70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6009 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6009  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  644    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00257584  normal  0.402021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1977  cytochrome oxidase assembly  59.16 
 
 
328 aa  343  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.628163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2217  cytochrome oxidase assembly  57.42 
 
 
351 aa  286  4e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000899528  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1995  putative integral membrane transport protein  49.49 
 
 
351 aa  243  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  48.01 
 
 
386 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2971  cytochrome oxidase assembly  46.3 
 
 
370 aa  237  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  45.48 
 
 
351 aa  215  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16080  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  42.81 
 
 
323 aa  215  9e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3312  cytochrome oxidase assembly  47.87 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000656603 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3085  cytochrome oxidase assembly  47.12 
 
 
326 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0734948  normal  0.300108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2061  cytochrome oxidase assembly  49.83 
 
 
309 aa  206  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.603923  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2430  cytochrome oxidase assembly  41.75 
 
 
325 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424525  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5168  cytochrome oxidase assembly  43.69 
 
 
322 aa  196  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251951  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2378  cytochrome oxidase assembly  41.94 
 
 
337 aa  189  8e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.653771  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1653  cytochrome oxidase assembly  45.09 
 
 
342 aa  188  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  40.75 
 
 
337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2347  cytochrome oxidase assembly  44.66 
 
 
328 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0173507  normal  0.0130822 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2543  cytochrome oxidase assembly  42.61 
 
 
305 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0684946  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1133  cytochrome oxidase assembly  40.73 
 
 
370 aa  167  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3684  cytochrome oxidase assembly  39.39 
 
 
318 aa  162  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189637  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2474  cytochrome oxidase assembly  38.91 
 
 
342 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  40.45 
 
 
313 aa  162  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1666  cytochrome oxidase assembly  40.19 
 
 
348 aa  161  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00799414  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2467  cytochrome oxidase assembly  39.29 
 
 
342 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2429  cytochrome oxidase assembly  38.91 
 
 
342 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2099  cytochrome oxidase assembly  40.75 
 
 
301 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.763514  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0193  cytochrome oxidase assembly  37.28 
 
 
321 aa  159  8e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1353  cytochrome oxidase assembly  43.9 
 
 
320 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13300  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  40.21 
 
 
287 aa  154  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0813876  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2726  cytochrome oxidase assembly  37.87 
 
 
318 aa  152  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2514  cytochrome oxidase assembly  37.6 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787939  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2553  cytochrome oxidase assembly  38.69 
 
 
304 aa  145  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11484  antibiotic ABC transporter membrane protein  36 
 
 
310 aa  144  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.802636 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1841  cytochrome oxidase assembly  38.63 
 
 
314 aa  142  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355712 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1135  cytochrome oxidase assembly  38.31 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11450  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  38.18 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.314019  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14570  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  42.69 
 
 
307 aa  134  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852831  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  36.33 
 
 
331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3264  cytochrome oxidase assembly  39.86 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4285  cytochrome oxidase assembly  30.14 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.367263  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2398  cytochrome oxidase assembly  24.83 
 
 
326 aa  59.7  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04711  hypothetical protein  29.68 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05021  hypothetical protein  29.68 
 
 
308 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1778  cytochrome oxidase assembly protein  27.16 
 
 
323 aa  57  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2479  cytochrome oxidase assembly  29.41 
 
 
311 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0174052  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0446  hypothetical protein  29.66 
 
 
308 aa  55.8  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.552412  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0322  cytochrome oxidase assembly  27.63 
 
 
367 aa  55.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.334167  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  22.9 
 
 
339 aa  54.3  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3469  cytochrome oxidase assembly  25.99 
 
 
342 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05091  hypothetical protein  29.17 
 
 
285 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.150213  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1932  cytochrome oxidase assembly  29.56 
 
 
376 aa  50.4  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0405  cytochrome oxidase assembly  28.67 
 
 
286 aa  49.7  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.56045  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  23.6 
 
 
327 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0371  putative heme O oxygenase (cytochrome aa3-controlling) transmembrane protein  25.81 
 
 
363 aa  47.4  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112806  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0246  cytochrome oxidase assembly  24.54 
 
 
363 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.241407  normal  0.0193794 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06265  hypothetical protein  29.49 
 
 
339 aa  46.6  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0227  cytochrome oxidase assembly  26.15 
 
 
363 aa  45.8  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0296  cytochrome oxidase assembly  23.4 
 
 
354 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300662  normal  0.0109948 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4134  cytochrome oxidase assembly  26.69 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4239  cytochrome oxidase assembly  33.93 
 
 
325 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1637  cytochrome oxidase assembly  24.42 
 
 
373 aa  44.3  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0968838  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0318  cytochrome oxidase assembly  30.21 
 
 
387 aa  43.5  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.14987 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04451  hypothetical protein  29.01 
 
 
288 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.898486  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05011  hypothetical protein  31.67 
 
 
308 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.550155  normal  0.119353 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4338  cytochrome oxidase assembly  26.87 
 
 
363 aa  43.5  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.505216 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0300  cytochrome oxidase assembly  31.33 
 
 
361 aa  43.5  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1459  cytochrome oxidase assembly  26.26 
 
 
337 aa  42.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.494782  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  26.39 
 
 
319 aa  42.7  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0269  cytochrome oxidase assembly  26.12 
 
 
367 aa  42.7  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.840878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1253  cytochrome oxidase assembly  30.15 
 
 
383 aa  42.4  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>