473 aa  171  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  33.72 
 
 
480 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04889  FAD dependent oxidoreductase  30.04 
 
 
466 aa  170  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  32.09 
 
 
462 aa  170  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  30.84 
 
 
463 aa  170  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  32.56 
 
 
462 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 
463 aa  167  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 
468 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 
443 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  31.7 
 
 
468 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  29.86 
 
 
464 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  31.54 
 
 
462 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 
462 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  31.22 
 
 
471 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 
521 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 
477 aa  161  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  30.86 
 
 
472 aa  161  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  29.89 
 
 
465 aa  157  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  32.75 
 
 
466 aa  156  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  29.74 
 
 
477 aa  154  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2808  oxidoreductase, putative  30.9 
 
 
455 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.479983  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  26.62 
 
 
428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  28.91 
 
 
464 aa  147  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3646  hypothetical protein  32.71 
 
 
469 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0271589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2743  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  29.61 
 
 
455 aa  146  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0233618  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  29.36 
 
 
470 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  29.91 
 
 
482 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  30.66 
 
 
494 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3223  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 
465 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188463  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  30.38 
 
 
433 aa  142  9e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  29.65 
 
 
463 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 
486 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  29.52 
 
 
465 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0139  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 
464 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412915  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  28.6 
 
 
483 aa  141  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 
486 aa  141  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6396  FAD dependent oxidoreductase  29.75 
 
 
482 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0152469  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5828  FAD dependent oxidoreductase  31.12 
 
 
494 aa  140  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5032  FAD dependent oxidoreductase  31.12 
 
 
494 aa  140  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0622047  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 
431 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  31.12 
 
 
428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0889  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 
487 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>