More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5995 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5995  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.261436  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  65.74 
 
 		 243 aa  264  8e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5221  transcriptional regulator, GntR family  58.02 
 
 		 218 aa  222  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31590  transcriptional regulator, GntR family  47.95 
 
 		 244 aa  189  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4720  transcriptional regulator, GntR family  49.04 
 
 		 223 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.866037  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 233 aa  114  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  37.93 
 
 		 233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  36.22 
 
 		 223 aa  108  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2161  GntR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 237 aa  108  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.131694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 244 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  32.68 
 
 		 223 aa  105  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  34.18 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08590  transcriptional regulator  35.53 
 
 		 235 aa  101  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.713725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  39.7 
 
 		 232 aa  99.4  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 235 aa  99  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 234 aa  98.6  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 212 aa  98.6  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 230 aa  98.2  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 233 aa  98.2  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 232 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 219 aa  98.2  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 235 aa  96.3  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 233 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 233 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 233 aa  95.9  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 222 aa  95.5  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 222 aa  95.1  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 		 212 aa  94.7  9e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0958  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 248 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208617  normal  0.334799 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.36 
 
 		 228 aa  92.4  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 233 aa  91.7  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  29.9 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 241 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 229 aa  89  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 235 aa  88.6  7e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 229 aa  88.6  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 241 aa  88.6  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 211 aa  88.2  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  36.09 
 
 		 233 aa  87.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1252  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.148319  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 211 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0471  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 221 aa  85.9  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.915136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  31.55 
 
 		 233 aa  85.9  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 234 aa  85.5  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 		 227 aa  85.9  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 227 aa  85.9  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 231 aa  85.9  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 232 aa  85.9  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 232 aa  85.1  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 211 aa  85.1  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 234 aa  84.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 234 aa  84.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4045  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56731  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  29.78 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5281  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.14 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1881  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0450  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1511  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>