More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5991 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
302 aa  597  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  79.67 
 
 
308 aa  475  1e-133  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  80.87 
 
 
308 aa  471  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  66.23 
 
 
309 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  66.99 
 
 
313 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  66.55 
 
 
388 aa  375  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  63.49 
 
 
312 aa  371  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  68.38 
 
 
374 aa  367  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  61.04 
 
 
308 aa  361  9e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  60.91 
 
 
308 aa  355  5.999999999999999e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  61.15 
 
 
310 aa  348  6e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  61.15 
 
 
310 aa  348  7e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  61.15 
 
 
310 aa  348  7e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  59.02 
 
 
309 aa  346  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  61.56 
 
 
319 aa  346  3e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  61.18 
 
 
338 aa  341  9e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  57.1 
 
 
314 aa  329  4e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  60.47 
 
 
313 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.1 
 
 
304 aa  319  3e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  60.6 
 
 
334 aa  312  4.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  53.57 
 
 
310 aa  300  3e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  52.79 
 
 
315 aa  294  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  49.19 
 
 
311 aa  275  9e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  51.78 
 
 
299 aa  272  5.000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2342  ABC transporter related  51.56 
 
 
319 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1668  ABC transporter related protein  54.66 
 
 
329 aa  261  6.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0326508  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1843  ABC transporter related  46.73 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163971 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2101  ABC transporter related  47.35 
 
 
322 aa  252  6e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  44.85 
 
 
300 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  45.7 
 
 
306 aa  238  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  46.71 
 
 
302 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  45 
 
 
302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  44.52 
 
 
303 aa  232  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  41.5 
 
 
305 aa  225  8e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  45.48 
 
 
299 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  40.85 
 
 
305 aa  221  8e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  40.52 
 
 
305 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  39.27 
 
 
305 aa  219  5e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  36.36 
 
 
308 aa  219  5e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  44.74 
 
 
305 aa  218  1e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  38.94 
 
 
301 aa  217  2e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  44.82 
 
 
314 aa  216  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  44.88 
 
 
330 aa  214  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  44.48 
 
 
331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  42.21 
 
 
301 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14590  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.15 
 
 
331 aa  211  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.294178  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  43 
 
 
301 aa  210  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  46.15 
 
 
301 aa  208  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  42.23 
 
 
285 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  37.95 
 
 
304 aa  206  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  42.95 
 
 
322 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  42.21 
 
 
314 aa  205  9e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  45.67 
 
 
317 aa  203  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  48.15 
 
 
301 aa  203  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  40.82 
 
 
284 aa  202  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.37 
 
 
313 aa  202  8e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  35.64 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  41.38 
 
 
290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  43.66 
 
 
254 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  41.03 
 
 
282 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  49.77 
 
 
237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  41.23 
 
 
319 aa  199  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  49.05 
 
 
280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  40.2 
 
 
322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  45.64 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  42.33 
 
 
326 aa  196  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  41.14 
 
 
302 aa  196  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
310 aa  193  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  36.51 
 
 
310 aa  192  4e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  41.86 
 
 
294 aa  193  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  39.04 
 
 
256 aa  191  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.2 
 
 
321 aa  191  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160218  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  37.83 
 
 
326 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  35.53 
 
 
295 aa  187  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  44.8 
 
 
284 aa  185  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  37.3 
 
 
312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  37.1 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  37.24 
 
 
353 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.38 
 
 
286 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.62 
 
 
337 aa  183  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  39.93 
 
 
333 aa  183  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  38.19 
 
 
298 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  40.55 
 
 
276 aa  183  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3107  ABC transporter related protein  44.19 
 
 
323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6786  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.49 
 
 
322 aa  182  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00659712  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  37.17 
 
 
339 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  37.26 
 
 
310 aa  181  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0214  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.59 
 
 
312 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2471  ABC transporter related protein  42.14 
 
 
302 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0608955  hitchhiker  0.00400758 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  46.02 
 
 
289 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  46.64 
 
 
324 aa  179  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  41.28 
 
 
300 aa  179  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0040  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.86 
 
 
321 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1202  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.85 
 
 
315 aa  179  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.798744  normal  0.0328977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.23 
 
 
319 aa  179  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  37.3 
 
 
306 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  37.5 
 
 
310 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  38.26 
 
 
310 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  44.05 
 
 
303 aa  178  8e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0747  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.42 
 
 
345 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>